Anställning som bioinformatiker vid BKV
Linköpings universitet / Kemiingenjörsjobb / Linköping
2025-06-17
Visa alla kemiingenjörsjobb i Linköping,
Mjölby,
Åtvidaberg,
Finspång,
Motala eller i
hela Sverige Visa alla jobb hos Linköpings universitet i Linköping,
Finspång,
Motala,
Norrköping,
Kinda eller i
hela Sverige Vi har kraften från över 40 000 studenter och medarbetare. Studenter som ger framtidshopp. Medarbetare som varje dag bidrar till att Linköpings universitet tar sig an samtidens utmaningar. Vår värdegrund vilar på trovärdighet, tillit och trygghet. Genom att vara modiga, tänka fritt och göra nytt skapar vi tillsammans, med stora och små handlingar, en bättre framtid. Välkommen att söka jobb hos oss!
Vi söker nu en bioinformatiker till Clinical Genomics inom cell- och neurobiologi.
Om jobbet
Arbetsuppgifterna definieras utifrån kompetens och intresse, men kommer i ett första skede omfatta underhåll och vidare utveckling av olika befintliga bioinformatiska arbetsflöden. Analyserna kommer till stor del att utföras på GPUer och en del av uppdraget kommer att omfatta arbete med effektiv datahantering och visualisering för att underlätta tolkning och i vissa fall klinisk rapportering. Arbetet utförs i nära samarbete med kliniskt verksam personal samt med Genomic Medicine Sweden. Rollinnehavaren kommer att vara inblandad i kontinuerlig utvärdering, utveckling och automation av robusta bioinformatiska analyser för att processa short- eller long-readsekvensering och RNA- för båda forsknings- och kliniskt bruk. Att vara intresserade av arbetsuppgifter som omfattar databashantering och mjukvaruutveckling vore positivt och erfarenhet med Python krävs.
Rollen innebär ett samarbete med anställda inom såväl akademin som sjukvården och frågor kring datasäkerhet är viktiga. Faciliteten har därför ett eget kluster och de anställda väntas bidra med stöd till underhåll och uppdatering av mjukvaror här. Det kommer att finnas möjlighet till publicering och presentation av både tekniska och biologiska resultat och metoder. Du kommer att jobba tillsammans med andra bioinformatiker, läkare och molekylärbiologer inom vår facilitet och även i nationella och internationella samarbeten.
Eftersom rollen även innefattar bioinformatiskt stöd till samarbetsprojekt med Genomic Medicine Sweden samt till forskare som arbetar med icke-modellorganismer, är ämnesspecifika förmågor inom relevanta områden särskilt önskvärda. De kan omfatta kunskaper inom mikrobiologi och antimikrobiell resistens, i synnerhet i samband med sekvensering med långa läsningar.
Om dig
Vi söker dig som tar ansvar för dina uppgifter och driver processer framåt. Du är strukturerad, gillar att samarbeta och kommunicerar väl med andra på ett lyhört och smidigt sätt.
Vi vill att du har:
• Mastersexamen i ämne med relevans för tjänsten t.ex. bioinformatik, datavetenskap eller motsvarande
• Minst två års erfarenhet av att arbeta i en forskningsmiljö med bioinformatik, genomik och tolkning av storskaliga data
• Kompetens till avancerad kompetens i hantering av vanliga och specialiserade bioinformatikverktyg och programvara
• Erfarenhet i att utforma och implementera bioinformatiska pipeliner
• God förmåga att kommunicera på engelska
• Dokumenterad förmåga inom scriptspråket Nextflow
• Erfarenhet av att arbeta i Linuxmiljö
• Förmåga att effektivt kommunicera fullständiga bioinformatiska koncept till både tekniska och icke-tekniska målgrupper
• En god förmåga att hantera och prioritera uppgifter effektivt
• En god förmåga att identifiera och lösa problem under dataanalys självständigt
• Goda praktiska kunskaper inom statistik
• Förmåga att hantera data från icke-modell organismer
• Praktiska kunskaper inom metagenomik
Det är meriterande om du har:
• Kännedom om git, conda eller liknande
• Kännedom om pipelineverktyg som Snakemake och Nextflow
• Erfarenhet av containermjukvaror som t.ex. Singularity (Apptainer)/Docker/Podman
• Erfarenhet av undervisning och utveckling av läromedel
• Kunskap om MetaAMR pipeline för metagenomik
Din arbetsplats
Du kommer arbeta på Clinical Genomics Corefaciliteten som tillhör både avdelningen för cell- och neurobiologi (CNB) på Institutionen för biomedicinska och kliniska vetenskaper (BKV) och medicinska fakulteten.
Läs mer om vår verksamhet här.
Om anställningen
Visstid, 6 månader.
Urval av sökanden kommer att ske under vecka 33.
Tillträde enligt överenskommelse.
Lön och förmåner
Linköpings universitet tillämpar individuell lönesättning.
Läs mer om förmåner för anställda här.
Publiceringsdatum2025-06-17Facklig kontaktInformation om fackliga kontaktpersoner, se Hjälp för sökande.
Så ansöker duVälkommen att skicka in din ansökan med CV och ansökningsbrev senast den 8 juli 2025. Du söker denna anställning genom att klicka på knappen "Ansök" här nedan. Ansökan som inkommer efter sista ansökningsdag kommer inte att beaktas.
Vi välkomnar sökande med olika bakgrund, erfarenheter och perspektiv, det berikar och utvecklar vår verksamhet. För oss är det självklart att värna om allas lika värde, rättigheter och möjligheter. Läs om vårt arbete med Lika villkor.
Välkommen med din ansökan!
Linköpings universitet har upphandlade avtal och undanber oss direktkontakt från bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av platsannonser.
Ersättning LiU tillämpar individuell lönesättning.
Så ansöker du Sista dag att ansöka är 2025-07-08
Klicka på denna länk för att göra din ansökan Omfattning Detta är ett heltidsjobb.
Arbetsgivare Linköpings Universitet (org.nr 202100-3096),
https://www.liu.se/ Kontakt Professor
Colum Walsh
colum.walsh@liu.se 013-28 19 11 Jobbnummer 9392143