Postdoktor i genomik med fokus på parasitisk sjukdom hos laxfisk

Sveriges lantbruksuniversitet / Biologjobb / Uppsala
Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Visa alla biologjobb i Uppsala, Östhammar, Sigtuna, Österåker, Håbo eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Sveriges lantbruksuniversitet i Uppsala, Östhammar, Solna, Stockholm, Ekerö eller i hela Sverige

Institutionen för akvatiska resurser
Institutionen för akvatiska resurser (SLU Aqua) utvecklar kunskap inom färsk-, brack- och saltvattensekologi med fokus på fisk och skaldjur. Vi bedriver forskning, utbildning, miljöövervakning och analys samt biologisk rådgivning för att främja hållbart nyttjande av akvatiska resurser. Institutionen har drygt 180 anställda vid tre avdelningar: utanför Göteborg (Lysekil), Stockholm (Drottningholm) och Uppsala (Öregrund), samt vid fyra fältstationer. Vår kombination av forskning och råd till förvaltning, från lokal till internationell skala, skapar en stimulerande miljö för forskning med stor samhällsrelevans. Välkommen att besöka oss på www.slu.se/akvatiskaresurser!

Bakgrund:
Vi välkomnar ansökningar till en postdoktortjänst med fokus på att studera genetik hos parasitsjukdomar hos laxfisk. Tjänsten är en av tre spännande postdoktortjänster i avancerad ekologi och genomik som utlyses samtidigt vid institutionen. Tjänsterna är kopplade till projekt som kommer att lösa viktiga ekologiska frågeställningar och ta fram kunskap som behövs för att svara på en stor samhällsutmaning: hållbar matproduktion i framtida klimat.

Kandidaten kommer ansluta sig till Prof. Anti Vasemägi's forskargrupp vid Sötvattenslaboratoriet, Drottningholm, som fokuserar på att förstå relationerna mellan genotyp och fenotyp, genetisk grund för anpassning och hur nutida naturligt och mänskligt inducerat urval fungerar på en ekologisk tidsskala. Projektet bygger på tidigare arbeten med värd-parasit-interaktioner och effekter av proliferativ njursjukdom (PKD) hos laxfisk.

Klimatförändring förutses ha viktiga effekter på värd-parasit relationer. En följd av detta är att parasiters viktiga roll i ekosystemets funktion blivit alltmer erkänt. Detta projekt syftar till att belysa spridning, förekomst, sammankoppling och effekt av den temperaturberoende sjukdomen PKD på anadroma laxfiskar i Östersjön. Vi fokuserar på parasiter från släktet Myxozoa, Tetracapsuloides bryosalmonae, orsakssambandet till PKD, vilken kan orsaka hög dödlighet både hos vilda och odlade laxpopulationer. Genom att kombinera genomiska och transkriptomiska tillvägagångssätt, långtida temperaturdata och tillgängliga ekologiska data kommer detta projekt att; i) samla kritisk information om spridningen, prevalensen och fysiologiska effekterna av T. bryosalmonae hos öring- och laxpopulationer runt Östersjön; ii) beskriva parasiternas genetiska struktur och likheter mellan älvar samt iii) utvärdera ekologiska effekter av PKD.

Publiceringsdatum
2018-07-13

Dina arbetsuppgifter
Du kommer att vara en del av vår forskargrupp som arbetar med molekylär ekologi och populationsgenetik hos vattenlevande organismer. Du kommer att utföra laboratoriearbete, bioinformatik och genetiska analyser av öring- och laxpopulationer för att karakterisera spridningen, prevalensen och sammankoppling av T. bryosalmonae och effekterna av PKD. Ditt huvudansvar innefattar fenotypning, provinsamling, DNA-extraktion, biblioteksberedning, analyser av nästa generations sekvensdata, skriva vetenskapliga manuskript samt föra detaljerade anteckningar över analyserna. I arbetet ingår även att delta i andra mindre projekt kopplade till forskningsgruppen. Arbetet kan också innefatta mentorskap av studenter.

Kvalifikationer
Vi söker en motiverad kandidat med doktorsexamen i evolutionär biologi, genomforskning, bioinformatik eller liknande. Sökande ska ha en stark bakgrund i nästa generations sekvenseringsdataanalys, transkriptomik, populationsgenetik och/eller värd-parasit interaktioner, som kan styrkas av publikationer i relevanta vetenskapliga tidskrifter. Sökande bör vara bekanta med ett eller flera programmeringsspråk (såsom Python, Perl eller R). Utmärkta kunskaper i muntlig och skriftlig kommunikation på engelska är ett krav. Sökande ska kunna arbeta både självständigt och som en del av en forskargrupp.

Eftersom anställning som postdoktor utgör en meriteringsanställning för juniora forskare, riktar vi oss i första hand till den som har en doktoresexamen som inte är äldre än tre år.

Placering:
Drottningholm, Stockholm.

Anställningsform:
Tidsbegränsad, 24 månader.

Omfattning:
100%.

Tillträde
Enligt överenskommelse.

Så ansöker du
Välkommen med din ansökan via ansökningsknappen nedan senast den 28 augusti 2018.

Din ansökan skall vara skriven på engelska och innehålla (1) motivering hur du matchar projektet och vårt forskningsområde samt hur du uppfyller önskade kvalifikationer i annonsen (max 1 sida), (2) publikationslista och CV som dokumenterar din akademiska karriär och utbildning, (3) kopior på doktorsexamensbevis och master och/eller bachelorexamen, samt registerutdrag, (4) kontaktuppgifter till två referenspersoner (namn, relation till sökande, e-post och telefonnummer).

Fackliga kontaktpersoner: https://internt.slu.se/min-anstallning/facket/kontaktpersoner/

Sveriges lantbruksuniversitet (SLU) utvecklar kunskapen om de biologiska naturresurserna, och hur vi kan förvalta och utnyttja dem på ett hållbart sätt. Detta sker genom utbildning, forskning och miljöanalys, i nära samverkan med näring och samhälle. SLU är ett internationellt och forskningsintensivt universitet, men erbjuder också unika utbildningar som agronom, veterinär, jägmästare, miljöekonom och landskapsarkitekt.

SLU har drygt 3000 medarbetare, 5000 studenter och forskarstuderande och en omsättning på över tre miljarder kronor. Universitetet satsar på attraktiva miljöer på sina campusområden i Alnarp, Umeå och Uppsala.

www.slu.se

SLU eftersträvar mångfald och jämn könsfördelning.

Varaktighet, arbetstid
Heltid/ Ej specificerat

Ersättning
Fast lön

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2018-08-28
Klicka på denna länk för att göra din ansökan

Kontakt
Anti Vasemägi, Professor anti.vasemagi@slu.se +46(0)104784277

Företag
Sveriges lantbruksuniversitet

Adress
Sveriges lantbruksuniversitet
Turistgatan 5
45330 Lysekil

Kontorsadress
Turistgatan 5

Jobbnummer
4253731

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Postdoktor i genomik med fokus på parasitisk sjukdom hos laxfisk

Prenumerera på jobb från Sveriges lantbruksuniversitet