1-2 postdoktorer inom beräkningsbiologi och medicin
Umeå universitet, Medicinska fakulteten / Kemiingenjörsjobb / Umeå
2025-01-23
Visa alla kemiingenjörsjobb i Umeå,
Vännäs,
Nordmaling,
Vindeln,
Robertsfors eller i
hela Sverige Visa alla jobb hos Umeå universitet, Medicinska fakulteten i Umeå,
Örnsköldsvik,
Skellefteå,
Luleå,
Sundsvall eller i
hela Sverige Umeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med över 37 000 studenter och cirka 4 700 anställda. Vid universitetet finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden, och här gjordes den banbrytande upptäckten av gensaxen CRISPR-Cas9 som tilldelats Nobelpriset i kemi. Vid Umeå universitet är allt nära. Våra sammanhållna campus gör det lätt att mötas, samarbeta och utbyta kunskap, något som gynnar en dynamisk och öppen kultur.
Den samhällsomvandling och de stora gröna investeringar vi ser i norra Sverige skapar enorma möjligheter och komplexa utmaningar. För Umeå universitet handlar det om att bedriva forskning om - och mitt i - ett samhälle i omvandling. Men också om att leverera utbildningar för regioner som behöver expandera fort och hållbart. Det är helt enkelt här framtiden skapas.
Är du intresserad av att veta mer?
https://www.umu.se/jobba-hos-oss/om-universitetet-som-arbetsplats/Medicinska fakulteten är en av de största fakulteterna vid Umeå universitet och attraherar många studenter med ett omfattande utbud av utbildningar inom områdena medicin, tandvård, hälsa och vård. Vi erbjuder en väl utvecklad forskningsinfrastruktur och en inspirerande, dynamisk miljö med ledande forskning. Vår nära samverkan med de fyra regionerna i Norra sjukvårdsregionen ser vi som en stor ömsesidig tillgång för att utveckla forskning och utbildning och att säkra tillgången på vår framtids vårdpersonal.
Institutionen för medicinsk biovetenskap vid Umeå universitet söker nu en till två postdoktorer inom beräkningsbiologi och medicin.
Det finns flera forskningsprojekt i vår forskargrupp vid Institutionen för medicinsk biovetenskap, Umeå universitet. Forskargruppen är ansluten till SciLifeLab och är en del av det nationella programmet för datadriven livsvetenskap (DDLS), generöst finansierat av Knut och Alice Wallenbergs Stiftelse. Vår forskning fokuserar på användning av maskininlärning och AI-verktyg samt mer klassiska men storskaliga ekvationsbaserade mekanistiska beräkningsmodeller tillsammans med patientdata för att skapa kliniskt prediktiva beräkningsmodeller för cancer och andra sjukdomar.
Projektbeskrivning
Det övergripande temat för Erdem Lab är att sammanföra maskininlärning och mekanistiska modeller med patientdata för att skapa kliniskt prediktiva beräkningsmodeller. Därför finns det flera projekt att genomföra:
Projekt 1: Integration av multi-omikdata med hjälp av maskininlärning för att generera nya, datadrivna och kontextspecifika associationsnätverk och signalvägar. Se här för en referensartikel från vårt arbete.
Projekt 2: Vidareutveckling och användning av vår egen pipeline för storskalig konstruktion av mekanistiska modeller för att träna personliga beräkningsmodeller för att studera in-silico kliniska interventionsstrategier. Se här för en referensartikel från vårt arbete.
Projekt 3: Kombinera delar och verktyg från Projekt 1 och Projekt 2 för att härleda kausalitet bland korrelativa associationer som förutsägs av det förstnämnda. Se här för en referensartikel från vårt arbete.
Publiceringsdatum2025-01-23Dina arbetsuppgifterProjekten innefattar att hämta och analysera multi-omikdatamängder från cellinjer eller tumörprover, antingen offentligt tillgängliga eller genererade av våra samarbetspartners. I enlighet med FAIR och reproducerbara forskningsprinciper inkluderar uppgifterna bioinformatiska analyser i lokala och nationella högpresterande datorkluster. Baserat på kandidaternas erfarenhet och önskemål kan alla projekt inkludera experimentella (våtlaboratorie) uppföljningar och valideringar. Uppgifterna inkluderar också litteratursökningar, sammanställning av resultat och utarbetande av manuskript. Att delta i och leda gruppmöten ingår också.
Behörighet
Behörig att anställas som postdoktor är den som avlagt doktorsexamen, eller utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen inom omvårdnad/hälsovetenskap/medicin eller liknande. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas.
Du är skicklig i omikdataanalyser och bioinformatik och har erfarenhet av att arbeta med och driva tvärvetenskapliga projekt. Du behärskar ett eller flera programmeringsspråk (R, MATLAB eller Python). Baserat på projektmatchning krävs erfarenhet av PK/PD och ODE-baserad modellering eller statistik och maskininlärning. Grundläggande erfarenhet av laboratoriearbete och cellodling är också meriterande. Goda muntliga och skriftliga kunskaper i engelska är ett krav.
Meriterande
Eftersom anställning som postdoktor utgör en meriteringsanställning för juniora forskare, riktar vi oss främst till den som har en doktorsexamen som inte är äldre än tre år räknat från sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan den komma i fråga som avlagt doktorsexamen tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, klinisk tjänstgöring, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer eller andra liknande omständigheter, samt för ämnesområdet relevant tjänstgöring/uppdrag.
Mer om anställningen
Anställningen är en visstidsanställning på heltid på två (2) år enligt villkor i avtal om tidsbegränsad anställning som postdoktor från 1 april 2025 eller enligt överenskommelse. Arbetsort är Umeå universitet.
Så ansöker duAnsökan ska innehålla följande delar:
En kort beskrivning (ca en A4) av tidigare forskningserfarenhet, forskningsintressen och motivering till varför du är intresserad av anställningen.
Meritförteckning/CV
Examensbevis från forskarutbildning samt andra relevanta examina.
Publikationslista
Kontaktinformation till två tillfrågade referenspersoner (emailadress, telefonnummer med landskod och postadress).
Ansökan ska vara skriven på engelska. Den ska göras via vårt e-rekryteringssystem Varbi och vara inkommen senast den 16 februari 2025.
Om du har några frågor eller funderingar, vänligen kontakta Dr. Cemal Erdem (
cemal.erdem@umu.se).
Välkommen med din ansökan!
Umeå universitet vill erbjuda en jämställd och jämlik miljö där öppna samtal mellan människor med olika bakgrund och perspektiv lägger grunden för lärande, skaparkraft och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och erfarenheter att söka den aktuella anställningen.
Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser.
Ersättning Månadslön
Så ansöker du Sista dag att ansöka är 2025-02-16
Klicka på denna länk för att göra din ansökan Arbetsgivarens referens Arbetsgivarens referens för detta jobb är "AN 2.2.1-67-25".
Omfattning Detta är ett heltidsjobb.
Arbetsgivare Umeå Universitet (org.nr 202100-2874)
Arbetsplats Umeå universitet, Medicinska fakulteten
Jobbnummer 9121303