Första forskningsingenjör, 12 månader, inom bioinformatik

Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet / Kemiingenjörsjobb / Umeå
Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Visa alla kemiingenjörsjobb i Umeå, Vännäs, Nordmaling, Vindeln, Robertsfors eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet i Umeå, Nordmaling, Örnsköldsvik, Kiruna, Huddinge eller i hela Sverige

Umeå universitet satsar på kreativa miljöer för studier och arbete. Hos oss finns attraktiva utbildningar, världsledande forskning och utmärkta innovations- och samverkansmöjligheter. Fler än 4 100 medarbetare och 34 000 studenter har redan valt Umeå universitet. Välj oss du också.

Umeå Plant Science Centre (UPSC) är ett internationellt erkänt centrum inom experimentell växtbiologi.

Inom UPSC är forskning om växters cell- och molekylärbiologi, speciellt på skogsträd, ett profilområde. Institutionen för fysiologisk botanik, som är en del av UPSC, söker nu en förste forskningsingenjör med inriktning mot växtutveckling och genetik. Anställningen är på heltid, och tidsbegränsad till ett år (http://streetlab.upsc.se). Startdatum är den 1 september eller enligt överenskommelse.

Publiceringsdatum
2020-07-13

Dina arbetsuppgifter
Du kommer att arbeta med bioinformatik i en gemensam forskningsmiljö på institutionen för fysiologisk botanik med samarbete med forskningsgrupper på SciLifeLab (Science for Life Laboratory), NBIS (National BioInformatics Service) och Norway Spruce and Scots pine genome project team.

Arbetet innefattar utveckling och implementering av pseudogen identifikation, uttryckskvantifiering och analyspipeline. Du kommer även från Genome project, kunna komma att kallas in som expert. All källkod i projektet kommer att göras offentlig och måste följa principer kring transparent och reproducerbar forskning.

Kvalifikationer
Du har en doktorsexamen inom växters cell- och molekylärbiologi eller motsvarande. Du ska ha omfattande erfarenhet av genomassembly annotering av gener och repetiva regioner, de novo transkriptsassembly sam genuttrycks-och co-uttrycksanalys av RNA-sekvenseringsdata. Du ska ha erfarenhet av så kallad full stack-utveckling och/eller erfarenhet av att skriva komplexa skript (i tex Python), dokumenterad erfarenhet, och expertis av att utveckla arbetsflöden för reproducerbar analys som i sin tur delas offentligt för delning av kod. Du är skicklig i programmeringsspråken C eller C++ och har erfarenhet av att implementera parallelliserad programvara med tex OpenMP och Open MPI för att passa till den här tjänsten. Vidare krävs det utmärkta färdigheter inom R-programmering och dataanalys. Erfarenhet av att arbeta med heterozygota och fragmenterade genomassemblies är mycket meriterande. Dokumenterad erfarenhet av hantering av RNA-sekvenseringsdata, inklusive arbete i HPC-miljö (High Performance Computing; högpresterande datorsystem) med bland annat kunskap om olika kylsystem är ett krav. Utmärkt förmåga att kommunicera både i tal och skrift, mycket bra engelska kunskaper, en vilja att lära sig nya färdigheter och att samarbeta i grupp är av största vikt.

Ansökan:

Ansökan ska innehålla:

- Ett personligt brev där du beskriver dig själv, och dina tidigare relevanta forskningserfarenheter. Brevet ska innehålla länkar till dina tidigare arbeten inom webbutveckling, användargränssnitt och webbdesign som kan visa varför du är kvalificerad till tjänsten.
- CV
- En publikationslista inklusive en länk till din doktorsavhandling. Styrkta kopior av betyg och examensbevis.
- Kontaktuppgifter till två referenspersoner.
- Övriga handlingar du vill åberopa.

Ansökan görs genom vårt elektroniska rekryteringssystem. Handlingar som skickas elektroniskt ska vara i formaten Word eller PDF. Logga in på systemet och ansök via knappen i slutet av denna sida. Sista ansökningsdag är 3 augusti 2020.

Vi ser fram emot att få din ansökan!

Institutionen för fysiologisk botanik är en del av Umeå Plant Science Centre med cirka 200 medarbetare som består av bland annat av 40 gruppledare och representerar för närvarande 48 olika nationaliteter (för mer information, se http://www.upsc.se eller http://www.plantphys.umu.se/english/). Vår huvudsakliga verksamhet är akademisk forskning och utbildning som innefattar områden som ekologi, biokemi, plant fysiologi samt genomik.

Umeå universitet vill erbjuda en jämställd och jämlik miljö där öppna samtal mellan människor med olika bakgrund och perspektiv lägger grunden för lärande, skaparkraft och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och erfarenheter att söka den aktuella anställningen.

Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser.

Varaktighet, arbetstid
100. Tillträde: 1 september eller enligt överenskommelse Visstidsanställning

Ersättning
månadslön

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2020-08-03
Klicka på denna länk för att göra din ansökan

Företag
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet

Arbetsgivarens referens
Arbetsgivarens referens för detta jobb är "AN 2.2.1-899-20".

Omfattning
Detta är ett heltidsjobb.

Arbetsgivare
Umeå Universitet (org.nr 202100-2874)

Arbetsplats
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet

Jobbnummer
5294298

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Första forskningsingenjör, 12 månader, inom bioinformatik

Prenumerera på jobb från Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet