Bioinformatiker
Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och patologi / Laborantjobb / Uppsala
Observera att sista ansökningsdag har passerat.
Visa alla laborantjobb i Uppsala,
Östhammar,
Sigtuna,
Österåker,
Håbo eller i
hela Sverige Visa alla jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och patologi i Uppsala,
Stockholm eller i
hela Sverige Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl.
a cancer, autoimmuna och genetiska sjukdomar. En av grundtankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom cancerprecisionsmedicin, cancerimmunterapi, genomik och neurobiologi, molekylära verktyg och funktionsgenomik, neuroonkologi och neurodegeneration samt vaskulärbiologi. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar, fristående kurser och internationella masterprogram inom den medicinska fakulteten och teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet. Institutionen omsätter omkring 500 miljoner kronor, varav drygt hälften är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 345, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 700 verksamma i arbetsstyrkan. Läs gärna mer om institutionens verksamhet här:
http://www.igp.uu.seArbetsuppgifter
Personen kommer arbeta med analys av longread-sekvenseringsdata från PacBio och Oxford Nanopore från sekvensering av humangenom. Målet är att bygga, validera och applicera en pipeline för bioinformatiska analyser av humana genom inklusive alignment, variantanalys, assembly som kan kopplas till verktyg för identifiering av kliniskt relevanta varianter. Nya verktyg behöver också sättas upp för analys av epigenetiska data från longread-sekvensering.
Personen kommer ha möjlighet att vara delaktig i analys av stora dataset där en viktig del kommer vara att bygga upp en databas för filtrering av vanliga varianter i arvsmassan. Detta arbete kommer ske inom samarbetsprojekt med både forskare och kliniskt verksamma där det är viktigt att den anställde arbetar bra med andra i både mindre grupper och större konsortier.
Vidare kommer den anställde stödja bioinformatikverksamheten vid Uppsala Genomcenter avseende hantering av hårdvara och hantering av internt producerad sekvenseringsdata.
Kvalifikationskrav
Sökande ska ha genomgått en grundutbildning i biomedicin, bioteknik, bioinformatik eller motsvarande. Vana att arbeta i unixmiljö är ett krav. Personen skall ha erfarenhet av att arbeta med humangenom baserat på longread-sekvenseringsdata från PacBio och Oxford Nanopore inklusive alignment, variant calling, assembly, repeatexpansionsanalys och metyleringsanalys, samt kunna visualisera och presentera genetiska data. God förmåga att uttrycka sig såväl muntligt som skriftligt på engelska. God samarbets- och kommunikationsförmåga. Då utvecklingen inom området sker mycket snabbt krävs en person som har förmåga att testa, utvärdera och anpassa analyser.
Önskvärt/meriterande i övrigt
Erfarenhet av att arbete på UPPMAX/Bianca är önskvärt. Sökande behöver ha god arbetsdisciplin och noggrannhet. Stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet.
Om anställningen
Anställningen är tillsvidare, provanställning kan tillämpas. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala
Upplysningar om anställningen lämnas av: Susanne Hellstedt Kerje,
susanne.kerje@igp.uu.seVälkommen med din ansökan senast den 5 januari 2024, UFV-PA 2023/4879.
Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 500 anställda och 54 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser.
Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet
https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.
Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.
Ersättning Individuell lönesättning
Så ansöker du Sista dag att ansöka är 2024-01-05
Klicka på denna länk för att göra din ansökan Arbetsgivarens referens Arbetsgivarens referens för detta jobb är "UFV-PA 2023/4879".
Omfattning Detta är ett heltidsjobb.
Arbetsgivare Uppsala Universitet (org.nr 202100-2932)
Arbetsplats Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och patologi
Jobbnummer 8331807
Observera att sista ansökningsdag har passerat.