Postdoktor i farmakogenetik och bioinformatik
Linköpings universitet / Biomedicinjobb / Linköping
Observera att sista ansökningsdag har passerat.
Visa alla biomedicinjobb i Linköping,
Mjölby,
Åtvidaberg,
Finspång,
Motala eller i
hela Sverige Visa alla jobb hos Linköpings universitet i Linköping,
Finspång,
Motala,
Norrköping,
Kinda eller i
hela Sverige Kunniga och engagerade medarbetare med goda förutsättningar är en av de absolut viktigaste framgångsfaktorerna för Linköpings universitet. Lärare och forskare är vår kärnkompetens, men ett framgångsrikt universitet behöver erfarna och motiverade medarbetare inom många områden. Alla roller är viktiga. Vi har ett stort rekryteringsbehov bland annat tack vare en forskningsverksamhet i expansion. Du behövs här. Välkommen att söka jobb hos oss!
Institutionen för klinisk och experimentell medicin (IKE) är en av universitetets största institutioner med verksamhet framför allt inom den medicinska fakulteten.
Vår målsättning är att bedriva utbildning och forskning inom medicin och biomedicin, med hög internationell kvalitet. Inom grundutbildningen ansvarar vår institution bland annat för huvuddelen av läkarutbildningen, logopedutbildningen och utbildning inom medicinsk biologi.
Läs mer:
https://liu.se/organisation/liu/ikeInom institutionen pågår just nu ett utvecklingsarbete som från och med årsskiftet 2019-2020 kommer resultera i att IKE genomgår en omorganisation i vissa delar och byter namn till Institutionen för Biomedicinska och kliniska vetenskaper (BKV).
LINKÖPINGS UNIVERSITET
ledigförklarar en anställning som
postdoktor i farmakogenetik och bioinformatik med fokus på kemoterapiinducerade biverkningar
med placering vid Institutionen för biomedicinska och kliniska vetenskaper
Publiceringsdatum2019-12-19Dina arbetsuppgifter En postdoktor ska i huvudsak bedriva forskning. Även undervisning kan ingå i arbetsuppgifterna, dock till högst en femtedel av arbetstiden.
I din roll som postdoktor i farmakogenetik och bioinformatik kommer du att arbeta med analys av genotypningsdata från helexom- och helgenomsekvenseringsstudier av patienter med bröst- och lungcancer. Analyserna genomförs för att prediktera och förstå biverkningarna som patienterna upplever vid genomgång av sina respektive kemoterapibehandlingar, framför allt de neuropatiska och myelosuppressiva biverkningarna.
Du kommer även att:
• utföra singel-cell RNA sekvensering för att förstå kemoterapibehandlingars toxiska effekter på mänskliga hematopoietiska stamceller
• utföra cellodling med hantering och behandling av både hematopoetiska stamceller och cellinjer i renlabb av säkerhetsklass 2
• tillämpa bioinformatisk förbearbetning av sekvenseringsdata för att sedan genomföra slutgiltiga resultatinriktade analyser, i viss mån på superdatorcluster.
• tillämpa bioinformatiska machine learning verktyg så som LASSO, PCA, klustring, t-SNE, UMAP, wGRS och GATK på många plan genom alla projektets studier för att kunna dra kraftfulla slutsatser
• hantera känslig sekvenseringsdata knutna till patienter i kliniska studier
Behörighet
Behörig till anställning som postdoktor är den som har avlagt doktorsexamen eller har en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen, och som har avlagt examen högst tre år före ansökningstidens utgång.
Du behöver ha stor vana av att analysera helexom- och helgenomssekvenseringsdata och singel-cell RNA sekvenseringsdata samt tillhörande dimensionsreduktions-tekniker, klustring och visualisering. Du behöver även ha kompetens från kliniska studier av kemoterapiinducerade biverkningar/toxicitet och kunna sätta upp relevanta polygenetiska klassifikations- och prediktionsmodeller för risk av kemoterapiinducerade biverkningar. Vi kommer lägga stor vikt på kompetens inom cellodling samt labbvana, speciellt premieras tidigare studier och odling av mänskliga hematopoetiska stamceller. Du behöver också vara van vid att genomföra bibliotekspreparation inför sekvensering och programmering i datorprogrammen R och Unix.
Förordnandetid
En postdoktor får anställas tills vidare dock längst två år. Anställningen får förlängas om det finns särskilda skäl.
Tillträde Snarast enligt överenskommelse.
Ersättning Universitetet tillämpar individuell lönesättning.
Facklig kontakt För kontakt med fackliga kontaktpersoner se nedan.
Ansökningsförfarande
Du söker denna anställning genom att klicka på knappen "Ansök" nedan. Din ansökan ska vara Linköpings universitet tillhanda senast den 9 januari 2020. Ansökan som inkommer efter sista ansökningsdag beaktas ej.
Lika villkor
Linköpings universitet ska fortsätta att utvecklas som en attraktiv och kreativ arbetsplats som präglas av lika villkor och arbetar därför aktivt för jämställdhet och mångfald.
Välkommen med din ansökan!
Linköpings universitet har upphandlade avtal och undanber oss direktkontakt från bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av platsannonser.
Varaktighet, arbetstid
Heltid/ Ej specificerat
ErsättningUniversitetet tillämpar individuell lönesättning.
Så ansöker duSista dag att ansöka är 2020-01-09
Klicka på denna länk för att göra din ansökanFöretagLinköpings Universitet
Omfattning Detta är ett heltidsjobb.
Arbetsgivare Linköpings Universitet (org.nr 202100-3096),
https://www.liu.se/ Jobbnummer 5011668
Observera att sista ansökningsdag har passerat.