Postdoktor i Metagenomik och bioinformatik

Lunds Universitet / Skogsjobb / Lund
Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Visa alla skogsjobb i Lund, Lomma, Staffanstorp, Burlöv, Kävlinge eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Lunds Universitet i Lund, Malmö, Höör, Klippan, Helsingborg eller i hela Sverige

Ämne/Ämnesbeskrivning: Metagenomik och bioinformatik
Målet med projektet är att utveckla nya metoder som kan identifiera funktionell diversitet av kolnedbrytande enzymer hos mikroorganismer i jordbruksmark. Projektet fokuserar på att karakterisera metagenom av kolnedbrytande enzymer i mark, för att identifiera de viktigaste komponenterna bakom kollagring och nedbrytning i mark. Idag finns det ny teknik som gör det möjligt för oss att identifiera många fler arter av mikroorganismer än tidigare, genom att effektivt sekvensera arvsmassa (DNA) selektivt via s.k. Sequence Capture. Den nya tekniken innebär att vi kan analysera sekvenser från mikroorganismer och även de gener som styr funktioner (t.ex. enzymer), på ett sätt som gör det möjligt att studera detta i naturliga marksystem och inte bara i laboratoriet. Vi kommer också att kunna se hur mångfald bland svampar och bakterier är länkat till de funktioner som används vid nedbrytning av kolföreningar och rester av växter och djur. Vi söker nu en postdoktor som ska arbeta med bioinformatik och metagenomik i projektet. Den kommer att arbeta med data från molekylära metoder baserade på 454 sekvensering för att bestämma mångfald av mikroorganismer i marken. En viktig del av arbetet är att gör metagenomiska sekvensanalyser av funktionella gener för att förstå hur mikrobiell biodiversitet påverkar jordbruksekosystem.
Projektet syftar till att utveckla sequence capture metoden för att studera biodiversitet och funktionell diversitet , främst kolmetabolism, i mark.Identifiera gener som är aktivt involverade I kolcykeln med hjälp av sequence capture följt av pyrosekvensering. Analysera metagenomdata från jordbruksmark för att identifier de mikroorganismer som är involverade I kolcykeln.
Vi söker en post doktor som ska arbeta i ett av Formas finansierat forskningsprojekt som även ingår i 2 storskaliga forskningsprojekt, SoilService ( http://www.kem.ekol.lu.se/soilservice/index.html) och BECC ( http://www.cec.lu.se/o.o.i.s/24960) . Den kommer att arbeta inom en del av en forskningsgrupp som arbetar med metagenomik, bioinformatik och funktionell diversitet i marken. Institutionen för Biologi har en god infrastruktur för molekylära arbeten och har även utrustning för sekvensiering .
Behörig är den som inom ett relevant ämnesområde har avlagt doktorsexamen eller har en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen. En person som innehar en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen är behörig att anställas. Prioritet ges till sökande som har avlagt examen högst tre år före ansökningstidens utgång om inte särskilda skäl finns, t.ex. dokumenterat ledighet på grund av sjukdom eller föräldraledighet.
Den sökande ska ha en doktorsexamen i bioinformatik, molekylär biologi eller liknande ämnesområde samt med erfarenhet från naturliga system, gärna markekologi. Meriterande är att ha arbetat med metagenomik/ bioinformatik och därigenom hanterat stora datamängder från naturliga system, men även erfarenhet av genomik och transkriptom analyser är relevanta. God förmåga att planera egna studier, noggrannhet, samt att sätta sig in i relevant ekologisk teori är viktiga egenskaper. Erfarenhet av databaser som tex MySOL och användning av webbaserade databaser samt programmering i Perl är ytterligare meriter. Goda kunskaper, skriftliga såväl som muntliga, i engelska är nödvändiga. Sökanden skall kunna arbeta både enskilt och i grupp. De viktigaste kriterierna för bedömning av sökande är vetenskaplig kompetens, där vetenskapliga publikationer inom området är viktigt.

Publiceringsdatum
2011-06-30

Arbetstider och omfattning
Visstidsanställning 6 månader eller längre
Heltid
Tidsbegränsad anställning, två år.

Tillträde
Snarast

Ersättning
Fast lön

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2011-08-15
För mer information om ansökningsförfarandet se: Ansökan sker via företagets webbplats. .
Lunds universitet eftersträvar en jämn könsfördelning och ser mångfald som en styrka. Vi välkomnar alla sökande.
Universitetet tillämpar individuell lönesättning. Ange gärna löneanspråk i din ansökan.
Ange följande referens när du ansöker: Diarienummer: NPA 2011/371
Ansökan kan tyvärr inte göras via e-post.

Kontakt
Katarina Hedlund, Professor: +46 (0)46 222 3798, katarina.hedlund@biol.lu.se
Dag Ahrén, Forskningsingenjör: +46 (0)46-222 39 95, dag.ahren@biol.lu.se
Tina Nilsson, personaladministratör: +46 (0)46 222 02 85, tina.nilsson@biol.lu.se

Facklig kontakt
SACO: Anneli Carlsson: 046 -222 42 52, Anneli.Carlsson@busilaw.lu.se
OFR/S: Lena Thiman: 046-222 77 96, Lena.Thiman@med.lu.se

Företag
Lunds Universitet

Adress
Lunds Universitet
Box 117
22100 LUND

Kontaktuppgifter
Telefonnummer: 046-2220000
E-postadress: lu@lu.se

Jobbnummer
976053

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Postdoktor i Metagenomik och bioinformatik

Prenumerera på jobb från Lunds Universitet