Doktorand inom bioinformatik med fokus på dataintegration

Kungliga Tekniska högskolan, / Administratörsjobb (offentlig verksamhet) / Stockholm
Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Prenumerera på nya jobb hos Kungliga Tekniska högskolan,

Visa alla administratörsjobb (offentlig verksamhet) i Stockholm, Solna, Lidingö, Sundbyberg, Danderyd eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Kungliga Tekniska högskolan, i Stockholm, Solna, Huddinge eller i hela Sverige

KTH är ett av Europas ledande tekniska universitet och en viktig arena för kunskapsutveckling. Som Sveriges största universitet för teknisk forskning och utbildning samlar vi studenter, forskare och fakultet från hela världen. Vår forskning och utbildning omfattar såväl naturvetenskap som alla grenar inom teknik samt arkitektur, industriell ekonomi, samhällsplanering, teknisk historia och filosofi.




Publiceringsdatum
2017-12-13

Dina arbetsuppgifter
Forskargruppen inom Integrativ omik och precisionsmedicin på Skolan för Bioteknologi leds av professor Mathias Uhlén och har sina lokaler på Science for Life Laboratory i Solna.

Huvudprojektet för denna grupp är "Swedish-SCAPIS-SciLifeLab (S3) Wellness Profiling"-programmet, vilket startades för att definiera hälsoprofiler i en frisk population baserat på spjutspetsteknik inom molekylära analyser. I denna pilotstudie har 101 frivilliga, friska individer följts longitudinellt under två år med upprepade hälsokontroller och djupgående provtagningar som man kompletterat med mätning av bland annat sömn, puls och aktivitet genom aktivitetsklocka, livsstilsfrågeformulär och klinisk diagnostik. Proverna från det första året har analyserats i en stor mängd olika plattformar och det tillgängliga datat kommer från ett flertal metoder för proteinprofilering, immunologi, genomik, transkriptomik, metabolomik, mikrobiomstudier samt aktivitetsdata.

Forskargruppen är även involverad i ett antal olika dataintegrationsprojekt inom "Human Protein Atlas"-projektet (www.proteinatlas.org) som använder en kombination av genomik, transkriptomik, proteomik samt antikroppsbaserad profilering för att studera globala proteinuttrycksmönster i humana celler, vävnader och organ.

Vi utlyser nu en doktorandtjänst för att använda dessa stora mängder av data för integrativa studier. Denna tjänst kommer vara inriktat på avancerad bioinformatik, statistisk analys samt integration av data från dessa två stora projekt med fokus på transkriptomik- och proteomik-data.

Kvalifikationer
Den sökande ska ha en avklarad master, civilingenjörsexamen eller liknande nivå inom relevant forskningsfält, t.ex. bioteknik eller bioinformatik. Den sökande skall vara starkt motiverad för forskarstudier, ha förmåga till självständigt arbete och kritisk analys samt god samarbets- och kommunikationsförmåga. Eftersom forskningsmiljön på KTH är internationell krävs även god förmåga att kommunicera på engelska, både i tal och skrift. Den sökande bör ha en positiv inställning till att ta sig an nya utmaningar och projekt samt att arbeta strukturerat. Avancerade färdigheter inom programmering, främst i R, Python eller Perl är ett måste eftersom projekten är inom bioinformatik. Erfarenhet av tekniker inom proteomik och transkriptomik kommer att värderas högt.

En stor vikt kommer att läggas på den sökandes personliga egenskaper och förmåga att arbeta i grupp.

Fackliga representanter

Du hittar kontaktuppgifter till fackliga representanter på KTH:s webbsida.

Så ansöker du
Ansökan skall innefatta följande handlingar:

- CV
- Betygsavskrift från högskola/universitet
- Kortfattad redogörelse varför den sökande vill ägna sig åt forskarstudier

Du ansöker via KTH:s rekryteringssystem. Du som sökande har huvudansvaret för att din ansökan är komplett när den skickas in.

Ansökan ska vara KTH tillhanda senast sista ansökningsdagen vid midnatt, CET/CEST (Central European Time/Central European Summer Time).

Övrig information
Vi undanber oss direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av platsannonser.

Varaktighet, arbetstid
100%. Tillträde: enligt överenskommelse Visstidsanställning

Ersättning
månadslön enligt KTH:s avtal för doktorandlöner

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2018-01-08
Ange följande referens när du ansöker: B-2017-0937
Klicka på denna länk för att göra din ansökan

Kontakt
Linn Fagerberg, forskare, linn.fagerberg@scilifelab.se

Företag
Kungliga Tekniska högskolan,

Adress
Kungliga Tekniska högskolan,
Roslagstullsbacken 21
10691 Stockholm

Kontorsadress
Roslagstullsbacken 21

Jobbnummer
3852010

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Prenumerera på jobb från Kungliga Tekniska högskolan,

Fyll i din e-postadress för att få e-postnotifiering när det dyker upp fler lediga jobb hos Kungliga Tekniska högskolan,: