Staff scientist inom molekylär AI och patogensystembiologi
Umeå universitet, Medicinska fakulteten / Kemiingenjörsjobb / Umeå
2025-10-27
Visa alla kemiingenjörsjobb i Umeå,
Vännäs,
Nordmaling,
Vindeln,
Robertsfors eller i
hela Sverige Visa alla jobb hos Umeå universitet, Medicinska fakulteten i Umeå,
Örnsköldsvik,
Skellefteå,
Luleå,
Sundsvall eller i
hela Sverige Umeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med över 37 000 studenter och cirka 4 700 anställda. Vid universitetet finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden, och här gjordes den banbrytande upptäckten av gensaxen CRISPR-Cas9 som tilldelats Nobelpriset i kemi. Vid Umeå universitet är allt nära. Våra sammanhållna campus gör det lätt att mötas, samarbeta och utbyta kunskap, något som gynnar en dynamisk och öppen kultur.
Den samhällsomvandling och de stora gröna investeringar vi ser i norra Sverige skapar enorma möjligheter och komplexa utmaningar. För Umeå universitet handlar det om att bedriva forskning om - och mitt i - ett samhälle i omvandling. Men också om att leverera utbildningar för regioner som behöver expandera fort och hållbart. Det är helt enkelt här framtiden skapas.
Är du intresserad av att veta mer?
https://www.umu.se/jobba-hos-oss/om-universitetet-som-arbetsplats/Medicinska fakulteten är en av de största fakulteterna vid Umeå universitet och attraherar många studenter med ett omfattande utbud av utbildningar inom områdena medicin, tandvård, hälsa och vård. Vi erbjuder en väl utvecklad forskningsinfrastruktur och en inspirerande, dynamisk miljö med ledande forskning. Vår nära samverkan med de fyra regionerna i Norra sjukvårdsregionen ser vi som en stor ömsesidig tillgång för att utveckla forskning och utbildning och att säkra tillgången på vår framtids vårdpersonal.
Institutionen för molekylärbiologi vid Umeå universitet söker en Staff Scientist inom molekylär AI och patogensystembiologi för en begränsad anställning på 12 månader.
Anställningen förväntas påbörjas i februari 2026 eller enligt överenskommelse. Sista ansökningsdag är den 19 november 2026.
Publiceringsdatum2025-10-27BeskrivningVår forskning fokuserar på mikrobiell nischanpassning och stressresponser, med hjälp av integrativa multi-omikmetoder (t.ex. bulk- och singelcellstranskriptomik, metagenomik) i kombination med avancerade AI- och LLM-tekniker. Den anställda forskaren kommer att leda utvecklingen av analys- och kunskapsverktyg baserade på stora språkmodeller (LLM), såsom retrieval-augmented generation (RAG) över omikdata och litteratur, automatiserade data-till-insikt-sammanställningar samt agentbaserade arbetsflöden. Rollen är tvärvetenskaplig och innefattar nära samarbete med molekylärbiologer, bioinformatiker och externa samarbetspartners.
Dina arbetsuppgifterDesigna, bygga och underhålla AI/LLM-baserade analysflöden för multi-omikdata och vetenskaplig litteratur (inkl. RAG, utvärderingsramverk, säkerhetsmekanismer och dokumentation).
Leda integrativa analyser av komplexa dataset och leverera tydliga visuella och narrativa
beslutsunderlag. Säkerställa reproducerbarhet genom versionshantering, containerisering, arbetsflödesorkestrering och dokumenterade analyser. Bidra till vetenskapliga publikationer, forskningsansökningar och handledning inom AI/ML och dataanalys. Koordinera samarbeten och stödja datastyrning enligt FAIR-principerna.
Kvalifikationer1. Doktorsexamen i molekylärbiologi, beräkningsbiologi, biomedicinsk datavetenskap eller
närliggande område.
2. Cirka fem års postdoktoral forskningserfarenhet med dokumenterad expertis inom patogen- eller mikrobiella system (t.ex. stressresponser, nischanpassning, värd-patogeninteraktioner).
3. Praktisk erfarenhet av stora språkmodeller och modern maskininlärning: prompt engineering,
parameter-effektiv finjustering, RAG, vektorbaserade databaser, utvärderingsmetoder och
implementering av forskningsanpassade AI-verktyg.
4. Goda programmeringskunskaper i Python (gärna även R); erfarenhet av datahantering för omikdata, containerteknik, CI/testning samt högkvalitativ visualisering och rapportering.
5. Stark vetenskaplig meritlista som visar både metodologisk innovation och biologisk förståelse.
6. Utmärkta kunskaper i engelska, både i tal och skrift, samt dokumenterad förmåga att samarbeta, kommunicera komplexa resultat och bidra till forskningsansökningar och handledning.
7. Erfarenhet av miljö- eller klinisk metagenomik/metatranskriptomik, singelcellsdata samt arbete
med ontologier och metadata-standarder.
8. Undervisningserfarenhet inom AI/ML riktad till livsvetenskapliga forskare samt utveckling av
interna forskningsverktyg.
9. Dokumenterad erfarenhet av att erhålla eller stödja forskningsfinansiering.
Meriterande
Erfarenhet av miljö- eller klinisk metagenomik/metatranskriptomik, singelcellsdata samt arbete
med ontologier och metadata-standarder. Undervisningserfarenhet inom AI/ML riktad till livsvetenskapliga forskare samt utveckling av interna forskningsverktyg.
Så ansöker duAnsökan ska innehålla:
1. Ett personligt brev (max 2 sidor) där du beskriver din lämplighet, hur du vill vidareutveckla våra
LLM-baserade analysverktyg samt din vision för integrativa patogenanalyser.
2. Ett CV med dokumenterad akademisk utbildning och tidigare anställningar.
3. Publikationslista (markera särskilt AI/LLM- och systembiologiska arbeten).
4. Kopia av doktorsexamen och andra relevanta examensbevis.
5. Namn och kontaktuppgifter (inkl. e-post) till två eller tre akademiska referenser.
6. Övrig relevant dokumentation (t.ex. kodarkiv, programvarudemonstrationer,
undervisningsmaterial).
Ansökan ska skickas in via vårt e-rekryteringssystem Varbi, senast den 19 november 2026.
Mer om oss:
För mer information om institutionen, läs mer här:
https://www.umu.se/institutionen-for-molekylarbiologi/Vid frågor om anställningen kontakta Maria Fällman, mailto:
maria.fallman@umu.seVälkommen med din ansökan!
Umeå universitet vill erbjuda en jämställd och jämlik miljö där öppna samtal mellan människor med olika bakgrund och perspektiv lägger grunden för lärande, skaparkraft och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och erfarenheter att söka den aktuella anställningen.
Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser.
Ersättning Månadslön
Så ansöker du Sista dag att ansöka är 2025-11-19
Klicka på denna länk för att göra din ansökan Arbetsgivarens referens Arbetsgivarens referens för detta jobb är "AN 2.2.1-1234-25".
Omfattning Detta är ett heltidsjobb.
Arbetsgivare Umeå Universitet (org.nr 202100-2874)
Arbetsplats Umeå universitet, Medicinska fakulteten
Kontakt Maria Fällman
maria.fallman@umu.ae Jobbnummer 9576058