Första forskningsingenjör inom genomassembly och bioinformatik

Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet / Kemiingenjörsjobb / Umeå
Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Visa alla kemiingenjörsjobb i Umeå, Vännäs, Nordmaling, Vindeln, Robertsfors eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet i Umeå, Nordmaling, Örnsköldsvik, Kiruna, Huddinge eller i hela Sverige

Umeå universitet satsar på kreativa miljöer för studier och arbete. Hos oss finns attraktiva utbildningar, världsledande forskning och utmärkta innovations- och samverkansmöjligheter. Fler än 4 100 medarbetare och 34 000 studenter har redan valt Umeå universitet. Välj oss du också.

Umeå Plant Science Center (UPSC) är en av Europas starkaste forskningsmiljöer för växtgrundforskning inbegripande forskning om växternas ekologi, genetik, cellbiologi, molekylärbiologi och fysiologi (se www.

upsc.se).Vi söker en förste forskningsingenjör vid Institutionen för fysiologisk botanik, som är en del av Umeå Plant Science Centre. Anställningen är på heltid och tillsvidare. Start 1 september 2020 eller enligt överenskommelse. Provanställning kan komma att tillämpas.

Publiceringsdatum
2020-07-13

Dina arbetsuppgifter
Du kommer att arbeta med bioinformatik vid institutionen för fysiologisk botanik, Umeå universitet, och i ett samarbete med forskargrupper vid SciLifeLab (Science for Life Laboratory), NBIS (National BioInformatics Service) och arbetsgruppen för gran- och tallgenomprojektet. Arbetet kommer att omfatta utveckling och implementering av ett arbetsflöde för genomassembly och tillhörande genomanalys, i tillägg till mer generell bioinformatisk analys och support. All källkod i projektet kommer att göras offentlig och måste följa principer kring transparent och reproducerbar forskning.

Kvalifikationer
Du har doktorsexamen inom bioinformatik eller motsvarande, samt postdoktoral erfarenhet. Det krävs att du har omfattande erfarenhet av genomassembly med sekvenseringsdata från Pacific Bioscience och/eller Oxford Nanopore. Erfarenhet av att utveckla effektiva arbetsflöden i HPC-miljö (High Performance Computing), samt god kunskap om associerade kösystem och databashantering är också krav. Vidare är det också ett krav att du har erfarenhet av att skriva komplexa skript (i till exempel Python) och kan visa upp dokumenterad erfarenhet och expertis av att utveckla arbetsflöden för reproducerbar analys som i sin tur delas offentligt på plattformar för delning av kod (till exempel Github). Vidare krävs utmärkta färdigheter inom R-programmering och dataanalys. Erfarenhet av att arbeta med heterozygota och fragmenterade genomassemblies är mycket meriterande. Dokumenterad erfarenhet av hantering av RNA-sekvenseringsdata, inklusive co-uttrycksnätverk och transkriptanalys, för att kunna offentliggöra resurserna från dessa genomprojekt är erfarenhet inom full-stack utveckling mycket önskvärt (till exempel php, node.js, MySQL, HTML5, JavaScript). Utmärkt förmåga att kommunicera både i tal och skrift, mycket bra engelska kunskaper, en vilja att lära sig nya färdigheter och att samarbeta i grupp är av största vikt. Då du kommer att arbeta med generell bioinformatiksupport inom institutionen, är bred kunskap kring bioinformatisk analys ett krav.

Så ansöker du
Ansökan ska innehålla:

- Ett personligt brev där du beskriver dig själv och dina forskningsintressen samt en motivering till varför du är intresserad av och är lämplig för tjänsten. Du ska även bifoga länkar till exempel på implementerade verktyg och koder som du har producerat.
- Curriculum vitae (CV) Lista över publicerade vetenskapliga artiklar Verifierade kopior av betyg och examensbevis
- Kopior på relevanta arbeten som avhandlingar eller publikationer
- Kontaktuppgifter till minst tvåreferenspersoner

Du ansöker via vårt e-rekryteringssystem. Logga in och ansök via knappen längst ner på webbsidan. Välkommen med din ansökan senast 2020-08-03. Alla bifogade dokument ska vara i MS Word eller PDF format.

För mer information, vänligen kontakta universitetslektor Nathaniel Street, +46-(0)90-786 5473, nathaniel.street@umu.se.

Välkommen med din ansökan!

Institutionen för fysiologisk botanik är en del av Umeå Plant Science Centre med cirka 200 medarbetare som består av bland annat av 40 gruppledare och representerar för närvarande 48 olika nationaliteter (för mer information, se http://www.upsc.se eller http://www.plantphys.umu.se/english/). Vår huvudsakliga verksamhet är akademisk forskning och utbildning som innefattar områden som ekologi, biokemi, plant fysiologi samt genomik.

Umeå universitet vill erbjuda en jämställd och jämlik miljö där öppna samtal mellan människor med olika bakgrund och perspektiv lägger grunden för lärande, skaparkraft och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och erfarenheter att söka den aktuella anställningen.

Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser.

Varaktighet, arbetstid
100. Tillträde: 1 september eller enligt överenskommelse Tillsvidareanställning

Ersättning
månadslön

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2020-08-03
Klicka på denna länk för att göra din ansökan

Företag
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet

Arbetsgivarens referens
Arbetsgivarens referens för detta jobb är "AN 2.2.1-984-20".

Omfattning
Detta är ett heltidsjobb.

Arbetsgivare
Umeå Universitet (org.nr 202100-2874)

Arbetsplats
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet

Jobbnummer
5294300

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Första forskningsingenjör inom genomassembly och bioinformatik

Prenumerera på jobb från Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet