Forskare i beräkningsbiologi

Lunds universitet, Institutionen för astronomi och teoretisk fys / Sjukgymnastjobb / Lund
Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Prenumerera på nya jobb hos Lunds universitet, Institutionen för astronomi och teoretisk fys

Visa alla sjukgymnastjobb i Lund, Lomma, Staffanstorp, Burlöv, Kävlinge eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Lunds universitet, Institutionen för astronomi och teoretisk fys i Lund

Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens 100 främsta lärosäten. Här finns 40 000 studenter och 7 400 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.

Vid Naturvetenskapliga fakulteten bedrivs forskning och utbildning inom biologi, astronomi, fysik, geovetenskap, kemi, matematik och miljövetenskap. Verksamheten bedrivs vid nio institutioner samlade inom norra universitetsområdet. Fakulteten har ca 1500 studenter, 330 forskarstuderande och 700 anställda.

Institutionen för astronomi och teoretisk fysik bedriver forskning och undervisning inom tre huvudområden: astronomi och astrofysik; teoretisk partikelfysik; samt beräkningsbiologi och biologisk fysik. Vår forskning är nyfikenhetsdriven, grundad i strävan att förstå hur verkligheten är uppbyggd, från de minsta partiklarna till universum i stort, såväl som livet självt. Inom alla tre områdena har vi en internationellt stark ställning och vi arbetar aktivt för att ytterligare stärka vår internationella renommé.



Ettårig forskartjänst inom beräkningsbiologi med inriktning mot svampars nedbrytning av markorganiska föreningar

Projektbeskrivning och arbetsuppgifter

Forskningsuppgifterna omfattar analyser av transkriptom som uttrycks vid svampars nedbrytning av markorganiska föreningar.

Syftet med projektet är att identifiera de gener och genetiska nätverk som kontrollerar ektomykorrhizasvampars nedbrytning av organiska föreningar (t.ex. cellulosa, pektin, protein, kitin). Nedbrytningsprocessen följs i detalj över tiden med spektroskopiska metoder (främst FTIR och XPS) och transkriptomanalyser baserat på RNA seq-data. Statistiska metoder och maskinlärningsverktyg kommer att användas för att identifiera moduler av koreglerade gener som uttrycks under olika faser av nedbrytningen. För att förstå funktionen av dessa moduler så kommer deras uttryck att kopplas till svampens extracellulära nedbrytningsaktivitet och den predikterade funktionen av gener baserad på annotering av gener i svampar.

Forskaren kommer att ingå i Carl Troeins grupp och jobba nära Professor Anders Tunlid och Per Perssons grupp på biologiska institutionen, och dessutom vara en del av det multidisciplinära forskningsprogrammet "Molecular Interactions Controlling soil Carbon Sequestration - MICCS". Det övergripande målet med forskningsprogrammet MICCS är att erhålla mekanistisk förståelse för hur markorganiska föreningars interaktioner, aktiviteten hos nedbrytande mikroorganismer och den fysikaliska-kemiska miljön påverkar de markorganiska föreningarnas stabilitet. Forskningsmiljön MICCS består av en stark grupp forskare, forskningsingenjörer, postdoktorer och doktorander som studerar markorganiska föreningar på olika grader av komplexitet och spatiell upplösning - från definierade modellsystem till fältstudier - med hjälp av modern teknologi såsom spektroskopiska metoder, transkriptomanalys, isotopinmärkning och systembiologi. För ytterligare information se http://miccs.info/.

Publiceringsdatum
2018-03-21

Kvalifikationer
Följande är krav:

- Postdoktoral erfarenhet av statistiska analyser av transkriptomdata från ektomykorrhizasvampar som bryter ner markorganiska föreningar
- Dokumenterad erfarenhet av analyser av RNA seq-data från tidsserier omfattande identifiering av funktionellt kopplade, koreglerade genmoduler.
- Flytande engelska (i skrift och tal)

Följande är meriterande:

- Förmågan att utföra forskningsuppgifter både självständigt och som en del av en forskningsgrupp

Ansökningsförfarande

Ansökan ska innehålla följande delar:

- CV inkluderande kopia av PhD-diplom, avhandlingens titel, tidigare anställningar, nuvarande anställning och akademiska utmärkelser (max. två sidor)
- Fullständig publikationslista
- Kort beskrivning av pågående forskning (max. en sida)
- Namn och kontaktinformation på minst 3 referenspersoner.



Lunds universitet välkomnar sökande med olika bakgrund och erfarenheter. Vi ser jämställdhet och mångfald som en styrka och tillgång. Välkommen med din ansökan! Vi undanber oss alla kontakter från annonsförsäljare, rekryterings- och bemanningsföretag på grund av statliga upphandlingsregler.

Varaktighet, arbetstid
100%. Tillträde: Så snart som möjligt i ett år Visstidsanställning

Ersättning
Månadslön

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2018-04-04
Ange följande referens när du ansöker: PA2018/914
Klicka på denna länk för att göra din ansökan

Kontakt
Mattias Ohlsson, universitetslektor 046-222 7782, mattias.ohlsson@thep.lu.se

Företag
Lunds universitet, institutionen för astronomi och teoretisk fys

Adress
Lunds universitet, institutionen för astronomi och teoretisk fys
Box 118?
22100 Lund

Kontorsadress
Box 118?

Jobbnummer
4036411

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Prenumerera på jobb från Lunds universitet, Institutionen för astronomi och teoretisk fys

Fyll i din e-postadress för att få e-postnotifiering när det dyker upp fler lediga jobb hos Lunds universitet, Institutionen för astronomi och teoretisk fys: