Forskare till SNP&SEQ-teknologiplattformen, Uppsala universitet

Uppsala universitet, Institutionen för medicinska vetenskaper / Biologjobb / Uppsala
Observera att sista ansökningsdag har passerat.


Visa alla biologjobb i Uppsala, Östhammar, Sigtuna, Österåker, Håbo eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för medicinska vetenskaper i Uppsala, Solna eller i hela Sverige

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 42.000 studenter, 7.000 anställda och en omsättning på 6,7 miljarder kronor.



Som en del av den nationella infrastrukturen för genomik (National Genomics Infrastructure, NGI) vid Science for Life Laboratory (SciLifeLab, www.

scilifelab.se) erbjuder SNP&SEQ-teknologiplattformen SNP-genotypning och DNA-sekvensering (Next generation sequencing, NGS) som service åt forskare i och utanför Sverige (www.sequencing.se). Sekvenseringsinstrumenten i verksamheten inkluderar Illuminas iSeq, MiSeq, HiSeq2500, HiSeqX och NovaSeq-system.

Vill du jobba inom ett område med mycket snabb teknologi- och applikationsutveckling? Som forskare vid SNP&SEQ-teknologiplattformen jobbar du tillsammans med andra forskare, projektkoordinatorer, forskningsingenjörer och bioinformatiker i en dynamisk och kreativ atmosfär i ett av Europas största sekvenseringscenter.

Arbetsuppgifter: Arbetet som forskare innebär att vara en länk mellan forskning och utvecklingsenheten (FoU) och den ackrediterade produktionsverksamheten vid SNP&SEQ-teknologiplattformen, NGI-Uppsala.

En viktig del i arbetet kommer att bestå av att tillsammans med etablerade och nya användare identifiera behov av service inom nya NGS-tillämpningar, samt att delta i utvärderingen av nya applikationer både laborativt och bioinformatiskt. Den forskare som anställs kommer att ha en viktig roll vid överföring av nya metoder till produktionsverksamheten och att informera användare om de nya metodernas möjligheter. I arbetsuppgifterna ingår omvärldsbevakning av applikationer och teknologier för NGS för att identifiera nyheter för utvärdering och etablering i verksamheten. I arbetet med att utvärdera nya metoder ingår att skriva vetenskapliga rapporter/publikationer. Undervisning, max 20%, förekommer liksom utbildnings- och marknadsföringsaktiviteter, samt föreläsningar om sekvenseringsteknologier och verksamhetens service.

I arbetet ingår även att bistå projektkoordinatorerna i verksamheten genom att hålla planeringsmöten för nya projekt och planera projekten tillsammans med uppdragsgivare. I arbetsuppgifterna ingår en kontinuerlig kontakt med uppdragsgivare om status i deras projekt, rapportering av resultat och fakturering.

Kvalifikationskrav: Doktorsexamen i medicinska vetenskaper med inriktning mot molekylär medicin, molekylär genetik eller liknande samt minst tre års dokumenterad erfarenhet inom genomik och/eller cancerdiagnostik.

Mycket goda kunskaper i genomteknologi och erfarenhet av nästa generations sekvensering (NGS) med fokus på Illuminasystem är ett krav, liksom erfarenhet från experimentellt arbete med DNA, RNA och biblioteksberedning för sekvensering med instrument från Illumina. Laborativ och bioinformatisk erfarenhet av linked-read sekvensering med Chromiumsystemet (10x Genomics) är ett krav. Gedigen bakgrund i hantering av stora dataset i linuxmiljö, såsom analys av RNA-seqdata från NGS och data från DNA-metyleringsarrayer, inklusive dokumenterad kunskap inom programmering (särskilt Bash/R) för dataanalys är ett krav. Erfarenhet av arbete i ackrediterad miljö. Mycket goda kunskaper i svenska och engelska i tal och skrift ett krav då verksamhetens dokumentation och kommunikation sker på dessa språk.

Vi söker en person som är noggrann, flexibel, utåtriktad, ansvarskännande samt har god initiativ- och problemlösningsförmåga och är bekväm med att arbeta både självständigt och i grupp. Stor vikt kommer att läggas vid personliga egenskaper såsom positiv attityd till serviceverksamhet och god samarbetsförmåga.

Önskvärt och meriterande i övrigt: Erfarenhet av andra NGS-applikationer som tex. ChIP-seq, samt arbete med analys av data från SNP-genotypningsarrayer. Vi ser det även som meriterande att den sökande har erfarenhet av analysarbete för RNA-seq och specifikt analys av fusionsgener.

Lön: Individuell lönesättning.

Tillträde: Snarast.

Anställningsform: Tidsbegränsad anställning, två år.

Anställningens omfattning: 100%

Upplysningar om anställningen ges av Ulrika Liljedahl (ulrika.liljedahl@medsci.uu.se), eller Ann-Christine Syvänen (Ann-Christine.Syvanen@medsci.uu.se).

Välkommen med din ansökan senast den 3 januari 2019, UFV-PA 2018/4458.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Varaktighet, arbetstid
100%. Tillträde: Snarast Visstidsanställning

Publiceringsdatum
2018-12-20

Ersättning
Fast lön

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2019-01-03
Ange följande referens när du ansöker: UFV-PA 2018/4458
Klicka på denna länk för att göra din ansökan

Företag
Uppsala universitet, Institutionen för medicinska vetenskaper

Adress
Uppsala universitet, Institutionen för medicinska vetenskaper
Box 256
75105 Uppsala

Kontorsadress
Box 256

Jobbnummer
4522961

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Prenumerera på jobb från Uppsala universitet, Institutionen för medicinska vetenskaper

Fyll i din e-postadress för att få e-postnotifiering när det dyker upp fler lediga jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för medicinska vetenskaper: