Förste forskningsingenjör inom bioinformatik
Linköpings universitet / Biomedicinjobb / Linköping
2026-03-24
Visa alla biomedicinjobb i Linköping,
Mjölby,
Åtvidaberg,
Finspång,
Motala eller i
hela Sverige Visa alla jobb hos Linköpings universitet i Linköping,
Finspång,
Motala,
Norrköping,
Kinda eller i
hela Sverige Vi har kraften från över 40 000 studenter och medarbetare. Studenter som ger framtidshopp. Medarbetare som varje dag bidrar till att Linköpings universitet tar sig an samtidens utmaningar. Vår värdegrund vilar på trovärdighet, tillit och trygghet. Genom att vara modiga, tänka fritt och göra nytt skapar vi tillsammans, med stora och små handlingar, en bättre framtid. Välkommen att söka jobb hos oss!
Om jobbet
Vi söker en bioinformatiker med erfarenhet av att jobba inom en core facilitet med bred kompetens men en viss inriktning mot mikrobiologi. Arbetsuppgifterna kommer att omfatta både underhåll av olika befintliga bioinformatiska arbetsflöden och vidare utveckling av nya pipelines. Analyserna kommer till stor del att utföras på GPUer och en del av uppdraget kommer att omfatta arbete med effektiv datahantering och visualisering för att underlätta tolkning och i vissa fall klinisk rapportering.
Arbetet utförs i nära samarbete med kliniskt verksam personal samt med Genomic Medicine Sweden. Rollinnehavaren kommer att vara inblandad i kontinuerlig utvärdering, utveckling och automatisering av robusta bioinformatiska analyser för att processa short- eller long-read sekvenser och RNA-seq för båda forsknings- och kliniskt bruk. Att vara intresserade av arbetsuppgifter som omfattar databashantering och mjukvaruutveckling vore positivt och erfarenhet med NextFlow eller Python krävs.
Rollen innebär ett samarbete med anställda inom såväl akademin som sjukvården och frågor kring datasäkerhet är viktiga. Faciliteten har därför ett eget kluster och de anställda väntas bidra med stöd till underhåll och uppdatering av mjukvaror här. Det kommer att finnas möjlighet till publicering och presentation av både tekniska och biologiska resultat och metoder. De kommer att jobba tillsammans med andra bioinformatiker, läkare och molekylärbiologer inom vår facilitet och även i nationella och internationella samarbeten.
Eftersom rollen även innefattar bioinformatiskt stöd till samarbetsprojekt med Genomic Medicine Sweden, liksom till forskare som arbetar med icke-modellorganismer, är ytterligare ämnesspecifika kompetenser önskvärda. Dessa kan omfatta kunskaper inom mikrobiologi och antimikrobiell resistens, särskilt i samband med sekvensering med långa läsningar.
Om dig
Vi söker dig som tar ansvar för dina arbetsuppgifter och driver processer framåt. Du är strukturerad, gillar att samarbeta och kommunicerar väl med andra på ett lyhört och smidigt sätt.
Vi vill att du har:
• Doktorsexamen med relevans för tjänsten t.ex. inom bioinformatik, datavetenskap eller motsvarande
• Minst 5 års erfarenhet av att arbeta i en forskningsmiljö med bioinformatik, genomik och tolkning av storskaliga data
• Minst ett års erfarenhet av att arbeta i en core facilitet med bioinformatik, genomik och tolkning av storskaliga data
• En avancerad kompetens i hantering av vanliga och specialiserade bioinformatikverktyg och programvara
• Bra färdigheter i att utforma och implementera bioinformatiska pipeliner
• God förmåga att kommunicera på engelska
• Dokumenterad förmåga inom Nextflow eller Python, helst till nf-core eller Snakemake standarder
• Erfarenhet av att arbeta i linuxmiljö
• Förmåga att effektivt kommunicera fullständiga bioinformatiska koncept till både tekniska och icke-tekniska målgrupper.
• Erfarenhet av containermjukvaror som t.ex. Singularity (Apptainer)/Docker/Podman
• Förmåga att hantera data från icke-modell organismer
• Praktiska kunskaper om hantering av metagenomisk data, inklusive nanopore
Det är meriterande om du har:
• Erfarenhet av epigenomiska klassificeringsverktyg för tumörer, sällsynta sjukdomar eller liknande
• Erfarenhet av undervisning och utveckling av läromedel anses meriterande
• Kunskap om Clinical Genomics och Genomic Medicine Sweden
Din arbetsplats
Du kommer att arbeta på Clinical Genomics corefaciliteten som tillhör både Avdelningen för cell- och neurobiologi (CNB) på Instutitionen för biomedicinska och kliniska vetenskaper (BKV) och Medicinska fakulteten.
Läs mer om vår verksamhet här
https://liu.se/organisation/liu/bkv/cnb Om anställningen
Tillsvidareanställning. Heltid
Tillträde enligt överenskommelse.
Lön och förmåner
Linköpings universitet tillämpar individuell lönesättning.
Läs mer om förmåner för anställda här.
Publiceringsdatum2026-03-24Facklig kontaktInformation om fackliga kontaktpersoner, se Hjälp för sökande.
Så ansöker duVälkommen att skicka in din ansökan med CV och ansökningsbrev senast den 14 april 2026. Du söker denna anställning genom att klicka på knappen "Ansök" här nedan. Ansökan som inkommer efter sista ansökningsdag kommer inte att beaktas.
Vi välkomnar sökande med olika bakgrund, erfarenheter och perspektiv, det berikar och utvecklar vår verksamhet. För oss är det självklart att värna om allas lika värde, rättigheter och möjligheter. Läs om vårt arbete med Lika villkor.
Välkommen med din ansökan!
Linköpings universitet har upphandlade avtal och undanber oss direktkontakt från bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av platsannonser.
Ersättning Individuell lönesättning tillämpas
Så ansöker du Sista dag att ansöka är 2026-04-14
Klicka på denna länk för att göra din ansökan Omfattning Detta är ett heltidsjobb.
Arbetsgivare Linköpings Universitet (org.nr 202100-3096),
https://www.liu.se/ Kontakt Biträdande professor
Colm Nestor
colm.nestor@liu.se 013-28 26 54 Jobbnummer 9815918