Postdoktor i Mikrobiomanalys
Göteborgs universitet / Högskolejobb / Göteborg
2024-08-22
Visa alla högskolejobb i Göteborg,
Mölndal,
Partille,
Kungälv,
Lerum eller i
hela Sverige Visa alla jobb hos Göteborgs universitet i Göteborg,
Partille,
Lysekil,
Uddevalla,
Vänersborg eller i
hela Sverige Göteborgs universitet möter samhällets utmaningar med mångsidig kunskap. 56 000 studenter och 6 600 medarbetare gör universitetet till en stor och inspirerande arbetsplats. Stark forskning och attraktiva utbildningar lockar forskare och studenter från hela världen. Med ny kunskap och nya perspektiv bidrar Göteborgs universitet till en bättre framtid.Institutionen för medicin, Avdelningen för molekylär och klinisk medicin, bedriver translationell forskning främst kring metabolism, diabetes, fetma och kardiovaskulär sjukdom i syfte att förbättra hälsa och sjukvård i samhället. Det övergripande målet är att skapa en excellent translationell forskningsmiljö av mycket hög internationell standard.
Vi har fler bakterier än egna celler i kroppen och dessa bakterier samverkar med varandra i ekosystem, mikrobiota, vilken kan påverka hur vi mår. Genom att kombinera kliniska prover och gnotobiotiska djurmodeller har vi visat att tarmmikrobiotan påverkar vår fysiologi och metabolism. Vi söker nu en postdoktor som kan analysera tarmmikrobiotan och upptäcka specifika mikrobiella modulatorer för ämnesomsättningsrelaterade sjukdomar genom att kvantifiera och karaktärisera bakteriella genom.
Ämne
Mikrobiomanalys
Ämnesbeskrivning
Tarmmikrobiotan, som är sammansatt av biljoner mikroorganismer, spelar en viktig roll för människors hälsa genom att förbättra nedbrytning av mat, producera viktiga vitaminer, skydda mot infektioner och utbilda immunsystemet. De sammantagna genomen från dessa mikroorganismer, kallade tarmmikrobiomet, kodar för funktioner som saknas i det mänskliga genomet och kan därmed påverka värdens fysiologi. Följaktligen har förändringar i mikrobiomet associerats med sjukdomar, såsom kardiometabola sjukdomar, inflammatoriska tarmsjukdomar, allergier, autoimmuna sjukdomar och psykiska sjukdomar. Denna kunskap är baserad på data från sekvensering av mikrobiomet i metagenomiska studier, vilka har revolutionerat vår förståelse av mikrobiomet under de senaste två decennierna.
Arbetsuppgifter
Den sökande kommer framförallt utveckla och använda metoder för att upptäcka och kvantifiera mikroorganismer på stamnivå. En huvudsaklig arbetsuppgift kommer innebära att sätta samman och analysera mikrobiella genom samt beskriva distributionen av genom från metagenomdata från tarmen hos människa. Den sökande kommer att beskriva den möjliga ekologiska funktionen och dess fitness i tarmen hos människor vilket kommer underlätta vidare isolering av representativa stammar.
Arbetet kommer även inkludera karaktärisering av genom från fekala bakterieisolat som vi har isolerat samt konstruera en täckande katalog av genom av hög kvalitet baserat på NCBI Reference Sequence Database (RefSeq;
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/). Genom att använda kliniska data och metabolomik ska den sökande identifiera associationer mellan bakterieisolaten och hälsa, särskilt metabolhälsa, hos människor. Dessutom kommer kandidaten att annotera gener i olika bakteriegenom samt analysera transkriptom av enskilda bakterieisolat och fekala bakteriekulturer.
Behörighet
Behörig att anställas som postdoktor är den som innehar doktorsexamen i relevant ämnesområde, eller en utländsk examen som bedöms
motsvara doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas.
I första hand bör den komma i fråga som har avlagt examen högst tre år före ansökningstidens utgång. Även den som avlagt examen
tidigare bör komma i fråga om det finns särskilda skäl. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet,
förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, tjänstgöring inom totalförsvaret, eller andra liknande omständigheter samt klinisk
tjänstgöring eller för ämnesområdet relevant tjänstgöring/uppdrag.
Bedömningsgrunder
Doktorsexamen och stark forskningsbakgrund i att analysera tarmmikrobiom är ett krav. Dokumenterad erfarenhet i bakteriell genomik, inklusive fager, helgenom 'shotgun' sekvensering och transkriptomik från dataprocess till analys är ett krav. Kunskap i programmering (e.g. R och/eller Python) är krav. Erfarenhet av vetenskaplig skrivprocess är en merit. Internationell erfarenhet, till exempel utländsk doktorandexamen, är meriterande och det är viktigt att den sökande kan samarbeta väl med andra forskare och kliniker inom ett större team och stor vikt läggs på personliga egenskaper som till exempel initiativtagande och vara flexibel. Goda kunskaper i engelska i tal och skrift är ett krav.
Anställning
Anställningsform: Tidsbegränsad anställning, 36 månader
Omfattning: 100%
Placering: Institutionen för medicin, Göteborg
Tillträde: Snarast
Kontaktuppgifter för anställningen
Fredrik Bäckhed
Professor
0702-18 23 55
Fredrik.Backhed@wlab.gu.seMalin Levin
Avdelningschef
Malin.Levin@wlab.gu.seFackliga organisationer
Fackliga företrädare vid Göteborgs universitet hittar du här:
https://www.gu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss/hjalp-for-sokande Ansökan
Bifoga doktorsexamensbevis vid ansökan, i de fall som examensbeviset ännu inte är utfärdat bifogas det senast vid den tidpunkt
då anställningsbeslut skall fattas.
Du söker anställningen via Göteborgs universitets rekryteringsportal genom att registrera din ansökan elektroniskt via hemsidan:
https://www.gu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss/lediga-anstallningar. Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.
Ansökan ska vara inkommen senast: 2024-09-12
Universitetet arbetar aktivt för en arbetsmiljö med jämställda förhållanden och sätter värde på de kvalitéer mångfald tillför verksamheten.
Universitetet tillämpar individuell lönesättning.
Enligt Riksarkivets föreskrifter är universitetet skyldigt att förvara ansökningshandlingar i två år efter tillsättningsbeslutet. Om du som sökande till en anställning särskilt begär tillbaka dina handlingar återsänds de när de två åren har förflutit, i annat fall kommer de att gallras ut.
Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Göteborgs universitet anlitar upphandlad annonsbyrå i samband med rekrytering av personal. Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av jobbannonser.
Ersättning Göteborgs universitet tillämpar individuell lönesättning.
Så ansöker du Sista dag att ansöka är 2024-09-20
Klicka på denna länk för att göra din ansökan Omfattning Detta är ett heltidsjobb.
Arbetsgivare Göteborgs Universitet (org.nr 202100-3153),
http://www.gu.se/ Arbetsplats Göteborgs universitet
Jobbnummer 8856169