Forskare i proteomik och eukaryotisk evolution
Uppsala universitet, Institutionen för organismbiologi / Kemiingenjörsjobb / Uppsala
2025-03-04
Visa alla kemiingenjörsjobb i Uppsala,
Östhammar,
Sigtuna,
Österåker,
Håbo eller i
hela Sverige Visa alla jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för organismbiologi i Uppsala Vid institutionen för organismbiologi bedriver vi undervisning och forskning om evolution, utveckling och funktion på organismnivå.
Vi studerar också de djupaste förgreningarna i livets träd med hjälp av bioinformatik och experimentella molekylära tekniker. Forskning om hur kemikalier av antropogent ursprung interagerar med cellfunktioner och ger upphov till långvariga hälsoeffekter på människor och djur utförs också. För mer information se
https://www.uu.se/institution/organismbiologi/Detta projekt är en del av ett ERC Consolidator-anslag (PlastidOrigin) som tilldelats Fabien Burki och syftar till att studera en av de mest omvälvande händelserna i eukaryoternas evolution - ursprunget till de fotosyntetiska organellerna (de primära plastiderna) i Archaeplastida.
Huvudsyftet med denna forskartjänst är att skapa en proteinatlas för varje organell hos utvalda rödalger och glaukofyter genom att använda helcellsbaserad spatial proteomik med hyperLOPITmetoden. Genom att kombinera dessa data med verifierade proteom för andra arkeplastider, och genom att söka efter homologer i andra eukaryoter och prokaryoter, vill vi karakterisera ursprunget för plastidproteiner och storleken på de endosymbiotiska vs icke-endosymbiotiska plastidproteomfraktionerna bland arkaeplastiderna.
Arbetsuppgifter
Upprätthålla kunskap och arbetsflöde för att utföra proteomiska experiment i labbet. Använd hyperLOPIT på rödalger och glaukofyter. Vara kontaktperson för kommunikation med masspektrometrifaciliteter. Utföra rutinmässiga underhåll av cellkulturer. Utveckla cellulär transformation hos rödalger. Arbeta med högupplösta 3D-mikroskopidata, såsom FIB-SEM-data. Generera och analysera RNA-seq-data. Odla rödalgkulturer och köra hyperLOPIT. Härleda den cellulära placeringen av protein med hjälp av maskininlärning. Analysera data i en plastidutvecklings context. Sprida resultat i lämpliga format, inklusive i ledande peer-reviewed publikationer och på konferenser. Utbildning av juniora gruppmedlemmar kan också ingå, liksom andra standarduppgifter relaterade till en forskargrupp.
Kvalifikationskrav
Doktorsexamen i biologi eller motsvarande. Kandidaten ska ha en gedigen lista, lämpligt för hens karriärstadium, av högkvalitativa forskningspublikationer För denna position är en beprövad erfarenhet av masspektrometri och proteomik absolut nödvändig, och måste demonstreras genom vetenskapliga publikationer inom dessa områden. Den sökande bör också ha dokumenterade färdigheter i våtlabbtekniker, såsom molekylärbiologi (dvs. PCR, kloning, Western blot, SDS-PAGE, extraktioner av protein/DNA/RNA), cellulär transformation och cellodling. Kunskaper i engelska, både muntligt och skriftligt, är ett krav. Utmärkta kunskaper i statistisk analys och bioinformatik (framför allt i R) krävs, och tidigare erfarenhet av R-paket för spatial proteomikanalys, såsom pRoloc, är mycket fördelaktigt.
Stor vikt läggs vid personliga egenskaper som hög motivation, planerings- och organisationsförmåga, problemlösning, stresshantering. Vi söker en entusiastisk person med viljan att dela och etablera en ny metodik i Burki-labbet. Vi strävar efter att skapa en vänlig atmosfär bland teammedlemmar och andra anställda på arbetsplatsen, så en kollegial förmåga att arbeta som en del av ett team är nödvändig.
Önskvärt/meriterande i övrigt
Tidigare erfarenhet av 3D-bildanalys, såsom FIB-SEM-data, kommer att betraktas som en värdefull merit. Förkunskaper om metoder för subcellulär fraktionering (med ultracentrifugering) och om hyperLOPIT eller LOPIT-DC kommer att ses som en stor tillgång. Ett starkt intresse för evolution och mikrobiella eukaryoter är en önskvärd egenskap. Du bör vara villig att resa, för kortare (t.ex. konferens) eller längre perioder om projektet kräver det.
Om anställningen
Anställningen är tillsvidare, provanställning kan tillämpas. Omfattning heltid. Tillträde 2025-04-01 eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala
Upplysningar om anställningen lämnas av: Fabien Burki,
fabien.burki@ebc.uu.seVälkommen med din ansökan senast den 18 mars 2025, UFV-PA 2025/630.
Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 600 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser.
Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet
https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd.
Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.
Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.
Ersättning Individuell lönesättning
Så ansöker du Sista dag att ansöka är 2025-03-18
Klicka på denna länk för att göra din ansökan Arbetsgivarens referens Arbetsgivarens referens för detta jobb är "UFV-PA 2025/630".
Omfattning Detta är ett heltidsjobb.
Arbetsgivare Uppsala Universitet (org.nr 202100-2932)
Arbetsplats Uppsala universitet, Institutionen för organismbiologi
Jobbnummer 9199217