Postdoktor inom spatial och single cell bioinformatik

Kungliga Tekniska högskolan, / Kemistjobb / Solna
Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Prenumerera på nya jobb hos Kungliga Tekniska högskolan,

Visa alla kemistjobb i Solna, Sundbyberg, Stockholm, Danderyd, Lidingö eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Kungliga Tekniska högskolan, i Solna, Stockholm, Huddinge eller i hela Sverige

KTH är ett av Europas ledande tekniska universitet och en viktig arena för kunskapsutveckling. Som Sveriges största universitet för teknisk forskning och utbildning samlar vi studenter, forskare och fakultet från hela världen. Vår forskning och utbildning omfattar såväl naturvetenskap som alla grenar inom teknik samt arkitektur, industriell ekonomi, samhällsplanering, historia och filosofi.



Tjänsten kommer att vara placerad vid Institutionen för Genteknologi, KTH förlagt till Science for Life Laboratory i Stockholm invid Karolinska Institutet.


Publiceringsdatum
2018-12-21

Dina arbetsuppgifter
Arbetet kommer att bestå av utveckling av bioinformatik/beräkningsmetodik för att studera genuttryck i enskilda celler och i vävnadssnitt som kombineras med bilddata. Ett speciellt fokus är på spatial transkriptomics tekniken (Ståhl et al Science 2016; Salmen et al. Nat Prot 2018), utvecklat i ett samarbete mellan KTH och KI, som ger en beskrivning av mRNA vävnadssnitt (dvs RNA seq och imaging data). Det föreslagna projektet syftar till att inkluderas som en del av projektet Human Developmental Atlas Atlas vid SciLifeLab.

I detta projekt använder vi ett flertal verktyg som scRNA Seq, spatial transcriptomics, in situ-sekvensering och CODEX-proteinanalys för att beskriva och katalogisera gener som är involverade i mänsklig utveckling av hjärnan, hjärtat och lungorna. En nyckelkomponent för den utlysta positionen är att ge ny biologisk kunskap till de studerade systemen som kräver viss förståelse för de undersökta vävnaderna. Detta projekt kommer att vara i samarbete med interna och externa experimentella och bioinformatikforskare.

Kvalifikationer
Den sökande kandidaten skall ha en doktorsexamen (eller motsvarande) inom datavetenskap, matematik, fysik, bioinformatik, molekylärbiologi, bioteknik eller relaterat område med stark bakgrund och kunskap om molekylärbiologi. Grundlig erfarenhet av Unix (eller en variant därav), R, skriptprogramvara (t ex Python) eller andra programmeringsspråk, såsom C ++, krävs.

Erfarenhet av hantering av stora sekvenseringsdatasatser och utveckling av bioinformatik metoder är mycket önskvärt. Möjligheten att arbeta både självständigt och samarbetet är högt värderat. Mycket goda kunskaper i engelska både skriftligt och i tal är ett krav. Postdoktor / Forskare kommer att vara anställd vid KTH Kungliga Tekniska Högskolan och arbetsplatsen är på SciLifeLab Stockholm.

Fackliga representanter

Du hittar kontaktuppgifter till fackliga representanter på KTH:s webbsida.

Så ansöker du
Ansökan skall innefatta följande handlingar:
1. Curriculum vitae (1-2 sidor)
2. Betygsavskrift från högskolan/universitet eller motsvarande
3. Kortfattad redogörelse varför den sökande är intresserad av tjänsten.
4. Kontaktinformation till ett par referenspersoner.

Du ansöker via KTH:s rekryteringssystem. Du som sökande har huvudansvaret för att din ansökan är komplett när den skickas in.

Ansökan ska vara KTH tillhanda senast sista ansökningsdagen vid midnatt, CET/CEST (Central European Time/Central European Summer Time).

Övrig information
Jämställdhet, mångfald och avståndstagande från alla former av diskriminering är både en kvalitetsfråga och en självklar del av KTH:s värdegrund.

För information om Behandling av personuppgifter i samband med rekrytering läs mer här.

Vi undanber oss direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av platsannonser.

Varaktighet, arbetstid
100%. Tillträde: Enligt överenskommelse Visstidsanställning

Ersättning
Månadslön

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2019-01-20
Ange följande referens när du ansöker: C-2018-2007
Klicka på denna länk för att göra din ansökan

Kontakt
Joakim Lundeberg, Professor joakim.lundeberg@scilifelab.se

Företag
Kungliga Tekniska högskolan,

Adress
Kungliga Tekniska högskolan,
Brinellvägen 8
10044 Stockholm

Kontorsadress
Brinellvägen 8

Jobbnummer
4524236

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Prenumerera på jobb från Kungliga Tekniska högskolan,

Fyll i din e-postadress för att få e-postnotifiering när det dyker upp fler lediga jobb hos Kungliga Tekniska högskolan,: