Forskare i mikrobiella parasiters genom
Uppsala universitet, Institutionen för organismbiologi / Kemiingenjörsjobb / Uppsala
Observera att sista ansökningsdag har passerat.
Visa alla kemiingenjörsjobb i Uppsala,
Östhammar,
Sigtuna,
Österåker,
Håbo eller i
hela Sverige Visa alla jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för organismbiologi i Uppsala Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 44.000 studenter, 7.100 anställda och en omsättning på 7 miljarder kronor.
Vid institutionen för organismbiologi bedriver vi undervisning och forskning om evolution, utveckling och funktion i hela organismer.
För mer information se
http://www.iob.uu.se.Anställningen är placerad i Dr Fabien Burkis forskargrupp vid systematisk biologi (
https://www.burki-lab.net/). Projektbeskrivning: Studera evolution och specifika anpassningar till parasitism i Ascetosporea, ett allt ökande hot i marina miljöer som hittills inte har undersökts med moderna molekylära verktyg. Ascetosporea är en samling av dåligt karakteriserade mikrobiella eukaryota parasiter på marina ryggradslösa djur. De är mest kända för att inbegripa de dödliga patogener på ostron och musslor, som kostar miljontals dollar i den växande vattenbruksindustrin. Hittills saknas Ascetosporea bland de modeller som beskriver evolution av parasitism eftersom jämförande genomiska data saknas för gruppen. Detta beror på bland annat på att organismerna har mycket små celler, att det saknas cellinjer för värddjuren, och metoder för att odla parasiterna in vitro. I det här projektet föreslår vi att övervinna dessa utmaningar genom att använda mikromanipulation och genom/transkriptome sekvensering på singel- cellnivå. Vi kommer att sekvensera de novo genom och transkriptom från flera parasiter som hittills inte kunnat odlas, och som omfattar mångfalden inom Ascetosporea, samt gruppens närmaste frilevande släktingar. Med dessa data kommer vi att kunna få en översikt över evolutionen av parasitism i Ascetosporea, dvs. identifiera pre-parasitiska tillstånd, parasitiska innovationer, och linjespecifika anpassningar med hjälp av jämförande genomik.
Arbetsuppgifter: Utföra lab-experiment för att få tillräckligt med DNA för genomik och transkriptomik; utveckla, mikrofluidteknik och / eller emulsionsbaserade metoder för att förbättra 'single-cell' genomsekvensering; utföra kvalitetskontroller för att säkerställa att materialet kan sekvenseras på valda plattformar; generera och utvärdera genomenheter från blandade prover; analysera genomdata i samband med utvecklingen och mångfalden i Ascetosporea.
Kvalifikationskrav: Doktorsexamen i biologi. Vi söker en starkt motiverad, entusiastisk och arbetsvillig individ med mycket god akademisk kompetens inom området för (mikrobiell) eukaryot utveckling. Du som söker ska ha en kombination av laborativa och bioinformatiska färdigheter: dokumenterade erfarenheter i encells-genomik / transkriptomik; dokumenterad erfarenhet inom bioinformatik att montera och annotera genom och transkriptom; erfarenhet inom mikrofluidteknik. Erfarenhet med flera high-throughput sequencing platforms, inklusive 10X genomics. Flytande i engelska i både tal och skrift.
Önskvärt/meriterande i övrigt: Erfarenhet i fylogenetik / fylogenomik är meriterande.
Uppsala universitet värdesätter de kvaliteter som jämn könsfördelning och mångfald tillför verksamheten. Vi ser därför gärna sökande av alla kön och med olika födelsebakgrund, funktionalitet och livserfarenhet.
Lön: Individuell lönesättning.
Tillträde: 2020-01-01 eller enligt överenskommelse.
Anställningsform: Tidsbegränsad anställning t.o.m. 2021-09-30.
Anställningens omfattning: 100%
Upplysningar om anställningen lämnas av: Fabien Burki, telefonnummer +46 18 471 2779, e-post
fabien.burki@ebc.uu.seVälkommen med din ansökan senast den 2 december 2019, UFV-PA 2019/3937.
Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.
Varaktighet, arbetstid
100%. Tillträde: 2020-01-01 Visstidsanställning
Publiceringsdatum2019-11-18ErsättningIndividuell lönesättning
Så ansöker duSista dag att ansöka är 2019-12-02
Klicka på denna länk för att göra din ansökanFöretagUppsala universitet, Institutionen för organismbiologi
Arbetsgivarens referens Arbetsgivarens referens för detta jobb är "UFV-PA 2019/3937".
Omfattning Detta är ett heltidsjobb.
Arbetsgivare Uppsala Universitet (org.nr 202100-2932)
Arbetsplats Uppsala universitet, Institutionen för organismbiologi
Jobbnummer 4961756
Observera att sista ansökningsdag har passerat.