Universitetslektor i bioinformatik

Sveriges lantbruksuniversitet / Högskolejobb / Uppsala
2019-11-07
Observera att sista ansökningsdag har passerat.
➡️ Klicka här för den senare publicerade platsannonsen "Universitetslektor i bioinformatik" (publicerad 2021-05-09) ⬅️

Visa alla högskolejobb i Uppsala, Östhammar, Sigtuna, Österåker, Håbo eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Sveriges lantbruksuniversitet i Uppsala, Östhammar, Solna, Stockholm, Ekerö eller i hela Sverige

Fakulteten för veterinärmedicin och husdjursvetenskap
Institutionen för husdjursgenetik
Ämnesbeskrivning
Bioinformatik kombinerar datavetenskap, statistik, matematik, artificiell intelligens och ingenjörsvetenskap för att analysera och tolka biologiska data. Bioinformatiken är avgörande för analyser av data från sekvensering av olika arters genom, transkriptom (vilka gener är aktiva och hur aktiva är de) och proteom (från RNA till protein). Inom bioinformatiken genomförs allt mer komplicerade studier som genererar stora mängder data (Big Data). Big Data och nätverksanalyser är nödvändiga när man t ex studerar olika typer av mikrobiom (alla mikroorganismer i en viss miljö).
Andra viktiga delar av bioinformatiken är utveckling och hantering av databaser som blir tillgängliga för forskare genom nationella och internationella infrastrukturer och projekt. Dessa forskare kan arbeta med husdjur, vilda djur, skog, växter och mikroorganismer i många olika forskningsfält.
Bioinformatiker arbetar med att organisera, strukturera, lagra och analysera stora mängder data som idag produceras av "High Throughput"-teknologier (NGS, Big Data, proteomik, metabolomik). Bioinformatiker analyserar och organiserar information från projekt där man arbetar med virus, bakterier, nematoder, växter, vilda djur, husdjur och människors genetik.

Publiceringsdatum
2019-11-07

Dina arbetsuppgifter
I anställningen ingår undervisning i bioinformatik på grund och avancerad nivå och forskning inom ämnet bioinformatik. Till undervisning räknas kursledning, undervisningsutveckling, teoretisk och praktisk undervisning samt examination. En av de viktigaste uppgifterna för universitetslektorn kommer att vara utvecklingen av SLUs nya "Masterprogram i bioinformatik för naturresurser". Masterprogrammet kommer att vara på engelska men många kurser på grundläggande nivå ges på svenska och universitetslektorn förväntas kunna arbeta på svenska inom fyra år efter anställningen.

Vidare ska universitetslektorn bidra till utvecklingen av ämnet bioinformatik. I detta ingår egen forskning inom bioinformatik med för VH-fakulteten och även SLU relevanta frågeställningar, samt handledning av forskarstuderande.
Uppdrag och administrativt arbete på institutions- och fakultetsnivå kommer att ingå. Universitetslektorn kommer även medverka i arbetet med SLUs infrastruktur för bioinformatik (SLUBI) samt den svenska nationella bioinformatikinfrastrukturen (NBIS).

Behörighet
De sökande ska

• ha avlagt doktorsexamen inom ett, för anställningen, relevant ämne eller ha motsvarande vetenskapliga kompetens
• vara vetenskapligt skicklig inom ämnet för anställningen
• vara pedagogiskt skicklig och ha genomgått högskolepedagogisk utbildning motsvarande 10 veckors heltidsstudier (eller på annat sätt förvärvat motsvarande kunskaper)
• ha goda kunskaper i engelska
• ha en forskarutbildning inom ett naturvetenskapligt ämne
• ha dokumenterad erfarenhet av utveckling av bioinformatiska metoder
• kunna utveckla analysarbetsflöden i minst ett programmeringsspråk (t ex Python, R, Java)
• ha dokumenterad erfarenhet av att analysera stora biologiska datamaterial (t ex nästa generations sekvensering)
• ha nödvändig kompetens för att kunna validera resultaten av olika analysprogram
• ha dokumenterad undervisningserfarenhet på högskolenivå
• ha vetenskaplig kompetens motsvarande docentkompetens

Bedömningsgrunder
Som bedömningsgrunder vid anställning ska i första hand gälla graden av sådan skicklighet som är ett krav för behörighet för anställning. Prövningen av den pedagogiska skickligheten ägnas lika stor omsorg som prövningen av den vetenskapliga skickligheten.

Bedömningen av den vetenskapliga skickligheten baseras på

• både genomförda forskningsinsatser och pågående forskning
• förmåga att självständigt initiera och bedriva innovativ forskning
• erfarenhet av att söka och erhålla externa forskningsmedel

Bedömning av den pedagogiska skickligheten baseras på

• erfarenhet av planering, genomförande och utvärdering av undervisning
• erfarenhet av handledning och examination främst på masters och forskarutbildningsnivå
• förmåga att integrera forskning och ett vetenskapligt förhållningssätt i det pedagogiska arbetet

Vidare beaktas dokumenterad skicklighet i att

• utveckla och leda verksamhet och personal vid högskolan
• kommunicera och samarbeta
• samverka med det omgivande samhället
• informera om forskning och utvecklingsarbete
• administrera och annan skicklighet som är av betydelse med hänsyn till anställningen

Det är meriterade att ha

• erfarenhet av kurs- och programutveckling på högskolenivå
• erfarenhet av analys av nästa generations sekvenseringsdata

Sista ansökningsdatum:
2019-12-17

Placering/ort:
Uppsala

Omfattning:
100%

Anställningsform:
Tillsvidare

Tillträde
Enligt överenskommelse

Varaktighet, arbetstid
Heltid/ 100%

Ersättning
Fast lön

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2019-12-17
Klicka på denna länk för att göra din ansökan

Företag
Sveriges Lantbruksuniversitet

Omfattning
Detta är ett heltidsjobb.

Arbetsgivare
Sveriges Lantbruksuniversitet (org.nr 202100-2817), http://www.slu.se

Arbetsplats
Sveriges lantbruksuniversitet

Jobbnummer
4945433

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Universitetslektor i bioinformatik

Prenumerera på jobb från Sveriges lantbruksuniversitet