Förste forskningsingenjör inom bioinformatik
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet / Biologjobb / Umeå
Observera att sista ansökningsdag har passerat.
Visa alla biologjobb i Umeå,
Vännäs,
Nordmaling,
Vindeln,
Robertsfors eller i
hela Sverige Visa alla jobb hos Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet i Umeå,
Nordmaling,
Örnsköldsvik,
Kiruna,
Huddinge eller i
hela Sverige Umeå universitet satsar på kreativa miljöer för studier och arbete. Hos oss finns attraktiva utbildningar, världsledande forskning och utmärkta innovations- och samverkansmöjligheter. Fler än 4 300 medarbetare och 31 500 studenter har redan valt Umeå universitet. Välj oss du också.
Institutionen för fysiologisk botanik, en del av Umeå Plant Science Centre (
https://www. upsc.se), i samarbete med SciLifeLab (
https://www.scilifelab.se) söker en förste forskningsingenjör inom bioinformatik. Huvudsyftet är att samarbeta med UPSCs bioinformatikplattform i framställningen av nästa iteration av grangenomet och dess annotation.
Anställningen är på heltid under två år med tillträde 2018-07-01 eller enligt överenskommelse.
Publiceringsdatum2018-05-03BeskrivningUmeå Plant Science Centre söker en bioinformatiker som ska bidra till grangenomprojektet. Huvudsyftet med projektet är att generera en förbättrad genomsekvens med tillhörande annotation, och detta inkluderar analys av data från de senaste sekvenseringsteknologierna ("long read sequencing"). Projektet är en uppföljning av grangenomet. Den uppdaterade genomsekvensen och annotationen ska integreras i existerande verktyg och resurser som tillhandahålls av UPSC, såsom Plant Genome Integrative Explorer.
Arbetsuppgifter
Anställningens huvudsakliga arbetsuppgifter är: (i) hantering av DNA-sekvenseringsdata (mestadels från tredje generationens DNA-sekvenseringsteknologi), och det kan även innebära utveckling av nya verktyg för att uppfylla projektets mål; (ii) integration av dessa data i Plant Genome Integrative Explorer; (iii) att hålla sig uppdaterad med den senaste utvecklingen av mjukvara och andra verktyg; (iv) att bidra till utvecklingen av ett generaliserat arbetsflöde för genomsammanställning med tredje generationens sekvenseringsdata, med en uppföljning av originalprojektet i form av sekvensering och sammanställning av genomet hos tall.
KvalifikationerDu ska ha avlagt doktorsexamen i beräkningsbaserad biologi eller bioinformatik, eller motsvarande. Du ska vara bekant med UNIX och minst ett av de programmeringsspråk vi använder mest (Python, R, C, C++). Kännedom om databasdesign och systemadministration är meriterande, så även kännedom om sekvenseringsteknologier, programmering i R, och statistik. Kännedom om webbdesign och utveckling av webbapplikationer, inklusive serverinstallation och underhåll, är ett krav. Viktigt är att du har god samarbetsförmåga och att du kan interagera väl med andra (biologer, bioinformatiker, datavetare). Du ska behärska det engelska språket väl både i tal och skrift, samt ha erfarenhet av att skriva och presentera vetenskapliga rapporter.
Så ansöker duAnsökan ska innehålla: (1) CV med lista av publikationer och kopior av relevanta examina; (2) beskrivning av forskningserfarenhet; (3) redogörelse av vetenskapliga intressen; (4) kontaktinformation till två referenser.
Institutionen för fysiologisk botanik är en del av Umeå Plant Science Centre med cirka 200 medarbetare som består av bland annat av 40 gruppledare och representerar för närvarande 48 olika nationaliteter (för mer information, se
http://www.upsc.se eller
http://www.plantphys.umu.se/english/). Vår huvudsakliga verksamhet är akademisk forskning och utbildning som innefattar områden som ekologi, biokemi, plant fysiologi samt genomik.
Umeå universitet vill erbjuda en miljö där öppna samtal mellan människor med olika bakgrund och perspektiv lägger grunden för lärande, skaparkraft och utveckling. Vid varje rekrytering strävar vi efter ökad mångfald och använder möjligheten till positiv särbehandling.
Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser.
Varaktighet, arbetstid
100%. Tillträde: 20170701 eller enligt överenskommelse Visstidsanställning
ErsättningMånadslön
Så ansöker duSista dag att ansöka är 2018-05-24
Ange följande referens när du ansöker: AN 2.2.1-789-18
Klicka på denna länk för att göra din ansökanKontaktNicolas Delhomme 090-786 5478
FöretagUmeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet
AdressUmeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet
Umeå universitet
90187 Umeå
KontorsadressUmeå universitet
Jobbnummer 4121677
Observera att sista ansökningsdag har passerat.