Forskningsassistent fylogenetisk analys
Uppsala universitet, Institutionen för medicinska vetenskaper / Kemiingenjörsjobb / Uppsala
Observera att sista ansökningsdag har passerat.
Visa alla kemiingenjörsjobb i Uppsala,
Östhammar,
Sigtuna,
Österåker,
Håbo eller i
hela Sverige Visa alla jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för medicinska vetenskaper i Uppsala,
Solna eller i
hela Sverige Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 46.000 studenter, 7.300 anställda och en omsättning på 7,3 miljarder kronor.
Institutionen för medicinska vetenskaper är en stor klinisk institution med ca 250 anställda och över 300 personer som är anknutna via Akademiska Sjukhuset.
Institutionen har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inom en rad områden. Forskningen äger rum i nära anslutning till den kliniska verksamheten vid Akademiska sjukhuset och omfattar såväl grundläggande studier kring sjukdomsorsaker som utveckling och utvärdering av förbättrad diagnostik och nya behandlingsmetoder. Mer om institutionens verksamhet finns på
www.medsci.uu.se.Projektbeskrivning/Arbetsuppgifter: Du kommer att ingå i ett projekt som fokuserar på fylogenetisk analys av bakterien Campylobacter hos vilda fåglar. Specifikt kommer du att undersöka släktskap mellan C. jejuni från utegående kycklingar och de från vilda fåglar för att studera spridningsmönster av bakterien mellan arter. Du kommer även att jobba med fylogenetisk analys av det operon som styr uttryck av lipooligosaccharider (LOS) på bakteriens yta för att undersöka hur det varierar med värdart för bakterien. Du kommer dessutom att jobba med mikrobiologisk och fylogenetisk analys av bakterien C. subantarcticus.
Kvalifikationskrav: Masterexamen inom biologi eller motsvarande. För arbetet krävs goda kunskaper inom sekvenshantering och fylogenetisk analys och god erfarenhet av programvara och databaser för detta såsom, Prokka, Roary och RAxML och databasen Bacterial Isolate Genome Sequence database (BIGSdb). Utöver detta krävs även goda kunskaper i UNIX för hantering av skript och effektiv länkning av analyser. Projektet innebär odling, DNA extraktion och sekvensering av C. subantarcticus varför vana vid mikrobiologiskt arbete med Campylobacter är ett krav. Du skall även sammanställa ditt arbete i ett antal forskningsrapporter och därför krävs goda teoretiska bakgrundskunskaper om Campylobacter i allmänhet och C. jejuni och C. subantarcticus i synnerhet, samt god förmåga att skriva vetenskaplig text på engelska.
Detta projekt kommer ske i tätt samarbete med projektledaren och därför fästes stor vikt vid personliga kvalifikationer såsom samarbetsförmåga, flexibilitet och kommunikation.
Meriterande i övrigt: Då den fylogenetiska analysen av Campylobacter kommer att kopplas till fåglar som värdart och deras fysiologi och ekologi, är goda kunskaper om vilda fåglar starkt meriterande. Meriterande är även vana vid arbete med C. subantarcticus.
Lön: Individuell lönesättning tillämpas
Tillträde: Enligt överenskommelse
Anställningsform: Tidsbegränsad anställning t.o.m. 2020-10-21
Anställningens omfattning: 100 %
Upplysningar om anställningen lämnas av: Docent Patrik Ellström.
Patrik.ellstrom@medsci.uu.seVälkommen med din ansökan senast den 4 maj, 2020, UFV-PA 2020/1440.
Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.
Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.
Varaktighet, arbetstid
100. Tillträde: Enligt ök Visstidsanställning till 2020-10-21
Publiceringsdatum2020-04-23ErsättningFast lön
Så ansöker duSista dag att ansöka är 2020-05-04
Klicka på denna länk för att göra din ansökanFöretagUppsala universitet, Institutionen för medicinska vetenskaper
Arbetsgivarens referens Arbetsgivarens referens för detta jobb är "UFV-PA 2020/1440".
Omfattning Detta är ett heltidsjobb.
Arbetsgivare Uppsala Universitet (org.nr 202100-2932)
Arbetsplats Uppsala universitet, Institutionen för medicinska vetenskaper
Jobbnummer 5200070
Observera att sista ansökningsdag har passerat.