Projektassistent inom bioinformatik och mikrobiomforskning
Lunds Universitet, medicinska fakulteten / Högskolejobb / Lund
2025-03-21
Visa alla högskolejobb i Lund,
Lomma,
Staffanstorp,
Burlöv,
Kävlinge eller i
hela Sverige Visa alla jobb hos Lunds Universitet, medicinska fakulteten i Lund,
Malmö eller i
hela Sverige Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens främsta lärosäten. Här finns omkring 47 000 studenter och mer än 8 800 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.
Lunds universitet välkomnar sökande med olika bakgrund och erfarenheter. Jämställdhet, lika villkor och mångfald är grundläggande principer för alla delar av vår verksamhet.
Beskrivning av arbetsplatsen
Forskningen bedrivs vid Lunds universitet inom en tvärvetenskaplig forskargrupp med expertis inom strukturbiologi, genmodifiering, bioinformatik, mikrobiologi och sekvenseringstekniker.
Gruppen samarbetar med forskare inom miljömikrobiologi och medicinsk forskning för att utveckla innovativa metoder för mikrobiomanalys. Vi är en öppen, självständig och tolerant forskningsgrupp som värdesätter mångfald och interdisciplinärt samarbete. Tjänsten kan komma att innebära resor till Köpenhamn vid behov.
Vi erbjuder
Lunds universitet är en statlig myndighet vilket innebär att du får särskilda förmåner, generös semester och en förmånlig tjänstepension.
- En dynamisk forskningsmiljö med tillgång till avancerad sekvenseringsteknik.
- Möjlighet att arbeta i ett internationellt team med expertis inom bioinformatik och mikrobiologi.
Läs mer på universitetets webbplats om att vara anställd hos oss
https://www.lu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss.Arbetsuppgifter och ansvarsområden
- Utföra DNA-sekvenseringsanalyser med Oxford Nanopore-teknologi.
- Bygga och optimera pipelines för bioinformatisk analys av metagenomiska data.
- Utföra taxonomisk klassificering och identifiera eCIS-kluster i mikrobiella samhällen.
- Analysera antibiotikaresistensgener och deras spridningsmönster.
- Publicera forskningsresultat i vetenskapliga tidskrifter och presentera vid internationella konferenser.
- Samarbeta med forskarteamet för att utveckla innovativa metoder för mikrobiomanalys.
Kvalifikationer
Tjänsten innebär arbete inom ett forskningsprojekt som syftar till att identifiera och analysera Extracellular Contractile Injection Systems (eCIS) i avloppsvatten och human mikrobiom. Forskningsgruppen arbetar i en tvärvetenskaplig miljö med expertis inom bioinformatik, mikrobiologi och sekvenseringstekniker.
Som projektassistent kommer du att ansvara för DNA-extraktion, bibliotekspreparering och sekvensering med Oxford Nanopore-teknologi. Du kommer att analysera metagenomiska data och utveckla pipelines för att identifiera mikrobiella samhällen, antibiotikaresistensgener och eCIS-kluster. Tjänsten innebär nära samarbete med forskare inom avloppsvattenforskning, mikrobiomstudier och bioinformatik.
Krav för anställningen är:
- Mastersexamen inom bioinformatik, mikrobiologi, bioteknik eller relaterat område.
- Erfarenhet av sekvenseringsdataanalys och bioinformatikverktyg (t.ex. Kraken2, Prokka, BLAST).
- Erfarenhet av att arbeta med Python, R och Unix-baserade system.
- Förmåga att självständigt driva forskning och analysera stora datamängder.
- God kommunikationsförmåga och vana att samarbeta i tvärvetenskapliga team.
Meriterande för anställningen är:
- Erfarenhet av Oxford Nanopore-sekvensering och bibliotekspreparering.
- Kunskap om maskininlärning för metagenomisk dataanalys.
- Erfarenhet av att skriva vetenskapliga publikationer och ansökningar.
- Tidigare arbete med antibiotikaresistensforskning.
Övrigt
Anställningen är en särskild visstidsanställning på 100% under ett år.
Önskat startdatum är 2025-06-01 eller enligt överenskommelse.
Så här söker du
- Personligt brev, där du beskriver din motivation och hur din erfarenhet matchar tjänsten.
- CV, inklusive publikationslista.
- Examensbevis och relevanta certifikat.
- Kontaktuppgifter till minst två referenser.
Medicinska fakulteten är ett verksamhetsområde inom Lunds universitet, med ansvar för utbildning och forskning inom medicin, vård och hälsa. Utbildningen sker i nära samverkan med sjukvården och är väl förankrad i fakultetens starka forskningstradition. Fakultetens forskning spänner över ett brett fält inom experimentell grundforskning, patientnära klinisk forskning och hälsovetenskaplig forskning. Medicinska fakulteten, med drygt 1800 anställda och 2700 studenter i Lund, Malmö och Helsingborg, är en kunskapsintensiv mötesplats för studenter, lärare och forskare från hela världen.
Vi undanber oss alla kontakter från annonsförsäljare, rekryterings- och bemanningsföretag på grund av statliga upphandlingsregler.
Ersättning Månadslön
Så ansöker du Sista dag att ansöka är 2025-04-04
Klicka på denna länk för att göra din ansökan Arbetsgivarens referens Arbetsgivarens referens för detta jobb är "PA2025/758".
Omfattning Detta är ett heltidsjobb.
Arbetsgivare Lunds Universitet (org.nr 202100-3211)
Arbetsplats Lunds universitet, Medicinska fakulteten
Kontakt Eva Rebrova
eva_maria.rebrova@med.lu.se 0462220000 Jobbnummer 9237976