Bioinformatiker/systemutvecklare

Stockholms Universitet / Biologjobb / Stockholm
Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Visa alla biologjobb i Stockholm, Solna, Lidingö, Sundbyberg, Danderyd eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Stockholms Universitet i Stockholm, Solna, Sundbyberg, Sollentuna, Täby eller i hela Sverige

vid Institutionen för biokemi och biofysik. Sista dag att ansöka är 2019-01-06.

SciLifeLab (www.scilifelab.se) är ett nationellt centrum för storskalig livsvetenskaplig forskning med en avancerad teknologisk infrastruktur. Vid SciLifeLab utförs multidisciplinär forskning baserad på DNA sekvensering, genexpressionsanalys, proteomik, bioinformatik, biostatistik och systembiologi. Målsättningen är att göra det möjligt för svenska forskare att analysera gener, transkript och proteiner i olika organismer i avsikt att klarlägga molekylära mekanismer relaterade till hälsa och miljö. Exempel på tematiska forskningsområden som för närvarande bearbetas inom SciLifeLab är klinisk genomik/proteomik, cancergenomik och komplexa sjukdomars genomik samt ekologisk och miljörelaterad genomik. Bioinformatik och systembiologi är centrala aktiviteter inom centret, och en betydande del av personalen vid SciLifeLab arbetar inom dessa områden.

National Genomics Infrastructure (NGI, ngisweden.scilifelab.se/about) är den största tekniska plattformen på SciLifeLab. Det är en nationell resurs som erbjuder en toppmodern infrastruktur för DNA-sekvensering och SNP-genotypning till forskare över hela Sverige. Genom att ge tillgång till avancerad teknik inom genomik och tillhandahålla riktlinjer och stöd för provsamling, studiedesign, protokollval och bioinformatikanalys, hoppas vi kunna möjliggöra världsledande forskning.

Publiceringsdatum
2018-12-10

Dina arbetsuppgifter
Vi söker en bioinformatiker/systemutvecklare till vårt produktionsteam på NGI som ska arbeta med kvalitetskontroll, analys och leverans av sekvensdata. Arbetet kommer även att innefatta utveckling, förbättring och underhåll av informatiklösningar för hantering av produktionens interna dataflöden. Fördelningen mellan de olika arbetsuppgifterna kommer att bero på den sökandes erfarenhet.

Arbetsuppgifterna innefattar bland annat följande:

• Kvalitetskontroll och leverans av sekvensdata.
• Analys av sekvensdata enligt "best-practice"-protokoll samt tolka och bedöma analysresultat.
• Systemadministration av centrala IT-system.
• Koordinering av programvaruinstallationer och underhåll av analysservrar.
• Automatisering av data- och analysflöden.
• Underhåll och utveckling av interna informationsdatabaser.
• Besvara supportärenden och kommunicera med externa beställare.
• Visualisering av processförlopp och resultat.

Kvalifikationer

• Högskoleexamen inom bioinformatik eller datavetenskap, alternativt molekylärbiologi/bioteknik med inriktning mot databehandling eller motsvarande kompetens.
• Utmärkta programmeringskunskaper. Erfarenhet att arbeta med Python, Perl, Java eller C/C++.
• Erfarenhet av arbete med versionshanteringsverktyg som git.
• Väl förtrogen med att arbeta i Linux-/Unixmiljö.

Meriterande

• Tidigare erfarenhet av att analysera NGS data.
• Erfarenhet av användning av datorkluster (HPC eller Cloud).
• Erfarenhet av webbapplikationsutveckling, databasadministration.
• Erfarenhet av att arbeta med LIMS (Laboratory Information Management Systems).

Utmärkt kommunikations- och samarbetsförmåga, samt att obehindrat tala och skriva engelska är också viktigt i rollen.

Anställningsvillkor
Anställningen avser heltid och gäller tills vidare med sex månaders provanställning. Tillträde snarast eller enligt överenskommelse. Administrativt kommer anställningen att placeras vid Institutionen för biokemi och biofysik, Stockholms universitet.

Stockholms universitet strävar efter att vara en arbetsplats som är fri från diskriminering och ger lika möjligheter för alla.

Kontaktuppgifter för detta jobb
Närmare information om anställningen lämnas av Pär Lundin, par.lundin@scilifelab.se.

Fackliga företrädare
Ingrid Lander (Saco-S), tfn 0708-16 26 64, saco@saco.su.se, Lisbeth Häggberg (Fackförbundet ST/Lärarförbundet), tfn 08-16 40 17, st@st.su.se, samt seko@seko.su.se (SEKO).

Så ansöker du
Du söker anställningen via Stockholms universitets rekryteringssystem. Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

Bifoga endast personligt brev och CV. Kopior på betyg och intyg tar du med vid en eventuell intervju.

Anvisningar för sökande finns på webbsidan: anvisningar - sökande.

Välkommen med din ansökan!

Stockholms universitet - forskning, utbildning och samverkan i den internationella frontlinjen.

Varaktighet, arbetstid
Tillsvidare med 6 månaders provanställning. Ej specificerat

Ersättning
Stockholms universitet tillämpar individuell lönesättning.

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2019-01-06
Klicka på denna länk för att göra din ansökan

Företag
Stockholms universitet

Adress
Stockholms universitet
Svante Arrhenius väg 16c
10691 Stockholm

Kontorsadress
Svante Arrhenius väg 16c

Jobbnummer
4500328

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Bioinformatiker/systemutvecklare

Prenumerera på jobb från Stockholms Universitet