Doktorand i Biologi/Doctoral student in Biology

Lunds Universitet, Biologiska Institutionen / Biologjobb / Lund
Observera att sista ansökningsdag har passerat.


Visa alla biologjobb i Lund, Lomma, Staffanstorp, Burlöv, Kävlinge eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Lunds Universitet, Biologiska Institutionen i Lund

Publiceringsdatum
2013-12-16

Dina arbetsuppgifter
Major Histocompatibility Complex (MHC) generna är nog det mest extrema exemplet på hur parasit-värd interaktioner kan uppräthålla genetisk variation i immunförsvarsgener hos värdar. Tättingar (Passeriformes) har ofta ett mycket större antal MHC-genkopior än andra ryggradsdjur och man känner väldigt dåligt till organisationen och funktionen av alla dessa gener. Fåglar av ordningarna Galliformes och Anseriformes har en enklare MHC organisation än tättingar och för dessa ordningar finns även tillgängliga genom för flera arter. Gräsänder av ordningen Anserformes har t.ex. fem MHC gener, varav bara två är uttryckta. Dessa antal kan jämföras med tättingar som kan ha mer än 20 MHC gener. Vi utlyser en doktorandtjänst som syftar till att förstå MHC organisationen hos tättingar genom att jämföra sparvar och gräsänders MHC gener och genuttryck. Det övergripande målet med detta projekt är att förstå den enorma MHC diversitet som finns hos tättingar från ett evolutionärt perspektiv. Dels genom att studera MHC organisationer och diversitet från gräsänder till sparvar, men framförallt genom att undersöka hur specifika värdgenotyper hanterar specifika linjer av fågelinfluensa/fågelmalaria, både experimentellt och i naturen.

Behörighet

Master i biologi med inriktning mot evolutionär och molekylär ekologi. Hög motivation och nyfikenhet på det föreslagna projektet är ett måste.
Stor erfarenhet av molekylärgenetiskt labbarbete (PCR, Sanger-sekvensering, kloning, NGS), samt av att analysera NGS amplicon data, är mycket viktigt.
Vidare krävs god analytisk förmåga, intresse för bioinformatik, samt utmärkt förmåga att uttrycka sig på engelska både skriftligt och muntligt. Erfarenhet av att arbeta i fält med fåglar är önskvärt.

Grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå har den som har: avlagt examen på avancerad nivå, fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller på något annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

Job assignments

Major Histocompatibility Complex (MHC) genes are the most extreme example of how host-pathogen interactions can maintain genetic variation for host defence against pathogens. To date it is clear that songbirds (Passeriformes) have a larger number of MHC loci than most other vertebrates. However, the organization of the MHC genes is largely unknown, as is the function/purpose of these multiple copies. In birds of the orders Anseriformes and Galliformes, the MHC organization is simpler than in Passeriformes and full-genomes from a handful of species are available. Mallards, of the order Anseriformes, have five MHC loci but only two are expressed. This can be compared to songbirds where more than 20 loci have been reported for MHC. We offer a PhD project which aims to better understand the complex MHC organization in songbirds, sparrows in particular, by comparing their organization with the relatively simple MHC organization in Mallards. The main objective of the present project is to better understand the enormous MHC diversity in birds from an evolutionary perspective; taking both a comparative genomic approach (from mallards to house sparrows) and a more detailed approach investigating how specific host MHC genotypes cope with specific strains of avian influenza and avian malaria, both naturally and experimentally.

Complete version of announcement ; http://admin.lu.se/o.o.i.s?id=22598&Dnr=583395&Type=E

Arbetstider och omfattning
Visstidsanställning 6 månader eller längre
Heltid
Tidsbegränsad anställning, Fyra år

Tillträde
2014-03-01

Ersättning
Fast lön

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2014-01-03
Ansök online; Klicka på denna länk för att göra din ansökan
English version; Klicka på denna länk för att göra din ansökan
Ange följande referens när du ansöker: NPA 2013/802
Ansökan kan tyvärr inte göras via e-post.

Kontakt
Helena Westerdahl, Universitetslektor tel 046-2223669 helena.westerdahl@biol.lu.se

Facklig kontakt
SACO: Anneli Carlsson tel 046-2224252 anneli.carlsson@busilaw.lu.se
OFR/S: Lena Thiman tel 046-2227796 Lena.Thiman@med.lu.se

Företag
Lunds Universitet, Biologiska Institutionen

Adress
Lunds Universitet, Biologiska Institutionen
Sölvegatan 35
22362 LUND

Kontorsadress
Sölvegatan 35

Övriga kontaktuppgifter
Telefonnummer: 046-2224197

Jobbnummer
1730288

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Prenumerera på jobb från Lunds Universitet, Biologiska Institutionen

Fyll i din e-postadress för att få e-postnotifiering när det dyker upp fler lediga jobb hos Lunds Universitet, Biologiska Institutionen: