Förste forskningsingenjör i komparativ genomik

Uppsala universitet / Kemiingenjörsjobb / Uppsala
Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Visa alla kemiingenjörsjobb i Uppsala, Östhammar, Sigtuna, Österåker, Håbo eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Uppsala universitet i Uppsala, Upplands Väsby, Gävle, Gotland eller i hela Sverige

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 46.000 studenter, 7.300 anställda och en omsättning på 7,3 miljarder kronor.

Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi (IMBIM) vid Uppsala universitet utgör en bred internationell miljö för forskning och undervisning.

Institutionens forskning bedrivs inom tre samverkande och delvis integrerade sektioner; cancer, infektioner och försvar samt genetik och genomik. En närmare beskrivning finns på http://www.imbim.uu.se/forskningsomraden/

Professor Lindblad-Tohs grupp ingår i en kreativ miljö inom Uppsala universitets medicinska fakultet och i SciLifeLab. Forskningens fokus ligger på att använda komparativ genomik för att förstå komplexa sjukdomar, från cancer till inflammatoriska sjukdomar och neurobiologi. För att uppnå detta använder vi oss av populationsdata och genomvida associationer tillsammans med olika omics data och traditionell genetik och biokemiska och funktionella analyser av celllinjer och patientprover.

Vi söker en innovativ och energisk person som gärna arbetar som del av en grupp för att driva våra studier inom 200 Mammals-projektet (även kallat Zoonomia), ett projekt som syftar till att förstå funktionen hos varje bas i människans arvsmassa. Detta dataset har möjlighet att uppnå single-base contraint där varje viktig bas kan hittas och hjälpa oss att bättre förstå arvsmassan med avseende på sjukdomar och positiv selektion hos både hundar och människor. Dessa nya analyser kombinerar 200 Mammals med funktionell genomik genom stat-of-the-art metoder såsom single cell RNA-seq-analys och CRISPR/Cas9 för att förstå genreglering.

Arbetsbeskrivning: Att använda komparativ och funktionell genomik för att förstå genreglering i hundens och människans arvsmassa. Att jobba nära inom en grupp av bioinformatiker och genetiker för att förstå betydelsen av evolutionär konservering i geners funktion och dess betydelse för sjukdomar. Ditt arbete kommer till stor del att utföras laborativt och innebära generering och analys av data från tekniker som ATAC-seq, single-cell RNA-seq, HiC och ChIP-seq för att noggrant funktionellt undersöka genuttryck i hundens hjärna. Efter bioinformatiska analyser för att hitta kandidatmutationer kommer du utföra ytterligare laborativt och bioinformatiskt arbete för att validera kandidatmutationerna med hjälp av t.ex. massively parallel reporter assays (MPRA) samt CRISPR/Cas9 analys av passande cellinjer. Viss undervisning kan ingå.

Kvalifikationskrav

- Doktorsexamen i komparativ genomik, komparativ genetik eller funktionell genomik. Stor vikt läggs på att bedöma sökandens lämplighet i gruppen.
- Flerårig dokumenterad laborativ erfarenhet av och djup kunskap kring tekniker inom funktionell genomik såsom ATAC-seq, single cell RNA-seq, ChIP-seq, CRISPR/Cas9 och MPRA är viktigt.
- Erfarenhet av bioinformatisk analys av DNA-sekvensdata.
- Mycket god förmåga att kommunicera muntligt och skriftligt på engelska är nödvändigt.
- Stor vikt läggs vid personliga egenskaper såsom flexibilitet, kommunikations- och samarbetsfärdigheter, förmåga att arbeta självständigt samt vetenskaplig mognad och kreativitet.

Lön: Individuell lönesättning.

Tillträde: Snarast eller enligt överenskommelse.

Anställningsform: Tillsvidare. 6 månader provanställning.

Anställningens omfattning: 100 %

Upplysningar om anställningen lämnas av: Professor Kerstin Lindblad-Toh, mailto:kerstin.lindblad-toh@imbim.uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 24 juni 2020, UFV-PA 2020/2013.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.

Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Varaktighet, arbetstid
100. Tillträde: snarast eller enligt överenskommelse Tillsvidareanställning

Publiceringsdatum
2020-05-28

Ersättning
Individuell

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2020-06-24
Klicka på denna länk för att göra din ansökan

Företag
Uppsala Universitet

Arbetsgivarens referens
Arbetsgivarens referens för detta jobb är "UFV-PA 2020/2013".

Omfattning
Detta är ett heltidsjobb.

Arbetsgivare
Uppsala Universitet (org.nr 202100-2932)

Arbetsplats
Institutionen För Medicinsk Biokemi Och Mikrobiologi (imbim)

Jobbnummer
5242434

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Förste forskningsingenjör i komparativ genomik

Prenumerera på jobb från Uppsala universitet