Bioinformatiker, Laboratoriemedicin, Klinisk genetik i Umeå

Region Västerbotten, Laboratoriemedicin / Biomedicinjobb / Umeå
Observera att sista ansökningsdag har passerat.


Visa alla biomedicinjobb i Umeå, Vännäs, Nordmaling, Vindeln, Robertsfors eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Region Västerbotten, Laboratoriemedicin i Umeå

Region Västerbotten arbetar för att god hälsa och hållbar utveckling ska stärka varandra. Vi tar ansvar för en jämlik välfärd och för att forskning och innovation ger resultat.

Laboratoriemedicin är en länsorganisation med verksamhet i Lycksele, Skellefteå och Umeå. Via avtal har vi ansvar för klinisk patologi i Östersund. Laboratoriemedicin Västerbotten omfattar cirka 550 anställda inom klinisk genetik, klinisk immunologi och transfusionsmedicin, klinisk kemi, klinisk mikrobiologi och klinisk patologi. Även biobank, vårdhygien och vävnadsinrättning ingår i Laboratoriemedicin. Verksamheten är ackrediterad.

På Klinisk genetik arbetar cirka 65 medarbetare av olika yrkeskategorier. Vi utför laboratoriediagnostik av genetiskt betingade sjukdomar och ger information till patienter och familjer med ärftliga sjukdomar genom genetisk vägledning.

Storskalig sekvensering tillsammans med andra nya molekylära tekniker gör snabbt insteg i klinisk verksamhet och forskning. De etableras som viktiga verktyg inom flera laboratoriemedicinska specialiteter varför vi vid laboratoriemedicin arbetar övergripande med implementering av dessa tekniker inom en satsning på en gemensam molekylärgenetisk plattform för forskning, utvecklingsarbete samt implementering av klinisk diagnostik. Den molekylärgenetiska plattformen är en del av Genomic Medicine Center Norr (GMC Norr) och samverkar med Clinical Genomics Umeå vid Umeå universitet. Den tekniska utvecklingen går snabbt med både nya tekniker och frågeställningar som ska implementeras i klinisk molekylärgenetisk diagnostik och ställer ökade krav på bioinformatisk metodik och kompetens.

Vi söker dig som vill applicera bioinformatiska färdigheter på kliniskt meningsfulla frågor och vara en aktiv kraft i utvecklingen av den gemensamma molekylärgenetiska plattformen vid laboratoriemedicin. Anställningen är placerad inom Laboratoriemedicin, Norrlands Universitetssjukhus.

Publiceringsdatum
2024-03-08

Arbetsuppgifter
Som bioinformatiker hos oss skapar du förutsättningar för samarbeten, ny kunskap och en stark framtid.

Du förväntas arbeta med storskaliga sekvensdata (short och long read) och andra molekylärgenetiska tekniker för identifiering av genetisk variation och analys av genuttryck inom forskning, utvecklingsarbete och klinik. Du kommer att arbeta i ett kliniskt diagnostiskt team bestående av bioinformatiker, biomedicinare, molekylärbiologer, läkare, sjukhusgenetiker och biomedicinska analytiker.

Arbetet innebär även ett nära samarbete med forskargrupper, GMC Norr, Clinical Genomics Umeå och institutionen för medicinsk biovetenskap, Umeå universitet. Både i forskningsmiljön och i den kliniska miljön finns god kompetens inom bioinformatik, molekylärbiologi, mikrobiologi, humangenetik och klinisk diagnostik.

Dina huvudsakliga arbetsuppgifter är att skapa och utveckla bioinformatiska flöden, utveckla bioinformatiska verktyg, analysera olika typer av rådata och fungera som en kompetensresurs. Aktuella uppgifter är fortsatt utveckling och implementering av molekylärgenetiska analyser vid cancer och vid utredning av misstänkt medfödd genetisk sjukdom inklusive helexom- och helgenomanalyser.

Kvalifikationer
Dokumenterad erfarenhet av avancerad molekylärgenetisk analys och datahantering samt goda programmeringskunskaper i Python, R och/eller liknande programmeringsspråk är ett krav. God vana av att arbeta i Linuxmiljö är också ett krav. Doktorsexamen i molekylär epidemiologi, medicinsk genetik, bioinformatik, biostatistik eller motsvarande är meriterande. Gedigna kunskaper i statistik och vana att använda versionshanteringssystem (som Git) är önskvärt, likaså erfarenhet av systemadministration.

Önskvärt är även erfarenhet av arbete med olika typer av sekvensdata (Illumina, Oxford Nanopore, PacBio) samt arbete med både humana och mikrobiella sekvensdata. Önskvärt är även erfarenhet av att utföra analyser på datorkluster (t.ex. UPPMAX), erfarenhet av att använda analyshanteringsverktyg såsom Snakemake och Nextflow samt förståelse för och erfarenhet av att hantera säkerhetsaspekter som rör patientdata och genetisk information.

Stor vikt läggs vid personliga egenskaper såsom kommunikativ och pedagogisk förmåga. Vi söker dig som har ett stort driv att arbeta självständigt och samtidigt har god förmåga att bidra i ett team. Vi ser positivt på att du bedriver egen forskning. Med anledning av den snabba utvecklingen i fältet vill vi att du som sökande lämnar kontaktuppgifter till en eller gärna flera referenspersoner som kan styrka åberopade meriter.

ÖVRIGT
Läs mer om våra förmåner för dig som jobbar med oss på webbsidan
https://www.regionvasterbotten.se/nar-du-jobbar-hos-oss/att-vara-medarbetare

Vi strävar efter en jämn könsfördelning och ser mångfald som en styrka och välkomnar därför sökande med olika bakgrund.

Inför rekryteringsarbetet har vi tagit ställning till rekryteringskanaler och marknadsföring. Vi undanbeder oss därför bestämt kontakt med mediesäljare, rekryteringssajter och liknande.

Om du har skyddad identitet och vill ansöka så kontaktar du rekryterande chef och skickar sedan in dina ansökningshandlingar via post.

Ersättning
Enligt avtal.

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2024-03-22
Klicka på denna länk för att göra din ansökan

Arbetsgivarens referens
Arbetsgivarens referens för detta jobb är "C181255".

Omfattning
Detta är ett heltidsjobb.

Arbetsgivare
Region Västerbotten (org.nr 232100-0222)

Arbetsplats
Region Västerbotten, Laboratoriemedicin

Kontakt
Medicinsk chef
Magnus Burstedt
magnus.burstedt@regionvasterbotten.se
785 28 58

Jobbnummer
8525538

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Prenumerera på jobb från Region Västerbotten, Laboratoriemedicin

Fyll i din e-postadress för att få e-postnotifiering när det dyker upp fler lediga jobb hos Region Västerbotten, Laboratoriemedicin: