Forskningsingenjör

Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet / Biologjobb / Umeå
2019-03-15
Observera att sista ansökningsdag har passerat.
➡️ Klicka här för den senare publicerade platsannonsen "Forskningsingenjör" (publicerad 2024-06-03) ⬅️

Visa alla biologjobb i Umeå, Vännäs, Nordmaling, Vindeln, Robertsfors eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet i Umeå, Nordmaling, Örnsköldsvik, Kiruna, Huddinge eller i hela Sverige

Umeå universitet satsar på kreativa miljöer för studier och arbete. Hos oss finns attraktiva utbildningar, världsledande forskning och utmärkta innovations- och samverkansmöjligheter. Fler än 4 000 medarbetare och 33 000 studenter har redan valt Umeå universitet. Välj oss du också.

Vi söker en forskningsingenjör för att arbeta med bioinformatisk storskalig analys av sekvensdata från historiska luftfilter med syfte att identifiera patogener.

Anställningen är på heltid och är tidsbegränsad till 10 månader. Tillträde 1:a maj 2019 eller enligt överenskommelse. Sista ansökningsdag är 2019-04-05.

Arbetsuppgifter
Du kommer att arbeta med analys av storskaliga sekvenseringsdata. Datat kommer från luftfilter som samlats in varje vecka under 40 år i Kiruna. Luftfiltren fångar upp DNA från i stort sett alla organismer i miljön. Allt från växter, svampar och djur till bakterier och virus. Din uppgift blir att identifiera ett antal definierade skadeorganismer i dessa data och följa hur deras förekomst förändrats under 40 år. Denna analys inkluderar pre-processning av sekvensdata, klassificering med hjälp av k-merbaserade verktyg (som Centrifuge och Kraken) samt verifiering med hjälp av mappning av sekvenser till referensgenom.

Projektet kommer att utföras i nära samarbete med Totalförsvarets forskningsinstitut (FOI) i Umeå, och delar av arbetet kan komma att förläggas på FOI.

Kompetenskrav
Vi söker dig som har en magisterexamen i biologi, statistik, programmering eller motsvarande. Du ska också ha erfarenhet av programmering och analys av sekvenseringsdata.

Programmeringsvana i Python och erfarenhet av arbete på Linuxbaserade beräkningskluster är meriterande. Erfarenhet av analys av stora Illuminabaserade dataset samt erfarenhet av shotgun-baserad metagenomik är också meriterande.

Ansökan
Du ansöker via vårt rekryteringssystem. Ansökan ska innehålla ett personligt brev, CV, styrkta kopior av betyg och intyg samt namn och kontaktinformation till minst två referenspersoner.

Kontakt
För mer information rörande befattningen vänligen kontakta Per Stenberg, per.stenberg@umu.se

Institutionen för ekologi, miljö och geovetenskap (EMG) bedriver forskning och forskarutbildning inom ämnena ekologi, miljövetenskap och naturgeografi. Institutionen har ca 150 medarbetare. För mer information, se www.emg.umu.se.

Umeå universitet vill erbjuda en jämställd och jämlik miljö där öppna samtal mellan människor med olika bakgrund och perspektiv lägger grunden för lärande, skaparkraft och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och erfarenheter att söka den aktuella anställningen.

Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser.

Varaktighet, arbetstid
100%. Tillträde: 2019-05-01 eller enligt överenskommelse Visstidsanställning

Publiceringsdatum
2019-03-15

Ersättning
Fast månadslön

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2019-04-05
Ange följande referens när du ansöker: AN 2.2.1-462-19
Klicka på denna länk för att göra din ansökan

Kontakt
Per Stenberg, forskare 090-786 96 46

Företag
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet

Adress
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet
Umeå universitet
90187 Umeå

Kontorsadress
Umeå universitet

Jobbnummer
4672141

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Forskningsingenjör

Prenumerera på jobb från Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet