Doktorand inom bioinformatik med inriktning mot integrativ dataa

Kungliga Tekniska Högskolan / Högskolejobb / Stockholm
Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Prenumerera på nya jobb hos Kungliga Tekniska Högskolan

Visa alla högskolejobb i Stockholm, Solna, Lidingö, Sundbyberg, Danderyd eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Kungliga Tekniska Högskolan i Stockholm, Solna, Huddinge, Sollentuna, Södertälje eller i hela Sverige

KTH är ett av Europas ledande tekniska universitet och en viktig arena för kunskapsutveckling. Som Sveriges största universitet för teknisk forskning och utbildning samlar vi studenter, forskare och fakultet från hela världen. Vår forskning och utbildning omfattar såväl naturvetenskap som alla grenar inom teknik samt arkitektur, industriell ekonomi, samhällsplanering, historia och filosofi.



Projektbeskrivning
Forskarutbildningsämne: Bioteknologi

Forskargruppen inom Integrativ omik och precisionsmedicin på CBH-skolan leds av professor Mathias Uhlén och har sina lokaler på Science for Life Laboratory in Solna.

Huvudprojektet är "Human Protein Atlas"-projektet (www.proteinatlas.org) som använder en kombination av genomik, transkriptomik, proteomik samt antikroppsbaserad profilering för att studera globala proteinuttrycksmönster i humana celler, vävnader och organ. Forskargruppen är även ansvarig för "Swedish SCAPIS SciLifeLab Wellness Profiling (S3WP)"-programmet, vilket startades för att definiera hälsoprofiler i en frisk population baserat på spjutspetsteknik inom molekylära analyser. I denna studie har 100 friska individer studerats longitudinellt under två år och sedan följts upp av sjukdomskohorter med fokus på typ-2-diabetes, kardiovaskulär sjukdom och leverförfettning. En fortsättning på detta projekt är att skapa en "Disease Atlas" där fokus är att kartlägga proteinprofiler i plasma från ett stort antal olika sjukdomar, inkluderat olika cancertyper, infektionssjukdomar och kardiovaskulära sjukdomar.

Vi utlyser nu en doktorandtjänst för att använda detta storskaliga data för integrativa studier. Denna tjänst kommer vara inriktat på avancerad bioinformatik, statistisk analys samt integration av data från dessa stora projekt. Målet för doktorandprojektet är att studera skillnader i proteinuttrycksprofiler mellan sjukdomskohorter och friska individer samt att vara delaktig i den globala kartläggningen av människans proteiner inom Human Protein Atlas-projektet.

Handledning: Doktoranden kommer att handledas av: Prof. Mathias Uhlén och Linn Fagerberg.

Vi erbjuder
- Möjligheten att doktorera i en dynamisk, internationell forskarmiljö i samarbete med industrin och framstående universitet världen över https://www.kth.se/en/studies/phd/why-1.521017
- En arbetsplats med https://www.kth.se/om/work-at-kth/en-arbetsplats-med-manga-formaner-1.467932 och månadslön enligt https://intra.kth.se/anstallning/anstallningsvillkor/lon/doktorandstegen-1.572915
- Forskarutbildning vid ett lärosäte som är aktivt och stöttande i frågor som rör t.ex. arbetsvillkor, jämställdhet & mångfald samt studiemiljö
- Arbete och studier i Stockholm med närhet till natur & hav

Behörighet för antagning
För att bli antagen till forskarutbildning (kap 7 39 § högskoleförordningen) krävs att den sökande har grundläggande behörighet:

- avlagt en examen på avancerad nivå,
- fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller
- på något annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

Utöver ovanstående finns också ett obligatoriskt krav på engelska motsvarande Engelska B/6, https://www.kth.se/en/studies/phd/admission-requirements-1.520175

Urval
För att lyckas med dina doktorandstudier på KTH behöver du vara målinriktad och ihärdig i ditt arbete. Vid urval av de sökande bedöms förmågan att:

- självständigt driva sitt arbete framåt,
- kunna samarbeta med andra,
- ha ett professionellt förhållningssätt och
- analysera och arbeta med komplexa frågor

Meriterande:

- Ett relevant examensarbete
- Stark motivation och välutvecklad analytisk- och problemlösningsförmåga
- Engelska språkkunskaper med god skriftlig och muntlig kommunikation då det krävs i det dagliga arbetet
- God kännedom om bioinformatiska verktyg, paket, algoritmer och databaser
- Avancerade färdigheter inom programmering, främst i R, Python eller Perl
- Erfarenhet av att analysera storskaliga dataset
- Erfarenhet och kunskap av tekniker inom omik, exempelvis proteomik och transkriptomik

Efter behörighetskraven kommer stor vikt läggas vid personliga egenskaper.

Målexamen: Doktorsexamen
Information om antagning och anställning
Endast den som antagits till forskarutbildning får anställas som doktorand. Den sammanlagda anställningstiden får inte vara längre än vad som motsvarar utbildning på forskarnivå på heltid under fyra år. En anställd doktorand kan i begränsad omfattning (högst 20 %) utföra vissa arbetsuppgifter inom t.ex. utbildning och administration. En ny anställning som doktorand gäller för högst ett år, anställningen får därefter förnyas med högst två år i taget

Fackliga representanter
Du hittar kontaktuppgifter till fackliga representanter på https://www.kth.se/om/work-at-kth/fackrepresentanter-1.500898.

Doktorandsektionen (Tekniska högskolans studentkår)
Du hittar kontaktuppgifter till doktorandsektionen på https://www.dr.kth.se/.

Ansökan
Du ansöker via KTH:s rekryteringssystem. Du som sökande har huvudansvaret för att din ansökan är komplett när den skickas in.

Ansökan ska vara KTH tillhanda senast sista ansökningsdagen vid midnatt, CET/CEST (Central European Time/Central European Summer Time).

Ansökan ska ha följande innehåll

- CV med relevanta professionella erfarenheter och kunskaper
- Ansökningsbrev med en kortfattad redogörelse om varför du vill bedriva forskarstudier, om dina akademiska intressen och hur de relaterar till dina tidigare studier och framtida mål (Max 2 sidor)
- Kopior av examensbevis och betyg från tidigare universitetsstudier och intyg på uppfyllda https://www.kth.se/en/studies/phd/admission-requirements-1.520175. Översättningar till engelska eller svenska om originaldokumentet inte är utfärdade på ett av dessa språk.Kopior av original ska https://www.kth.se/student/program/examen/verifiering/vidimering-av-handlingar-1.55190.
- Representativa publikationer eller tekniska rapporter. För längre dokument, bifoga gärna en sammanfattning (abstract) och en webblänk till den fullständiga texten

Publiceringsdatum
2021-11-11

Övrig information
Strävan efter jämställdhet, mångfald och lika villkor är både en kvalitetsfråga och en självklar del av KTH:s värdegrund

För information om behandling av personuppgifter i samband med rekrytering https://www.kth.se/om/work-at-kth/processing-of-personal-data-in-the-recruitment-process-1.823440

Vi undanber oss direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av platsannonser.

Varaktighet, arbetstid
100%. Tillträde: Enligt överenskommelse Visstidsanställning

Ersättning
Månadslön enligt KTH:s avtal för doktorandlöner

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2021-11-22
Klicka på denna länk för att göra din ansökan

Företag
Kungliga Tekniska Högskolan

Arbetsgivarens referens
Arbetsgivarens referens för detta jobb är "C-2021-2091".

Omfattning
Detta är ett heltidsjobb.

Arbetsgivare
Kungliga Tekniska Högskolan (org.nr 202100-3054)

Arbetsplats
Skolan för kemi, bioteknologi och hälsa vid KTH

Kontakt
Linn Fagerberg
mail: linn.fagerberg@scilifelab.se

Jobbnummer
6118188

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Prenumerera på jobb från Kungliga Tekniska Högskolan

Fyll i din e-postadress för att få e-postnotifiering när det dyker upp fler lediga jobb hos Kungliga Tekniska Högskolan: