Postdoktor (2 år) i beräkningsbiologi
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet / Fysikjobb / Umeå
2017-10-27
Observera att sista ansökningsdag har passerat.
➡️ Klicka här för den senare publicerade platsannonsen "Postdoktor (2 år) i beräkningsbiologi" (publicerad 2018-11-07) ⬅️
Visa alla fysikjobb i Umeå,
Vännäs,
Nordmaling,
Vindeln,
Robertsfors eller i
hela Sverige Visa alla jobb hos Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet i Umeå,
Nordmaling,
Örnsköldsvik,
Kiruna,
Huddinge eller i
hela Sverige Umeå universitet satsar på kreativa miljöer för studier och arbete. Hos oss finns attraktiva utbildningar, världsledande forskning och utmärkta innovations- och samverkansmöjligheter. Fler än 4 300 medarbetare och 31 500 studenter har redan valt Umeå universitet. Välj oss du också.
Institutionen för fysik söker en postdoktor till tvärvetenskapliga Integrated Science Lab, IceLab, där vi arbetar med att lösa problem inom livsvetenskaperna med redskap från fysik, matematik och datavetenskap.
Anställningen avser heltid, är tidsbegränsad till 2 år och är del av ett omfattande femårigt tvärvetenskapligt projekt som också inkluderar flera forskargrupper vid Kemiskt Biologiskt Center (www.kbc.umu.se) och Umeå Plant Science Centre (www.upsc.se), två stimulerande miljöer vid Umeå universitet.
Sista ansökningsdag är 2017-12-01.
Projektbeskrivning
Mediatorn är ett evolutionärt bevarat multiprotein komplex som är essentiellt för transkriptionell reglering och har en viktig roll i stressacklimatiseringsprocesser. Mediatorn integrerar externa signaler från olika receptorer, genom att överföra signaler från promotorbundna transkriptionsfaktorer till RNA-polymeras II (Pol II). Mediatorn är även involverad i strukturella förändringar av kromatinstruktur och vid reglering av genuttryck; processer som är nödvändiga för att reglera stressreaktioner hos växter. Flera aspekter av Mediatorns funktion är fortfarande okända, särskilt frågor om hur specifika Mediatorsubenheter integrerar olika signalvägar och hur de överför dessa signaler till Pol II för att reglera uttrycket av specifika målgener. För att avslöja Mediatorns regleringsmekanismer samt definiera växters stressrespons på flera organisationsnivåer kommer vi att konstruera en helhetsmodell av växters stressrespons genom att kombinera nätverksalgoritmer och dolda Markov-modeller och därmed generera en dynamisk och övergripande modell av de komplexa signalnätverk som styr växters stressrespons.
Postdoktorprojektet är del av det 5-åriga tvärvetenskapliga projektet "Kartläggning av växters stressrespons" som är finansierat av Stiftelsen för strategisk forskning. Projektet erbjuder utmanande postdoktorsmeritering för flera postdoktorer, vilka kommer att lösa problem med metoder från biologi, fysik och datavetenskap, samt utnyttja avancerade tekniska plattformar i miljön. De framgångsrika kandidaterna kommer att forska tillsammans med andra forskare i dynamiska och multidisciplinära miljöer.
Postdoktorn kommer att studera hur Mediatorn integrerar signaler från cellens olika delar för att kontrollera genuttrycket för stressresponser. I synnerhet så innehåller överlappande uppsättningar av målgener för specifika Mediatormoduler i olika stressförhållanden och deras gemensamma regleringsform information om masterreglermekanismer av stressresponser. Med hjälp av en rad beräkningsverktyg kommer postdoktorn att identifiera moduler av samreglerade gener med delade regulatoriska motiv och genprodukter med konserverade biologiska funktioner med avseende på stressresponser.
Anställningen avser heltid och är tidsbegränsad till 2 år med tillträde i januari 2018 (exakt startdatum enligt överenskommelse).
Publiceringsdatum2017-10-27KvalifikationerKandidaten ska ha en doktorsexamen eller utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen i tillämpad matematik, bioinformatik, datavetenskap, fysik eller angränsande ämne. Doktorsexamen ska vara avlagd högst tre år före ansökningstidens utgång om inte särskilda skäl föreligger.
Vi söker en engagerad och ansvarsfull kandidat som brinner för att utvecklas, både som individuell forskare och som medlem av en forskargrupp. Sökande ska ha omfattande utbildning i statistisk eller beräkningsmodellering med språk som C++, Python eller R och vara passionerad av att utveckla maskininlärningsalgoritmer för att besvara biologiska frågor. Arbetserfarenhet av storskalig sekvensanalys är meriterande. Förmåga att forska självständigt såväl som i grupp samt mycket goda kunskaper i det engelska språket är ett krav.
Ansökan
Ansökan ska innehålla:
1. Ett följebrev med kort beskrivning av dina kvalifikationer, forskningsintressen och motivering varför du söker (max 2 sidor),
2. En meritförteckning (CV),
3. En publikationslista,
4. Kopior på relevanta examensbevis,
5. Kopia av avhandlingen och relevanta publikationer,
6. Namn och kontaktuppgifter till två referenspersoner.
Övrig information
Närmare upplysningar lämnas av Martin Rosvall,
martin.rosvall@umu.se.
Forskning:
http://www.tp.umu.se/~rosvall Kartläggningsverktyg:
http://mapequation.org Forskningsmiljö:
http://www.org.umu.se/icelab/english/Ansökan ska göras via e-rekryteringssystemet Varbi och vara inkommen senast 2017-12-01.
Välkommen med din ansökan!
Umeå universitet vill erbjuda en miljö där öppna samtal mellan människor med olika bakgrund och perspektiv lägger grunden för lärande, skaparkraft och utveckling. Vid varje rekrytering strävar vi efter ökad mångfald och använder möjligheten till positiv särbehandling.
Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser.
Varaktighet, arbetstid
100%. Tillträde: Januari 2018 (exakt startdatum enligt överenskommelse). Visstidsanställning
ErsättningMånadslön
Så ansöker duSista dag att ansöka är 2017-12-01
Ange följande referens när du ansöker: AN 2.2.1-1870-17
Klicka på denna länk för att göra din ansökanKontaktMartin Rosvall 070-2391973
FöretagUmeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet
AdressUmeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet
Umeå universitet
90187 Umeå
KontorsadressUmeå universitet
Jobbnummer 3771673
Observera att sista ansökningsdag har passerat.