Bioinformatiker med ansvar för nationell koordinering

Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiolog / Kemiingenjörsjobb / Uppsala
Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Prenumerera på nya jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiolog

Visa alla kemiingenjörsjobb i Uppsala, Östhammar, Sigtuna, Österåker, Håbo eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiolog i Uppsala

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra långsiktig skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har drygt 45 000 studenter, mer än 7 000 anställda och en omsättning på cirka 7 miljarder kronor.



Institutionen för cell- och molekylärbiologi (ICM; https://www.

icm.uu.se) är en av de mest internationella, breda och framstående biomolekylära institutionerna i Europa. Institutionens forskningsområden är indelade i sju forskningsprogram som täcker allt från cellbiologi till biofysik av enskilda molekyler. Den person vi söker kommer att vara placerad vid Institutionen för cell- och molekylärbiologi och knuten till National Bioinformatics Infrastructure Sweden (NBIS) och Science for Life Laboratory (SciLifeLab).

NBIS tillhandahåller bioinformatiksupport och infrastruktur till forskare inom livsvetenskaperna. NBIS har ca 100 experter över hela landet inom olika områden såsom DNA-, RNA- och proteinanalyser, systembiologi, genomanalyser, masspektrometri-proteomik, metabolomik. NBIS har också experter inom systemutveckling och datahantering. NBIS utgör den svenska noden i den europeiska infrastrukturen ELIXIR för biologiska data. Mer information om NBIS finns på https://nbis.se.

Arbetsuppgifter: Huvuddelen av arbetet består i att tillhandahålla bioinformatisk support på nationell nivå till svenska forskare, framför allt inom genomik- och cancer-relaterad bioinformatik, huvudsakligen inom humandata. Även annan sekvensbaserad bioinformatik, och/eller programmering, kan ingå i tjänsten. Ansvarsområden inkluderar avancerade analyser av data, kommunikation med våra användare, eget lärande om nya metoder, rapportskrivande och undervisning. Härtill kommer nationell koordinering av bioinformatiksupport i nära samverkan med lokala faciliteter vid respektive universitet. I detta arbete ingår regelbundna kontakter med NBIS:s lokala koordinatorer vid respektive universitet.

Kvalifikationskrav:

- Masterutbildning i bioinformatik.
- Gedigen erfarenhet (minst 5 år) av avancerade analyser av genomikdata, framför allt i variantanalys, allelspecifik kopietalsanalys och strukturell analys av helexom- och helgenomsekvenseringsdata.
- Djup kunskap i att analysera känsliga data samt cancerdata och analys av befintliga kontrollerade dataset, tex TCGA.
- Goda kunskaper i R, liksom god förmåga att arbeta i terminalbaserad Linux-miljö och med storskaliga datorkluster (HPC).
- Erfarenhet av pipeline, containers och versionshantering, tex git.
- En ledande roll i metodutvecklingsprojekt av offentliga verktyg inom bioinformatik.
- Minst 5 års erfarenhet från arbete med nationell forskningsinfrastruktur.
- Erfarenhet av supportprojekt i samarbete med företag.
- Erfarenhet av ackrediterad bioinformatisk verksamhet.
- Ledande ansvarig roll i samordning, genomförande, utlärande och kursmaterial inom undervisning och avancerade forskarutbildningskurser, på såväl nationell som internationell nivå.
- Dokumenterad förmåga att jobba reproducerbart är viktigt då arbetet ofta innefattar samarbete med andra experter inom NBIS och med våra användare.
- Mycket god förmåga att arbeta i en serviceinriktad miljö, både i samarbete och självständigt.
- Utmärkt talad och skriven engelska krävs.

Vi söker en medarbetare med utmärkt kommunikationsförmåga, eftersom arbetet innebär samarbete med forskare inom olika vetenskapliga discipliner och olika bioinformatikkunnande. I arbetet ingår också interaktioner med personer på såväl ledningsnivå som verksamhetsnivå vid de olika universiteten. Den vi söker är serviceinriktad med god vilja till dialog och lagarbete. Eftersom NBIS:s verksamhet är nationell är kommunikation och koordination en viktig del av arbetet. Stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet och egenskaper såsom lyhördhet samt god organisations- och samarbetsförmåga.

Önskvärt/meriterande i övrigt:

- Erfarenhet av storskaliga datorberäkningar (HPC) med känsliga data.
- Erfarenhet av applikationsexpertarbete i stordatormiljö.

Lön: Individuell lönesättning.

Tillträde: Snarast eller enligt överenskommelse.

Anställningsform: Tillsvidareanställning, provanställning kan tillämpas.

Anställningens omfattning: 100 %.

Upplysningar om anställningen lämnas av: professor Bengt Persson, e-post bengt.persson@icm.uu.se.

Välkommen med din ansökan senast den 27 maj 2021, UFV-PA 2021/1917.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.

Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Varaktighet, arbetstid
100%. Tillträde: Snarast Tillsvidareanställning

Publiceringsdatum
2021-05-13

Ersättning
Individuell lönesättning

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2021-05-27
Klicka på denna länk för att göra din ansökan

Företag
Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiolog

Arbetsgivarens referens
Arbetsgivarens referens för detta jobb är "UFV-PA 2021/1917".

Omfattning
Detta är ett heltidsjobb.

Arbetsgivare
Uppsala Universitet (org.nr 202100-2932)

Arbetsplats
Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiologi

Jobbnummer
5734701

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Prenumerera på jobb från Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiolog

Fyll i din e-postadress för att få e-postnotifiering när det dyker upp fler lediga jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiolog: