Postdoktor

Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och p / Biologjobb / Uppsala
2017-09-06
Observera att sista ansökningsdag har passerat.
➡️ Klicka här för den senare publicerade platsannonsen "Postdoktor" (publicerad 2022-05-03) ⬅️

Visa alla biologjobb i Uppsala, Östhammar, Sigtuna, Österåker, Håbo eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och p i Uppsala, Solna eller i hela Sverige

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 40 000 studenter, 7 000 anställda och en omsättning på 6,5 miljarder kronor.

Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet (http://www.

igp.uu.se) har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på genomik, cancer och molekylär diagnostik. En av grundtankarna vid institutionen är att stimulera närmare samarbete mellan kliniska och prekliniska forskare. Delar av verksamheten är även integrerad med Akademiska sjukhuset, Uppsala samt SciLifeLab. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar. Institutionen omsätter omkring 255 mkr och har ca 340 personer i sin arbetsstyrka, varav ca 90 är doktorander.

SciLifeLab (www.scilifelab.se) a ¨r ett nationellt center fo ¨r molekyla ¨ra biovetenskaper med fokus pa° forskning inom ha ¨lsa och miljo ¨. Centret kombinerar ledande teknisk expertis med avancerat kunnande inom translationell medicin och molekyla ¨ra biovetenskaper. SciLifelab a ¨r en nationell resurs som drivs av Karolinska Institutet, KTH, Stockholms universitet och Uppsala universitet. Centret samarbetar med era andra la ¨rosa ¨ten.

SciLifeLab inbjuder till ansökningar för postdocpositioner i forskargrupper associerade med SciLifeLab (SciLifeLab Faculty).

Lars Feuk och hans forskargrupp (http://www.igp.uu.se/research/genetics_genomics/lars_feuk/?languageId=1) använder storskalig sekvensering för att studera genetisk variation och genexpression. Studierna är inriktade på att hitta genetisk variation och genuttryck associerade med schizofreni och utvecklingsstörning. Studier av utvecklingsstörning görs genom att använda helgenomsekvensering av patienten och dennes föräldrar. Nymutationer kan då identifieras hos patienten och dessa utvärderas sedan med molekylärbiologiska metoder. Detta projekt sker i samarbete med avdelningen för klinisk genetik vid Akademiska sjukhuset i Uppsala.

För schizofrenistudier så har ett stort material med vävnadsprover från avlidna patienter samlats in och där undersöks genuttryck för att hitta signalvägar som skiljer sig i uttryck mellan patienter och kontroller. Data från dessa studier används också för mer ingående analyser av specifika typer av RNA-molekyler. Under de senaste åren har storskalig sekvensering av RNA gett upphov till upptäckter av nya typer av RNA och nya former av transkriptionell reglering. Här ingår cirkulära RNA (circRNA) som visat sig vara en vanligt förekommande typ av RNA i humana celler. Ett projekt har nu initierats som fokuserar på metoder och analyser för att öka förståelsen för cirkulära RNA och dess koppling till sjukdom.

Arbetsuppgifter: Projektet är fokuserat på att undersöka och öka förståelsen för cirkulära RNA, en relativt ny form av transkript som tros vara viktiga för reglering av expression. Inom projektet vill vi testa olika metoder för detektion av cirkulära RNA och undersöka förekomsten av cirkulära RNA i olika patientgrupper. I arbetet ingår också att utvärdera om cirkulära RNA kan användas som biomarkörer. Arbetet kommer huvudsakligen gälla bioinformatiska analyser av RNA- och DNA-sekvenseringsdata för att påvisa och kvantifiera cirkulära RNA, samt studera dessa i relation till genetisk variation och uttryck av linjära mRNA. Arbetet kan även innehålla laborativa inslag för att extrahera och anrika cirkulära RNA. Sammanställning och statistisk utvärdering av resultat är viktiga för arbetet. Inom ramen för anställningen ingår också att skriva vetenskapliga artiklar, samt presentera både tekniska och biomedicinska resultat. I arbetet ingår även att bidra vid skrivande av forskningsansökningar och viss handledning av doktorander och studenter dock max 20%.

Kvalifikationskrav: Personen vi söker ska ha doktorsexamen i ett område lämpligt för befattningen, såsom t.ex. bioinformatik, bioteknik, biomedicin eller motsvarande. Disputation ska ha ägt rum högst tre år före ansökningstidens utgång. Om det finns särskilda skäl kan doktorsexamen ha avlagts tidigare. Dessutom krävs dokumenterad erfarenhet av analys av data från next-generation sekvensering och god kunskap om bioinformatiska databaser och analysverktyg. Erfarenhet av R och skriptspråk, samt erfarenhet av att arbeta i Linux/Unix-baserade system. God förmåga att uttrycka sig såväl muntligt som skriftligt på engelska. God samarbets- och kommunikationsförmåga. Dokumenterad erfarenhet av att sammanställa och publicera vetenskapliga artiklar inom närliggande område är ett krav. Då utvecklingen inom området sker mycket snabbt krävs en person som har förmåga att testa, utvärdera och anpassa analyser.

Önskvärt/meriterande i övrigt: Erfarenhet av att extrahera och arbeta med RNA är önskvärt. Särskild vikt kommer att läggas på vetenskaplig skicklighet, god samarbetsförmåga och självständighet. Sökande behöver ha god arbetsdisciplin och noggrannhet. Stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet.

Uppsala universitet värdesätter de kvaliteter som jämn könsfördelning och mångfald tillför verksamheten. Vi ser därför gärna sökande av alla kön och med olika födelsebakgrund, funktionalitet och livserfarenhet

Lön: Individuell lönesättning tillämpas.

Tillträde: Snarast.

Anställningsform: Tidsbegränsad anställning 2 år efter anställningsdatum.

Anställningens omfattning: 100 %

Upplysningar om anställningen lämnas av
Lars Feuk, tel: 018-471 4827, mail: lars.feuk@igp.uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 27 september 2017, UFV-PA 2017/2907.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Varaktighet, arbetstid
100%. Tillträde: Snarast Visstidsanställning

Publiceringsdatum
2017-09-06

Ersättning
Fast Lön

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2017-09-27
Ange följande referens när du ansöker: UFV-PA 2017/2907
Klicka på denna länk för att göra din ansökan

Företag
Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och p

Adress
Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och p
box 256
75200 Uppsala

Kontorsadress
box 256

Jobbnummer
3682178

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Postdoktor

Prenumerera på jobb från Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och p