Postdoktor i datoriserad bildanalys

Uppsala universitet, Institutionen för informationsteknologi / Datajobb / Uppsala
Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Prenumerera på nya jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för informationsteknologi

Visa alla datajobb i Uppsala, Östhammar, Sigtuna, Österåker, Håbo eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för informationsteknologi i Uppsala, Gotland eller i hela Sverige

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 40 000 studenter, 7 000 anställda och en omsättning på 6,5 miljarder kronor.



Institutionen för informationsteknologi bedriver forskning och utbildning i ett spektrum av områden inom datavetenskap och IT.

Forskningen är organiserad i fem avdelningar, och avdelningen för visuell information och interaktion huserar Centrum för bildanalys, som har en lång tradition inom teoretisk och tillämpad forskning och forskarutbildning i digital bildbehandling och vetenskaplig visualisering. Fokus är på bildbehandling som sådan, men också på utveckling av bättre metoder, algoritmer och system för tillämpningar inom främst livsvetenskaper, medicin och digital humaniora, bl.a. handskriftsigenkänning. För mer information, se www.it.uu.se.

Forskningsprojekt: Postdoktorstjänsten är del av ett nyligen startat 5-årigt forskningsprojekt finansierat av Stiftelsen för strategisk forskning. Projektet handlar om cellmigration; en komplex cellulär process mycket relevant för cancer. Vi kommer samla data och bygga modeller av levande celler i fyra dimensioner i rum och tid, och tillämpa en bred systemmikroskopistrategi genom att kombinera kvantitativa avbildningsmetoder och statistiska modeller med mått från enskilda celler, s.k. 'single cell omics'. Projektet är ett multidisciplinärt samarbete mellan ledande experter inom cellmigration och mikroskopi (Staffan Strömblad, Karolinska Institutet), molekylära verktyg (Ulf Landegren, Uppsala University), digital bildbehandling och bildanalys (Carolina Wählby, Uppsala University), och två företag; Olink Biosciences och Sprint Biosciences.

Vi söker nu någon som kan fylla rollen som expert inom datoriserad bildanalys med ansvar för att skapa ett automatiserat tillvägagångssätt för att klassificera celler baserat på deras dynamiska beteende utifrån mikroskopidata insamlat över tid. Den sökande förväntas samarbeta med våra projektpartners och vara inblandad i handledning av doktorander och masters studenter. Uppgifterna inkluderar utveckling av metoder för analys av data från storskaliga 4D mikroskopiexperiment, och metoderna sträcker sig från lärande-baserade bildsegmenteringsmetoder och klassificering till storskalig statistisk analys.

Arbetsuppgifter: Tjänsten är fokuserad på forskning, men kan komma att innefatta viss undervisning (på svenska eller engelska) upp till 5% och institutionstjänstgöring upp till 5% av heltid beroende på tillgång och intresse.

Kvalifikationskrav: De sökande ska ha avlagt doktorsexamen inom datoriserad bildanalys eller liknande område, kombinerad med dokumenterad erfarenhet från storskalig behandling och analys av bilddata, eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen. Doktorsexamen ska ha avlagts högst tre år före ansökningstidens utgång. Om det finns särskilda skäl kan doktorsexamen ha avlagts tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, klinisk tjänstgöring, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer eller andra liknande omständigheter. Erfarenhet från arbete med mikroskopidata och life-science tillämpningar värderas högt i bedömningen; speciellt erfarenhet av tids-serie-analys och 3D data. Utmärkta kunskaper i muntlig och skriftlig engelska är ett krav.

Bedömningsgrunder: Vid urval bland behöriga sökande kommer stor vikt att fästas vid vetenskaplig skicklighet relevant för projektet; forskningserfarenhet inom datoriserad bildbehandling, hantering och analys av mycket stora datamängder, vetenskaplig datahantering och maskininlärningsmetoder. Publikationer som huvudförfattare i högt värderade tidskrifter och konferenser är en viktig merit. Särskilt stor vikt kommer också att fästas vid dokumenterade programmeringskunskaper. Dokumenterade erfarenheter av samarbete i grupp och organisatorisk förmåga är meriterande. Eftersom fokus i projektet är på mikroskopidata och tillämpningar i livsvetenskaperna anses erfarenheter och/eller starkt intresse i dessa områden som meriterande.

Ansökan: Ansökan ska innehålla en detaljerad (max 2 sidor) motivering till att söka denna tjänst, beskrivning av forskningsintressen, relevanta kvalifikationer och en beskrivning av den sökandes doktorsavhandling. Ansökan ska också innehålla en meritförteckning (CV), kopia på relevanta betygshandlingar (översatta till svenska eller engelska), en länk till doktorsavhandlingen, en publikationslista med de fem viktigaste publikationerna markerade och beskrivning av kandidatens specifika insats, samt ev. andra relevanta dokument. Dessutom kan sökanden tillhandahålla referenser (med kontaktinformation) och maximalt två rekommendationsbrev.

Uppsala universitet värdesätter de kvaliteter som jämn könsfördelning och mångfald tillför verksamheten. Vi ser därför gärna sökande av alla kön och med olika födelsebakgrund, funktionalitet och livserfarenhet.

Lön: Individuell lönesättning tillämpas.

Tillträde: Snarast eller efter överenskommelse.

Anställningsform: Tidsbegränsad anställning i 2 år.

Anställningens omfattning: 100 %

Upplysningar om anställningen lämnas av
Professor Carolina Wählby, tel. +4618 4713473, carolina.wahlby@it.uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 8 december 2017, UFV-PA 2017/3961.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Varaktighet, arbetstid
100%. Tillträde: Snarast eller efter överenskommelse. Visstidsanställning

Publiceringsdatum
2017-11-24

Ersättning
Fast Lön

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2017-12-08
Ange följande referens när du ansöker: UFV-PA 2017/3961
Klicka på denna länk för att göra din ansökan

Företag
Uppsala universitet, Institutionen för informationsteknologi

Adress
Uppsala universitet, Institutionen för informationsteknologi
box 256
75200 Uppsala

Kontorsadress
box 256

Jobbnummer
3820496

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Prenumerera på jobb från Uppsala universitet, Institutionen för informationsteknologi

Fyll i din e-postadress för att få e-postnotifiering när det dyker upp fler lediga jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för informationsteknologi: