Förste forskningsingenjör i bioinformatik

Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet / Biologjobb / Umeå
Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Visa alla biologjobb i Umeå, Vännäs, Nordmaling, Vindeln, Robertsfors eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet i Umeå, Nordmaling, Örnsköldsvik, Kiruna, Huddinge eller i hela Sverige

Umeå universitet satsar på kreativa miljöer för studier och arbete. Hos oss finns attraktiva utbildningar, världsledande forskning och utmärkta innovations- och samverkansmöjligheter. Fler än 4 300 medarbetare och 31 500 studenter har redan valt Umeå universitet. Välj oss du också.

Institutionen för fysiologisk botanik, som är del av Umeå Plant Science Centre (www.

upsc.se), söker en förste forskningsingenjör i bioinformatik. Den huvudsakliga arbetsuppgiften kommer vara att ge stöd till användare av de bioinformatiska resurserna på UPSC. Anställningen är på heltid i ett år, med möjlighet till förlängning. Tillträde snarast. Sista ansökningsdag är 2016-04-18.

Projektbeskrivning
Umeå Plant Science Centre's bioinformatikplattform (UPSCb) önskar anställa en bioinformatiker för att förstärka arbetsgruppen. UPSC's bioinformatikgrupp hade en viktig roll när gran-genomet sekvenserades då som det största genomet alla kategorier som kartlagts. Detta, och andra sekvenseringsprojekt som kräver omfattande bioinformatik, har gjort att vi nu etablerat en Bioinformatik-plattform som har en ledande roll i flera stora projekt. UPSCb har utvecklat och tillhandahåller flera forskningsresurser t.ex. web-baserade applikationer såsom Plant Genome Integrative Explorer (PlantGenIE). Vi söker nu en bioinformatiker för att hjälpa oss att fortsätta utveckla dessa resurser, samt att ge support till forskarna som använder dem.

Publiceringsdatum
2016-03-23

Dina arbetsuppgifter
Arbetsuppgifterna omfattar analys av High Throughput Sequencing (i huvudsak RNA-seq) data, d.v.s. användning av vår pipeline för dataförbehandling, kvalitetskontroll, resultatframställning och presentation. I vissa fall blir du mer delaktig i vissa forskningsprojekt, till exempel genom att vid analysen samarbeta med forskare med mindre bioinformatikkompetens (att hjälpa biologer med att t.ex. söka sekvenshomologer, utföra fylogenetiska analyser osv). Vidare ingår att hålla dig uppdaterad med den senaste teknikerna inom programvaror och verktyg, att utveckla pipelines för analys av NGS-data, liknande vår RNA-Seq pipeline, t.ex. för Chip-Seq, BS-Seq eller metagenomik, samt att upprätthålla IT-infrastrukturen, exempelvis genom installation av ny programvara, användarhantering och administrering av ett kösystem på våra servrar

Kvalifikationer
Du har en doktorsexamen inom beräkningsbiologi, bioinformatik eller motsvarande. Du måste vara väl bekant med Unix/Linux och minst ett programmeringsspråk såsom Python, R, C eller C++. Det är viktigt att du är en lagspelare som tycker om att interagera med biologer (d.v.s. UPSCb's huvudsakliga användargrupp). Du måste ha mycket goda kunskaper i engelska och erfarenhet av att skriva forskningsrapporter och presentera dem. Erfarenhet av databashantering, systemadministration, NGS teknik och statistik är meriterande.

Så ansöker du
Ansökan skall innehålla (1) CV med komplett publikationslista och kopior på relevanta examen (2) ett personligt brev med beskrivning av dina forskningserfarenheter och redogörelse av ditt forskningsintresse (3) Kontaktinformation till två referenspersoner.

Institutionen för fysiologisk botanik är en del av Umeå Plant Science Centre med cirka 200 medarbetare som består av bland annat av 40 gruppledare och representerar för närvarande 48 olika nationaliteter (för mer information, se http://www.upsc.se eller http://www.plantphys.umu.se/english/ ). Vår huvudsakliga verksamhet är akademisk forskning och utbildning som innefattar områden som ekologi, biokemi, plant fysiologi samt genomik. Om du vill har mer information om anställningen, kontakta nicolas.delhomme@umu.se eller Stefan.jansson@umu.se .

Umeå universitet vill erbjuda en miljö där öppna samtal mellan människor med olika bakgrund och perspektiv lägger grunden för lärande, skaparkraft och utveckling. Vid varje rekrytering strävar vi efter ökad mångfald och använder möjligheten till positiv särbehandling.

Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser.

Varaktighet, arbetstid
100 %. Tillträde: Snarast Visstidsanställning

Ersättning
Fast månadslön

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2016-04-18
Ange följande referens när du ansöker: AN 2.2.1-393-16
Klicka på denna länk för att göra din ansökan

Kontakt
Stefan Jansson, prefekt 090-786 5354

Företag
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet

Adress
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet
Umeå universitet
90187 Umeå

Kontorsadress
Umeå universitet

Jobbnummer
2740705

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Förste forskningsingenjör i bioinformatik

Prenumerera på jobb från Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet