Bioinformatiker

Uppsala universitet, Institutionen för farmaceutisk biovetenskap / Kemiingenjörsjobb / Uppsala
2025-09-30


Visa alla kemiingenjörsjobb i Uppsala, Östhammar, Sigtuna, Österåker, Håbo eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för farmaceutisk biovetenskap i Uppsala

Institutionen för farmaceutisk biovetenskap

Institutionen för farmaceutisk biovetenskap är en interdisciplinär miljö där 10 forskningsområden arbetar för att bidra till bättre läkemedel och en friskare värld.

Med laboratorier i hjärtat av Uppsala Biomedicinskt Centrum och Sveriges enda Farmaceutiska fakultet utgör vi en vital motor i utvecklingen av utbildning och forskning inom de farmaceutiska vetenskaperna. Mer information om institutionen och dess verksamhet finns på https://uu.varbi.com/center/tool/position/857585/edit/tab:2/uu.se/farmbio.

Publiceringsdatum
2025-09-30

Beskrivning
Infrastrukturplattformen "Spatial Biology", SciLifeLab befinner sig i en stark expansionsfas och satsar på att utveckla avancerade metoder för integrerad analys av biologiska system. Vi rekryterar nu en bioinformatiker med särskild inriktning mot avbildande masspektrometri. Tjänsten är en del av en strategisk förstärkning med ytterligare tre andra bioinformatiker inom plattformen Spatial Biology. Tillsammans kommer ni att bilda ett dataanalysteam som arbetar med att utveckla verktyg och metoder för integrerade multiomikstudier.

Som en del av detta team får du en nyckelroll i att utveckla beräkningsmetoder, analysera komplexa dataset och bidra till integrativa omiksatsningar i nära samarbete med forskare inom olika discipliner. Rollen erbjuder stora möjligheter att påverka både den tekniska utvecklingen och den vetenskapliga inriktningen i ett snabbt växande forskningsfält. Vi söker en motiverad och skicklig bioinformatiker till enheten för Avbildande Masspektrometri.

Dina arbetsuppgifter
Arbetsuppgifterna kommer framför allt fokusera på analys, hantering och integrering av spatialt upplöst metabolomik- och proteomikdata som genereras genom avancerad avbildande masspektrometri (MSI).

- Utföra omfattande analyser av komplexa dataset från avbildande masspektrometri (t.ex. MALDI/DESI-MSI) med etablerade beräkningsverktyg.
- Utveckla och implementera nya algoritmer samt visuella analysverktyg för spatial kartläggning av metaboliter, lipider och proteiner.
- Säkerställa att datahantering följer FAIR-principerna (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable), inklusive standardisering av metadata och långsiktigt bevarande av data.
- Tillhandahålla expertstöd inom bioinformatik i alla steg av projekt inom avbildande masspektrometri - från experimentell design och datainsamling till avancerad multivariat statistisk modellering och biologisk tolkning.
- Bidra till integrativa satsningar inom spatial omik genom att kombinera masspektrometridata med andra spatiala modaliteter (t.ex. transkriptomik, proteomik, histologi och kliniska metadata).

Kvalifikationer
- Avlagt doktorsexamen inom bioinformatik, beräkningsbiologi, systembiologi eller närliggande område eller förvärvat motsvarande vetenskaplig kompetens.
- Goda kunskaper i Python och R, särskilt för dataanalys, visualisering och hantering av högdimensionella bild- och masspektrometridata.
- Erfarenhet av att utforma och underhålla reproducerbara och skalbara analysarbetsflöden.
- Gedigen grund i statistik och maskininlärning tillämpad på omik-data.
- Kännedom om offentliga datastandarder och databaser relevanta för metabolomik/proteomik.
- Stark kommunikativ förmåga på engelska, både skriftligt och muntligt.
- God samarbetsförmåga, med förutsättningar att arbeta effektivt i tvärvetenskapliga forskarteam.

Meriterande
- Praktisk erfarenhet av bearbetning av data från avbildande masspektrometri.
- Kunskap inom vävnadssegmentering, rumslig registrering eller histologibaserad dataanpassning.
- Erfarenhet av högpresterande datorresurser och molnbaserade analysplattformar.

Om anställningen

Anställningen kommer att vara placerad vid institutionen för farmaceutisk biovetenskap, vid Uppsala universitet.

Anställningen är tillsvidare med ev provanställning. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse, senast 2026-01-01

Upplysningar om anställningen lämnas av professor Per Andrén e-post mailto:per.andren@uu.se och av universitetslektor Anna Nilsson, e-post mailto:anna.m.nilsson@uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 31 oktober 2025, UFV-PA 2025/2824

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 600 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet
https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/

Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.

Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Fackliga företrädare: Saco-S - saco-s@uu.se, Seko - seko@uadm.uu.se, ST (OFR/S) - ofr@uu.se

Ersättning
Individuell lönesättning

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2025-10-31
Klicka på denna länk för att göra din ansökan

Arbetsgivarens referens
Arbetsgivarens referens för detta jobb är "UFV-PA 2025/2824".

Omfattning
Detta är ett heltidsjobb.

Arbetsgivare
Uppsala Universitet (org.nr 202100-2932)

Arbetsplats
Uppsala universitet, Institutionen för farmaceutisk biovetenskap

Jobbnummer
9532593


Prenumerera på jobb från Uppsala universitet, Institutionen för farmaceutisk biovetenskap

Fyll i din e-postadress för att få e-postnotifiering när det dyker upp fler lediga jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för farmaceutisk biovetenskap: