Forskningsingenjör inom bioinformatik på Umeå universitet
Umeå universitet, Medicinska fakulteten / Kemiingenjörsjobb / Umeå
2025-05-12
Visa alla kemiingenjörsjobb i Umeå,
Vännäs,
Nordmaling,
Vindeln,
Robertsfors eller i
hela Sverige Visa alla jobb hos Umeå universitet, Medicinska fakulteten i Umeå,
Örnsköldsvik,
Skellefteå,
Luleå,
Sundsvall eller i
hela Sverige Umeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med över 37 000 studenter och cirka 4 700 anställda. Vid universitetet finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden, och här gjordes den banbrytande upptäckten av gensaxen CRISPR-Cas9 som tilldelats Nobelpriset i kemi. Vid Umeå universitet är allt nära. Våra sammanhållna campus gör det lätt att mötas, samarbeta och utbyta kunskap, något som gynnar en dynamisk och öppen kultur.
Den samhällsomvandling och de stora gröna investeringar vi ser i norra Sverige skapar enorma möjligheter och komplexa utmaningar. För Umeå universitet handlar det om att bedriva forskning om - och mitt i - ett samhälle i omvandling. Men också om att leverera utbildningar för regioner som behöver expandera fort och hållbart. Det är helt enkelt här framtiden skapas.
Är du intresserad av att veta mer?
https://www.umu.se/jobba-hos-oss/om-universitetet-som-arbetsplats/Medicinska fakulteten är en av de största fakulteterna vid Umeå universitet och attraherar många studenter med ett omfattande utbud av utbildningar inom områdena medicin, tandvård, hälsa och vård. Vi erbjuder en väl utvecklad forskningsinfrastruktur och en inspirerande, dynamisk miljö med ledande forskning. Vår nära samverkan med de fyra regionerna i Norra sjukvårdsregionen ser vi som en stor ömsesidig tillgång för att utveckla forskning och utbildning och att säkra tillgången på vår framtids vårdpersonal.
Publiceringsdatum2025-05-12BeskrivningUmeå universitet är platsen för den banbrytande upptäckten av den genetiska saxen CRISPR-Cas9 - en revolution inom genteknik som har belönats med Nobelpriset i kemi.
Tjänsten som forskningsingenjör är placerad i professor Överbys forskargrupp. Forskargruppens fokus ligger på att förstå fästingburen encefalitvirus patogenes, frågeställningar som studeras är: hur virus tar sig in i hjärnan, vilket immunsvar som virus triggar och vilka virala och cellulära faktorer som bidrar till virustropism i hjärnan. Genom att använda olika cell kulturmodeller, musmodeller, helhjärne-avbildningstekniker samt transkriptomik och proteomik så besvaras dessa frågor.
Dina arbetsuppgifterInstitutionen för klinisk mikrobiologi, Umeå universitet, söker en forskningsingenjör inom bioinformatik. Den anställda kommer att vara aktiv i flera olika forskningsprojekt som avser att studera fästingvirus-värd interaktioner med RNA-transkriptomik framför allt från hjärnvävnad och primära hjärnceller.
Du kommer att ansvara för att bedriva den bioinformatiska analysen som en del av Överbys forskargrupp och i nära samarbete med olika medlemmar av forskargruppen.
Du kommer att:
- Analysera Parse singelcell RNA sekvenseringdata från hjärnceller.
- Analysera single nucli RNA sekvenseringdata för att designa paneler för spatial transkriptomik.
- Analysera samt visualisera spatial transkriptomik från infekterad mushjärna.
- Analysera och visualisera bulk RNA sekvenseringsdata.
- Samarbeta med olika personer i forskargruppen, delta i och bidra till vetenskapliga gruppmöten som involverar forskargruppen och dess medlemmar.
- Bidra till publicering av forskningsresultat.
KvalifikationerBehörig att anställas som forskningsingenjör är den som har en kandidatexamen inom computational biology. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid den tidpunkt då beslut om anställning fattas.
Ett krav för anställningen är lång erfarenhet och skicklighet i programmering och statistiska analyser i R samt Phyton. Det vetenskapliga arbetet kräver god kännedom om single cell transkriptomics och bulk RNA analys samt förmåga att arbeta både självständigt och i grupp under ledning av gruppledaren.
Du som söker måste behärska flytande engelska i både tal och skrift samt ha en hög motivation gällande forskningsarbete. Eftersom projektet innebär samarbeten måste du också kunna arbeta produktivt i grupp. Utmärkta kommunikationsfärdigheter krävs för att effektivt kunna samarbeta med kollegor, inklusive kollegor från kompletterande forskningsområden. Du som söker måste också ha förmåga att självständigt analysera, utveckla metoder, utföra analyser och sammanfatta resultat.
Det förväntas att kandidaten har dokumenterat goda egenskaper för att arbeta i en grupp och med andra forskare. Du har också en strävan efter att utvecklas och ta till dig ny kunskap och metodologi inom till exempel virologi och spatial transkriptomik.
Meriterande
Erfarenhet av bioinformatik analys av mus och humandata, CNS relaterad forskning och immuncells analys.
Erfarenhet av att undervisa och förmedla bioinformatikkunskap till andra.
AnställningsvillkorAnställningen är en tillsvidareanställning på heltid med 6 månaders provanställning. Tillträde enligt överenskommelse.
Ansökan ska innehålla:
- Personligt brev som visar kvalifikationer och motivation sammanfattat på en A4-sida CV inklusive publikationslista
- Publikationslista med relevant publikationer som är accepterade och ligger på preprint server
- Styrkt kopia av relevanta examensbevis
- Rekommendationsbrev och kontaktuppgifter till minst två referenspersoner
- Övrig relevant information om din kompetens
Ansökan görs elektroniskt via Varbi, sista ansökningsdag är 2025-06-02
För ytterligare information, kontakta Anna Överby (
anna.overby@umu.se)
Välkommen med din ansökan!
Umeå universitet vill erbjuda en jämställd och jämlik miljö där öppna samtal mellan människor med olika bakgrund och perspektiv lägger grunden för lärande, skaparkraft och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och erfarenheter att söka den aktuella anställningen.
Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser.
Ersättning Månadslön
Så ansöker du Sista dag att ansöka är 2025-06-02
Klicka på denna länk för att göra din ansökan Arbetsgivarens referens Arbetsgivarens referens för detta jobb är "AN 2.2.1-630-25".
Omfattning Detta är ett heltidsjobb.
Arbetsgivare Umeå Universitet (org.nr 202100-2874)
Arbetsplats Umeå universitet, Medicinska fakulteten
Kontakt Anna Överby Wernstedt
anna.overby@umu.se Jobbnummer 9334309