Forskare inom sömn och metabolism
Uppsala universitet, Institutionen för medicinska vetenskaper / Biomedicinjobb / Uppsala
2024-06-20
Visa alla biomedicinjobb i Uppsala,
Östhammar,
Sigtuna,
Österåker,
Håbo eller i
hela Sverige Visa alla jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för medicinska vetenskaper i Uppsala,
Solna eller i
hela Sverige Forskare inom sömn och metabolism
Bioinformatiska analyser blir allt viktigare inom så kallad precisionsmedicin, som kan möjliggöra utveckling av skräddarsydda diagnostiska verktyg och behandlingar.
Dessa framsteg är baserade på stora datatyper. Vi utforskar detta inom området sömn- & dygnsrytmsstörningar, för att förstå deras betydelse för neurokognitiva och metabola sjukdomar. För detta kombinerar vi populationsstudier och avancerade interventionsstudier, för att kunna kartlägga nya betydelsefulla mekanismer.
Institutionen för medicinska vetenskaper är en stor klinisk institution med ca 250 anställda och över 900 personer som är anknutna via Akademiska Sjukhuset. Institutionen har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inom en rad områden. Forskningen äger rum i nära anslutning till den kliniska verksamheten vid Akademiska sjukhuset och omfattar såväl grundläggande studier kring sjukdomsorsaker som utveckling och utvärdering av förbättrad diagnostik och nya behandlingsmetoder. Mer om institutionens verksamhet finns på
http://www.medsci.uu.seAnställningen är på 12 månader och kommer att genomföras vid enheten för transplantation och regenerativ medicin.
Projektet avser att utnyttja systembiologi och precisionsmedicin för att utveckla innovativa diagnostiska verktyg, biomarkörer och kliniska interventioner fokuserade på livsstilsfaktorer som sömn, kost och träning. Interventionsstudierna kommer att fokusera på hur sömn- och livsstilsfaktorer samspelar för att påverka välbefinnande, kognition och ämnesomsättningen. Ett av delmålen kommer att vara att identifiera nya biomarkörer, såsom molekyler i blod eller i tarmfloran, för att förstå samspelet mellan kost, sömn och fysisk aktivitet.
Interventionerna görs under mycket standardiserade förhållanden, med kontinuerlig övervakning och högupplöst provinsamling under förlängd vakenhet. Vi samlar då in exempelvis data om blodsocker, sömn (elektroencefalogram, EEG), kroppstemperatur, och aktigrafidata. Datan kommer att bearbetas med högupplösta etablerade och skräddarsydda bioinformatiska metoder.
Att gå med i vårt team möjliggör bred kunskapsinhämtning om sömn och dygnsrytm. Du kommer att kunna skaffa dig värdefull laboratorieerfarenhet, samt få engagera dig i omfattande nätverk med våra nationella och internationella samarbetspartners. Det kommer att finnas möjligheter att bli försteförfattare på manuskript, delta i flera forskningssamarbeten, samt att presentera dina arbeten på nationella och internationella konferenser. Detta projekt är en utmärkt plattform för att avancera din karriär inom området sömnmedicin och dygnsbiologi, samtidigt som du får bidra till banbrytande forskning med potentialen för att förbättra folkhälsoresultaten.
Arbetsuppgifter
- Bioinformatiska analyser och integration av flera datatyper - så kallad systembiologianalys. Detta omfattar t.ex. blodbaserade biomarkörer, högupplösta blodsockerdata, EEG-data, aktigrafidata. Detta inhämtas från olika patientkategorier. Fokus ligger på sömnstörningar och metabola störningar som typ 2-diabetes.
- Analys av aktivitetsdata (aktigrafi) och EEG-data för att analysera parametrar för sömn och dygnsrytm, samt hur detta relaterar till humör, kognitiv prestation (t.ex. för att utvärdera minne och uppmärksamhet) och metabola störningar.
- Vårt labb samarbetar också med grupper över hela Europa, för att analysera befintliga och nya biomarkörer. Detta samarbete kommer att fokusera på analys av nya biomarkörer med hjälp av avancerade multiplexerade testpaneler, såsom Olink, samt riktade analyser av metabola, hormonella, kardiovaskulära och neurodegenerativa biomarkörer.
Kvalifikationskrav
- Doktorsexamen inom medicinsk vetenskap, dygnsrytm, sömnmedicin eller närliggande områden, eller en utländsk examen som bedöms likvärdig med dessa doktorsexamina.
- Erfarenhet, med stöd av vetenskapliga publikationer eller annan relevant dokumentation, av arbete kring metabolism och bioinformatik och bearbetning av flera relevanta datatyper (t.ex. EEG, aktigrafi, dygnsrytmer, blodbaserade biomarkörer), med tillhörande visualisering genom bearbetning i relevanta skriptmiljöer (såsom R och Python).
- Erfarenhet, med stöd av vetenskapliga publikationer, av att arbeta med humandata och olika livsstilsinterventioner, gärna med inriktning på sömn och dygnsrytmer.
Önskvärt/meriterande i övrigt
Kunskaper om bioinformatik relevant för tidsserieanalyser (t.ex. MNE-paket och SciPy) och nedladdning och implementering av sådan i bioinformatikrelevanta applikationer. Erfarenhet av relevanta visualiseringsmiljöer (ggplot2, matplotlib, seaborn, Illustrator), programmering i andra (skript)språk, erfarenhet av större forskningssamarbeten och sådan projektorganisation. Våtlabsarbete, t.ex. med hjälp av ELISA-metoder, qPCR och Western blotting.
Om anställningen
Anställningen är tidsbegränsad i 12 månader. Omfattningen är 100 %. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala
Upplysningar om anställningen lämnas av: Jonathan Cedernaes, mailto:
jonathan.cedernaes@medsci.uu.seI denna rekrytering har vi ersatt det personliga brevet med frågor som du besvarar i samband med din ansökan. Svaren kommer att användas som en del i urvalsprocessen.
Välkommen med din ansökan senast den 4 juli 2024, UFV-PA 2024/2409.
Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 600 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser.
Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet
https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd.
Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.
Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.
Ersättning Individuell lönesättning
Så ansöker du Sista dag att ansöka är 2024-07-04
Klicka på denna länk för att göra din ansökan Arbetsgivarens referens Arbetsgivarens referens för detta jobb är "UFV-PA 2024/2409".
Omfattning Detta är ett heltidsjobb.
Arbetsgivare Uppsala Universitet (org.nr 202100-2932)
Arbetsplats Uppsala universitet, Institutionen för medicinska vetenskaper
Jobbnummer 8762044