Doktorand i biologi
Lunds universitet, Naturvetenskapliga fakulteten, Biologiska ins / Administratörsjobb (offentlig verksamhet) / Lund
2018-02-02
Observera att sista ansökningsdag har passerat.
➡️ Klicka här för den senare publicerade platsannonsen "Doktorand i biologi" (publicerad 2022-08-05) ⬅️
Visa alla administratörsjobb (offentlig verksamhet) i Lund,
Lomma,
Staffanstorp,
Burlöv,
Kävlinge eller i
hela Sverige Visa alla jobb hos Lunds universitet, Naturvetenskapliga fakulteten, Biologiska ins i Lund Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens 100 främsta lärosäten. Här finns 42 000 studenter och 7 400 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.
Vid Naturvetenskapliga fakulteten bedrivs forskning och utbildning inom biologi, astronomi, fysik, geovetenskap, kemi, matematik och miljövetenskap. Verksamheten bedrivs vid tio institutioner samlade inom norra universitetsområdet. Fakulteten har ca 1900 studenter, 330 forskarstuderande och 700 anställda.
Arbetsuppgifter - Genetisk diversitet inom malaria infektioner
När man försöker att förstå utfall av värd-parasit-interaktioner är det oftast den genetiska variationen hos värd-individerna som har studerats.
Mindre hänsyn har tagits till den genetiska variationen av de patogener som utgör infektionerna och hur denna variation påverkar hur sjuk värd-individen blir.
När en värd blir infekterad av en patogen så startar sällan infektionen av en enda patogen "individ" utan av ett flertal patogen, dvs. en patogen population, som kan bestå av genetiskt olika "individer". När patogenerna väl har invaderat värden kan olika genetiska varianter av patogen nå olika framgångar. Vissa kan vara framgångsrika nog att överleva och reproducera i värden medan andra antingen nerkämpas av värdens immunförsvar eller saknar rätt genetiska verktyg för att kunna invadera värdcellerna.
Detta doktorandprojekt fokuserar på den genetiska variationen som utgör fågelmalaria-infektioner. Fågelmalaria är släkt till de Plasmodium parasiter som orsakar malaria hos människor, men består av mer än tusen olika arter som kan infektera fåglar både i tempererade och tropiska delar av världen. När en infekterad mygga suger blod från en fågel, sprutar den samtidigt in en mängd haploida malaria-sporozoiter i fågeln. Eftersom sporozoiterna kan vara genetiskt olika kan de också nå olika framgångar när de reproducerar sig i fågeln. Med hjälp av olika NGS-sekvenseringstekniker kan vi nu kvantifiera och undersöka parasiternas haplotyp-population både mellan olika infekterade värdar men också följa hur haplotyp-populationen förändras under en specifik infektion.
Vi söker nu en motiverad bioinformatikorienterad doktorand, med bakgrund inom evolutionsbiologi. Syftet med projektet är att utveckla verktyg för att kvantifiera haplotypdiversitet inom och mellan infektioner och tillämpa dessa metoder för att studera 1) om och hur variationen varierar över infektioner inom och mellan individer 2) om variation är relaterad till infektionsutfall 3) Om selektion av haplotyper verkar mellan arter, både under experimentella förhållanden och i naturliga populationer.
Publiceringsdatum2018-02-02Kvalifikationer1. BSc eller MSc i Bioinformatik eller Biologi (med dokumenterad färdighet inom bioinformatik), helst men inte nödvändigt med bakgrund inom evolutionsteori och ekologi.
2. Praktiska färdigheter i; a) UNIX / LINUX, b) hantering av stora dataset genererade genom NGS-sekvensering, c) assemblering och expressionsanalys av transkriptomdata. d) variant calling analyser
3. Vissa färdigheter inom Molekylär laboration
4. En god förståelse av statistik både praktiskt och konceptuellt.
5. Utmärkt Engelska i tal och skrift
6. Villighet att bedriva fältarbete
Behörighet
Grunderna för bedömning:
Kandidaterna att utvärderas utifrån följande kriterier:
1. Möjligheten att arbeta självständigt, formulera och lösa vetenskapliga problem.
2. Relevans och kvalitet på kvalifikationer, erfarenheter och publikationer och/eller examensprojekt.
3. Tydligheten i skriftlig och muntlig kommunikation.
4. För att underlätta bedömningen krävs att kandidaterna tillsammans med deras ansökan lämnar in ett motiveringsbrev om varför de vill göra en doktorsexamen i ekologi och evolution inom det beskrivda projektet (1/2 sida).
Grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå har den som har: avlagt examen på avancerad nivå, fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller på något annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.
Bedömningsgrund
Bestämmelser för anställning som doktorand återfinns i förordning SFS 1998:80. Som innehavare får enbart förordnas den som är antagen till utbildning på forskarnivå. Vid tillsättning skall avseende främst fästas vid graden av förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildningen. Förutom skyldighet att ägna sig åt egen forskarutbildning kan innehavaren åläggas att fullgöra tjänstgöring som avser utbildning, forskning och administrativt arbete enligt särskilda bestämmelser i förordningen.
AnställningsvillkorTidsbegränsad anställning fyra år enligt HF 5 kap 7§.
Lunds universitet välkomnar sökande med olika bakgrund och erfarenheter. Vi ser jämställdhet och mångfald som en styrka och tillgång.
Välkommen med din ansökan!
Vi undanber oss alla kontakter från annonsförsäljare, rekryterings- och bemanningsföretag på grund av statliga upphandlingsregler.
Varaktighet, arbetstid
100 % Visstidsanställning
ErsättningMånadslön
Så ansöker duSista dag att ansöka är 2018-03-10
Ange följande referens när du ansöker: PA2018/174
Klicka på denna länk för att göra din ansökanKontaktOlof Hellgren, Lektor +46 46 222 17 83
Elin Johansson, personaladministratör +46 46 222 79 21
FöretagLunds universitet, Naturvetenskapliga fakulteten, biologiska ins
AdressLunds universitet, Naturvetenskapliga fakulteten, biologiska ins
Box 118?
22100 Lund
KontorsadressBox 118?
Jobbnummer 3939986
Observera att sista ansökningsdag har passerat.