Forskare inom genomik

Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiologi / Kemiingenjörsjobb / Uppsala
2025-11-05

Prenumerera på nya jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiologi

Visa alla kemiingenjörsjobb i Uppsala, Östhammar, Sigtuna, Österåker, Håbo eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiologi i Uppsala

Vill du arbeta med genomik, med stöd av kompetenta och trevliga kollegor i en internationell miljö? Vill du ha en arbetsgivare som satsar på ett hållbart medarbetarskap och erbjuder trygga, förmånliga arbetsvillkor? Välkommen att söka anställning som forskare på Uppsala universitet.

Institutionen för cell- och molekylärbiologi är organiserad i sju forskningsprogram som fokuserar på olika områden inom cell- och molekylärbiologi: Beräkningsbiologi och bioinformatik, Mikrobiologi och immunologi, Molekylärbiologi, Molekylär biofysik, Molekylär evolution, Molekylära systembiologi och Strukturbiologi. Den vetenskapliga grunden för vår verksamhet ligger i biologin, men vår forskning överlappar även med områden som medicin, datavetenskap, matematik, kemi, teknisk vetenskap och fysik. Totalt är vi över 200 anställda och cirka 60 doktorander. Läs mer om institutionens verksamhet på https://icm.uu.se

Denna forskartjänst är inom https://www.uu.se/institution/cell-och-molekylarbiologi/forskning/molekylar-evolution och kommer att handledas av Courtney Stairs. Varje ekosystem på vår planet består av ett komplext samhälle av organismer. Ekosystemens funktion är ofta beroende av interaktioner - eller symbioser - mellan medlemmarna i samhället. I den mikrobiella världen är symbiotiska interaktioner ofta baserade på syntrofi (dvs. en typ av mutualistisk symbios där näringsämnen utbyts mellan organismer för att möjliggöra metabolisk arbetsfördelning). Detta är vanligt mellan prokaryoter i syrefattiga miljöer och utgör viktiga drivkrafter för vitala globala biogeokemiska kretslopp av till exempel kol, kväve och svavel. Huruvida liknande roller kan tillskrivas protister som lever i dessa miljöer är fortfarande oklara på grund av vår begränsade förståelse av anaeroba eukaryoters biologi, syntrofisk potential och metabolism.

Publiceringsdatum
2025-11-05

Dina arbetsuppgifter
Arbetet fokuserar på utveckling av genomiska verktyg för att studera enskilda protistceller. Några av de planerade metoderna inkluderar odling av anaeroba protister, bioinformatisk analys, långlässekvensering med ONT, miljöprovtagning, 18S-metabarkodning, metagenomik och fylogenetisk analys.

Kvalifikationskrav
- Doktorsexamen i biologi med inriktning mot genomik.
- Mycket goda kunskaper i engelska, både i tal och skrift.
- Dokumenterad erfarenhet av helgenomsekvensering av icke-modellorganismer, inklusive anrikning av eukaryota celler, extraktion av DNA med hög molekylvikt samt förberedelse av DNA-library.
- Erfarenhet av långlässekvensering (ONT) för helgenom- och metagenomforskning, inklusive basecalling och utvärdering av datakvalitet.
- Dokumenterad erfarenhet av evidensbaserad de novo-genomannotering för icke-modellorganismer, med integrering av transkriptom- och proteinhomologievidens.
- Vana att arbeta i Linux-baserade miljöer och på högpresterande beräkningskluster, med god kunskap i Bash/awk, Python och R samt erfarenhet av arbetsflödesutveckling (Snakemake) och samarbetsinriktad kodhantering via GitHub för reproducerbar och delbar forskning.
- Erfarenhet av arbete under anaeroba förhållanden, inklusive hantering av prokaryoter och protister.
- Goda meriter av publicering i peer-reviewed vetenskapliga tidskrifter.
- Förmåga att arbeta effektivt både självständigt och som en del av ett team.
- Förmåga att organisera resurser, planera och utveckla arbetsaktiviteter samt hålla deadlines på ett konsekvent och effektivt sätt.
- Förmåga att kommunicera vetenskapliga resultat och kunskap till icke-specialister och studenter.

Önskvärt/meriterande i övrigt
- Dokumenterad erfarenhet av jämförande genomik av cellbiologiska egenskaper.
- Dokumenterad erfarenhet av att designa utvärderingsramverk utan referens för att bedöma genommonteringens fullständighet, noggrannhet och annoteringskvalitet.
- Erfarenhet av miljöprovtagning, 18S-metabarkodning och metagenomanalyser.

Så ansöker du
Ansökan kan skrivas på svenska/engelska och ska innehålla;

- CV inkl. kontaktuppgifter till minst två referenser och publikationslista (max 5 sidor)
- Kopia av examensbevis för doktorsexamen samt ev. andra intyg/betyg som du önskar åberopa.

Om anställningen
Anställningen är tillsvidare (provanställning kan tillämpas). Omfattningen är heltid. Tillträde 2026-03-01 eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Courtney Stairs courtney.stairs@icm.uu.se

I denna rekrytering har vi ersatt det personliga brevet med frågor som du besvarar i samband med din ansökan. Svaren kommer att användas som en del i urvalsprocessen.

Välkommen med din ansökan senast den 21 november 2025, UFV-PA 2025/3409.

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 600 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet
https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/

Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.

Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Fackliga företrädare: Saco-S - saco-s@uu.se, Seko - seko@uadm.uu.se, ST (OFR/S) - ofr@uu.se

Ersättning
Individuell lönesättning

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2025-11-21
Klicka på denna länk för att göra din ansökan

Arbetsgivarens referens
Arbetsgivarens referens för detta jobb är "UFV-PA 2025/3409".

Omfattning
Detta är ett heltidsjobb.

Arbetsgivare
Uppsala Universitet (org.nr 202100-2932)

Arbetsplats
Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiologi

Jobbnummer
9589506

Prenumerera på jobb från Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiologi

Fyll i din e-postadress för att få e-postnotifiering när det dyker upp fler lediga jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiologi: