Postdoktor i folkhälsovetenskap
Karlstads universitet / Institutionen för hälsovetenskaper / Högskolejobb / Karlstad
2024-09-17
Visa alla högskolejobb i Karlstad,
Hammarö,
Forshaga,
Grums,
Kil eller i
hela Sverige Visa alla jobb hos Karlstads universitet / Institutionen för hälsovetenskaper i Karlstad Sapere Aude - våga vara vis - är vårt motto. Våra studenter och medarbetare utvecklar kunskap och kompetens som berikar individen och världen. Vår akademiska miljö präglas av nyfikenhet, mod och uthållighet, och grunden för vår verksamhet är jämställdhet, mångfald och ett demokratiskt synsätt. Vi finns i en aktiv, naturnära region och är en motor för hållbar utveckling i tät samverkan med det omgivande samhället.
Karlstads universitet har ca 1 400 medarbetare och 17 300 studenter fördelade på två inspirerande campusmiljöer i Karlstad och Arvika. Läs mer om oss på:
https://www.kau.se/jobba-hos-ossPubliceringsdatum2024-09-17Dina arbetsuppgifterAnställningen är central i två projekt som nyligen finansierats inom ramen för SELMA-studien.
Det första projektet är ett stort EU-projekt, RE-MEND, där vi tillsammans med 15 internationella partners ska undersöka skyddande faktorer som påverkar den psykiska hälsan i endokrinkänsliga livsstadier. Det andra projektet, Epi-Clock, undersöker vi om den prenatala miljön kan påverka epigenetiska klockor hos barn och vidare undersöka om sådana förändringar i den epigenetiska klockan är associerade till barns neuroutveckling.
Karlstads universitets roll i projekten är att analysera och tolka data inhämtad från SELMA-kohorten utifrån frågor om biologi. I anställningen som postdoktor kommer du att ha en nyckelroll i upprättandet av analytiska pipelines baserade på relevant SELMA-data, bedriva nära samarbete med läkare och andra experter som krävs för att tolka resultaten samt etablera nya forskningsprojekt baserade på SELMA-projektet och andra kohorter.
För att bidra till en god arbetsmiljö och utveckling av verksamheten förväntar vi oss att du är närvarande och deltar i det dagliga arbetet och gemenskapen.
Anställningen är en möjlighet för dig att arbeta 100 % med forskning i en internationell miljö i framgångsrika projekt. Undervisning inom relevanta områden kan också bli aktuellt.
Behörighetskrav
Behörig att anställas är du som har en doktorsexamen inom bioinformatik eller beräkningsbiologi. Du kan även ha en utländsk examen som bedöms motsvara en svensk doktorsexamen.
Äldre examen kan beaktas när särskilda skäl föreligger t.ex ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, klinisk tjänstgöring, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, tjänstgöring inom totalförsvaret eller andra liknande omständigheter eller för ämnesområdet relevant tjänstgöring/uppdrag.
Sökande måste ha praktisk erfarenhet av beräkningsbiologi med fokus på statistisk analys av stora kliniska datamängder samt ha gedigen erfarenhet av minst en omics-teknologi, men gärna flera, och dess analys. Särskild vikt kommer att läggas vid sökande med erfarenhet av DNA-metylering med både array- och sekvenseringstekniker samt DNA-sekvensanalys. Eftersom anställningen innebär nära samarbete med läkare sätter vi högt värde på sökande med en grundläggande förståelse för mänsklig fysiologi och molekylärbiologi, och som kan kommunicera sitt arbete på ett pedagogiskt sätt.
Sökande måste ha erfarenhet av att analysera stora kliniska datamängder, vilket innebär färdighet i minst ett programmeringsspråk (företrädelsevis R eller Python), goda kunskaper i datarensning, visualisering (t.ex. pandas, matplotlib, ggplot, plotly) och skriptspråk i Linux-miljö (Bash). Rollen kräver också mycket goda praktiska färdigheter i statistisk analys (dimensionell reduktion, klustring, hypotesprövning, korrigering av batch-effekter, FDR-kontroll) samt tidigare praktisk erfarenhet av prediktiv modellering och maskininlärning.
För att säkerställa reproducerbarhet och återanvändbarhet av kodbasen kommer vi att lägga särskild vikt vid tidigare erfarenhet av kontainerisering (t.ex. Docker, Singularity), arbetsflödessystem (t.ex. Nextflow, Snakemake), mjukvarupaketering (Conda/PyPi eller Bioconductor) samt versionskontroll (Git) och erfarenhet av att skriva tester. För att säkerställa enkel kunskapsöverföring till andra kollegor när anställningen avslutas krävs noggrann dokumentering av arbetet. Utöver att tillämpa god programmeringspraxis förväntas du också aktivt bidra till hög kodkvalitet inom arbetsgruppen.
För anställningen krävs goda kunskaper i engelska, både i skrift och i tal.
Bedömningskriterier
Meriter ska verifieras genom högkvalitativa akademiska publikationer i internationella tidskrifter inom forskningsområdet, dokumenterad erfarenhet av undervisning och pedagogisk utveckling, eller bidrag till open source-projekt (t.ex. en GitHub-portfölj).
Särskild vikt kommer att läggas vid färdigheter och erfarenhet inom analys av stora kliniska datamängder med fokus på prediktiv modellering, programmering, utveckling av reproducerbara bioinformatikflöden samt kunskap om molekylärbiologiska verktyg och sekvenseringstekniker. Särskild vikt läggs även vid erfarenhet från internationella anställningar, uppdrag eller nationella och internationella nätverk.
Av stor vikt är god kommunikationsförmåga, samarbetsförmåga, gott omdöme, ansvarstagande, engagemang för verksamheten och ett positivt förhållningssätt till kollegor och studenter.
Meriterande
Pedagogiska utnämningar.
Genomfört behörighetsgivande högskolepedagogisk utbildning.
AnställningsvillkorAnställningen är en tidsbegränsad anställning på heltid som postdoktor under 2 år med start i november 2024.
Så ansöker duAnsökan görs i universitetets webbaserade rekryteringsverktyg Varbi. Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen, att eventuella handlingar på språk annat än svenska, norska, danska eller engelska är översatta och att din kompetens är dokumenterad på ett sätt som medger en saklig, kvalitativ bedömning. Komplett ansökan ska vara inne vid ansökningstidens slut. En ofullständig ansökan kan medföra att din kompetens inte kan prövas i alla avseenden.
Karlstads universitet har gjort medieval för denna rekrytering och vi undanber oss därför kontakter med annonsförsäljare och säljare av rekryteringstjänster.
HR Excellence in Research
Karlstads universitet mottog i september 2020 utmärkelsen HR Excellence in Research. Utmärkelsen ges till arbetsgivare som har en stimulerande arbetsmiljö och goda villkor för forskare och kontinuerligt arbetar för att utveckla dessa. Utmärkelsen visar lärosätets engagemang för rättvis och transparent rekrytering samt gynnsam professionell utveckling för forskare. Läs mer på
https://www.kau.se/jobba-hos-oss/karlstads-universitet-som-arbetsgivare/human-resources-strategi-forskare-hrs4r Ersättning Månadslön
Så ansöker du Sista dag att ansöka är 2024-10-09
Klicka på denna länk för att göra din ansökan Arbetsgivarens referens Arbetsgivarens referens för detta jobb är "REK2024/157".
Omfattning Detta är ett heltidsjobb.
Arbetsgivare Karlstads Universitet (org.nr 202100-3120)
Arbetsplats Karlstads universitet / Institutionen för hälsovetenskaper
Kontakt Louise Persson
louise.persson@kau.se +46547002135 Jobbnummer 8904637