Forskare till Enheten för populationsanalys och -övervakning
Naturhistoriska Riksmuseet / Kemiingenjörsjobb / Stockholm
2025-02-10
Visa alla kemiingenjörsjobb i Stockholm,
Solna,
Lidingö,
Sundbyberg,
Danderyd eller i
hela Sverige Visa alla jobb hos Naturhistoriska Riksmuseet i Stockholm,
Umeå eller i
hela Sverige Naturhistoriska riksmuseet är en statlig myndighet med regeringens uppdrag att främja kunskapen, forskningen och intresset för vår värld. Myndigheten är en framstående forskningsinstitution och Sveriges största museum. Museet har under mer än 200 år samlat in föremål och data och bedrivit forskning om livet på jorden. Samlingarna innehåller fler än 11 miljoner växter, djur, svampar, miljöprover, mineral och fossil. All forskning och kunskap delas i utställningarna, Cosmonova och i aktiviteter på museet och digitalt.
Enheten för populationsanalys och övervakning utför uppdrag åt ett flertal myndigheter och organisationer. Enheten består av flera arbetsgrupper som utför dels övervakning av marina och terrestra däggdjur och dels genomför ett stort antal genetiska analyser. Enheten bedriver forskning och övervakning av tumlare och säl på uppdrag av Havs och vattenmyndigheten och övervakning av björn, kungsörn och fjällräv på uppdrag av Naturvårdsverket. De genetiska analyserna utförs av Centrum för Genetisk identifiering (CGI) åt ett flertal olika aktörer inom natur- och miljövård och inbegriper en mängd olika frågeställningar.
Till enheten söker vi nu en forskare till arbete med analys av genomiska data från sill inom ett FORMAS-projektet.
Publiceringsdatum2025-02-10ArbetsuppgifterProjektets huvudsakliga arbetsuppgift är att bearbeta och analysera ~300 historiska (dvs. 150-1000 år gamla) och ca 4000 publicerade moderna sillgenom för att bedöma deras anpassningsbara svar på havsuppvärmningen i Nordsjön och Östersjön (
https://nicolasdussex.wixsite.com/ndevol/research). Databehandlingen kommer att omfatta användning av bioinformatiska verktyg och pipelines som lämpar sig för gamla DNA-data, vilket gör det möjligt att undersöka eller korrigera för DNA-skador (t.ex. PMDtools, Generode), samt användning av sannolikhetsmetod (t.ex. ANGSD) för att ringa SNP igenom med låg täckning. Dataanalyserna kommer att omfatta analyser av genetisk differentiering bland historiska och moderna populationer med hjälp av faktoranalyser (FA) för neutrala och icke-neurala markörer. Den framgångsrika kandidaten kommer också att undersöka tidsförskjutningar i kända alleler som ligger till grund för ekologisk anpassning (Han et al. 2020; Elife) med hjälp av genomskanningar och upptäckt av avvikande loci (t.ex. FST). Slutligen kommer projektet att omfatta modellering av framtida utbredning (t.ex. Maxent) med hjälp av nuvarande och framtida miljövariabler och aktuella data om förekomst av sill samt genomiska simuleringar (t.ex. SLIM) för att bedöma sillens framtida utbredning och genomiska svar på havsuppvärmningen och därmed sammanhängande förändringar i miljöförhållandena. Kandidaten förväntas sedan förbereda manuskript för publicering i internationella tidskrifter med hög genomslagskraft.
Även om allt laboratoriearbete kommer att utföras och slutföras av en laboratorietekniker vid anställningens början, kommer det att finnas möjligheter att få erfarenhet av forntida/historiskt DNA-laboratoriearbete, inklusive DNA-extraktioner från historiskt/förflutet sillmaterial (t.ex. fenklipp, ben) och beredning av WGS-bibliotek med hjälp av lämpliga protokoll för nedbrutet DNA.
Den framgångsrika kandidaten kommer uppmuntras att utveckla sina egna forskningsidéer och att ansöka om egen finansiering (t.ex. EMBO, Marie Curie-åtgärder, Vetenskapsrådet, Formas) för att bygga vidare på detta projekt eller sina egna projekt, med hjälp av huvudforskaren intendet (Dr. Nicolas Dussex).
KvalifikationerDoktorsexamen i evolutionsbiologi, molekylär ekologi, genetik eller bioinformatik är ett krav. Erfarenhet av bearbetning av stora moderna och forntida/historisk genomiska dataset med hjälp av bioinformatiska pipelines och erfarenhet av populationsgenomiska analyser (PCA, urvalstester, identifiering av varianter) är krav. Likaså är erfarenhet av att hantera helgenomsdataset (WGS) och av populations genomiska analyser krav.
Erfarenhet av simuleringar med genominformation (t.ex. SLiM) och modellering av artfördelning (SDM) är meriterande. Även erfarenhet av laboratoriearbete med gammalt DNA, DNA-extraktion och förberedelse av bibliotek från sillben är meriterande.
Goda kunskaper i engelska i både tal och skrift är ett krav, liksom goda kunskaper i svenska eller annat skandinaviskt språk är meriterande.
Du planerar, organiserar och prioriterar ditt arbete på ett effektivt sätt och bygger strukturer som även andra kan arbeta utifrån. Du sätter upp och håller tidsramar. Du identifierar, hanterar och följer upp detaljer i arbetet och utför arbetsuppgifter på ett grundligt sätt. Du uppmärksammar andras synpunkter och kompetenser på ett sätt som gynnar helheten. Du bidrar till att förtydliga för gruppen dess arbetsuppgifter och på ett sätt som gynnar helheten samt utvecklar relationer. Du delar med dig av din kunskap.
ÖVRIGT
Vårt mål är att genom forskning och publik verksamhet visa vägen till ökad kunskap och handlingskraft, för att vi tillsammans ska kunna bidra till en hållbar och ljus framtid. Vår långsiktiga strävan är att Naturhistoriska riksmuseets anställda ska spegla den mångfald som finns i Sverige. Vi välkomnar alla sökanden oavsett kön, bakgrund, ursprung och funktionsvariation.
Inför rekryteringsarbetet har vi tagit ställning till rekryteringskanaler och marknadsföring. Vi undanbeder oss därför kontakt med mediesäljare, rekryteringssajter och liknande.
Ersättning Enligt avtal.
Så ansöker du Sista dag att ansöka är 2025-02-28
Klicka på denna länk för att göra din ansökan Arbetsgivarens referens Arbetsgivarens referens för detta jobb är "46-2025".
Omfattning Detta är ett heltidsjobb.
Arbetsgivare Naturhistoriska Riksmuseet (org.nr 202100-1124)
Arbetsplats Naturhistoriska riksmuseet
Kontakt Intendent
Nicolas Dussex, Intendent
nicolas.dussex@nrm.se 08-519 541 Jobbnummer 9154067