Doktorand i Medicinsk Bioinformatik

Uppsala universitet / Biologjobb / Uppsala
Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Visa alla biologjobb i Uppsala, Östhammar, Sigtuna, Österåker, Håbo eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Uppsala universitet i Uppsala, Upplands Väsby, Gävle, Gotland eller i hela Sverige

Doktorand i Medicinsk Bioinformatik - Beräkningsanalyser av peptid-, protein- och metabolitdata med fokus på neurodegenerativa sjukdomar vid Institutionen för Medicinska Vetenskaper, Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin, Uppsala universitet

Ett fyraårigt doktorandprojekt i medicinsk bioinformatik är tillgänglig på Institutionen för Medicinska Vetenskaper, Cancerfarmakologi och Beräkningsmedicin, Uppsala universitet, med start så snart som möjligt eller enligt överenskommelse.

Neurodegenerativa sjukdomar, såsom Alzheimers sjukdom och olika former av kroniska smärttillstånd orsakar enormt lidande för patienter samt anhöriga och innebär en stor ekonomisk börda för vårt sjukvårdssystem. Trots att sjukdomarna har varit kända och kunnat diagnostiseras i mer än ett århundrade är mycket av detaljerna i de molekylära processerna för dessa neurologiska sjukdomar fortfarande okända. Uppsala Berzelii Teknologi Centrum för Neurodiagnostik bildades 2007 för att sammanföra klinik, akademi och bioteknik- och läkemedelsföretag i ett nära samarbete. Syftet med centrat är att kartlägga de underliggande molekylära processerna bakom Alzheimers sjukdom och kronisk smärta.

Projektbeskrivning: Doktoranden kommer att ingå i Uppsala Berzelii Teknologi Centrum för Neurodiagnostik och kommer att arbeta i en grupp bestående av experter inom analytisk kemi, beräkningsmedicin och klinisk forskning. Huvudtemat för doktorandprojektet kommer att vara utveckling, implementering, utvärdering och användning av existerande och nya bioinformatiska metoder för hantering och analys av data som produceras med hjälp av masspektrometriska instrument samt s.k. proximitetsligering (PLA). Ett särskilt fokus kommer att ligga på nya beräkningsmetoder för univariat och multivariat dataanalys för identifiering av olika subgrupper av patienter samt prediktiv (diagnostisk, prognostisk) modellering. Doktorandprojektet kommer också att innehålla uppgifter för att hantera den snabbt växande produktionen av komplex data genererad av masspektrometriska instrument. Data som insamlas kommer främst omfatta mätningar av peptider, proteiner och metaboliter. De prover som tagits och som ska analyseras kommer från patienter samt olika djurmodeller. Doktoranden förväntas även ta en aktiv roll i provbearbetning och i själva produktionen av masspektrometrisk data. Således är det även en fördel med erfarenhet av arbete med biologiska prover samt masspektrometriska instrument, men inte nödvändigt.

Kvalifikationer: Vi söker en mycket motiverad student med en gedigen bakgrund i matematik, bioinformatik och molekylär bioteknik motsvarande en civilingenjörsexamen i bioinformatik, molekylärbioteknik eller liknande. Du bör ha ett djupt intresse för vetenskaplig forskning med lovande biomedicinska tillämpningar. Du bör ha stor erfarenhet av programmering i R eller Matlab. Du kommer att ingå i en grupp med olika experter, så vi söker en person som kan arbeta självständigt och samtidigt har social och kommunikativ kompetens för att lyckas arbeta i en tvärvetenskaplig miljö. Den sökande förväntas ha goda kunskaper i engelska, både i muntlig och skriftlig framställning.

Doktorandutbildningen omfattar fyra års heltidsstudier. Anställningen kan kombineras med upp till 20% administrativa och pedagogiska arbetsuppgifter vid institutionen (som då kommer att förlänga anställningen med motsvarande tid).

För ytterligare information kontakta personer enligt nedan.

Publiceringsdatum
2013-01-15

Arbetstider och omfattning
Visstidsanställning 6 månader eller längre
Heltid

Ersättning
Fast lön

Så ansöker du
Välkommen med din ansökan senast 2013-01-31. UVF-PA 2012/3437. Klicka på länken nedan för att komma till ansökningsformuläret
Klicka på denna länk för att göra din ansökan
Ansökan kan tyvärr inte göras via e-post.

Kontakt
Kim Kultima tel: +46 (0)18-6114248 Kim.Kultima@medsci.uu.se
Magnus Wetterhall tel: +46(0)18-471 3679 Magnus.Wetterhall@kemi.uu.se
Mats Gustafsson tel: +46(0)18-6114241 Mats.Gustafsson@medsci.uu.se
Anna Foyer, personalsamordnare, tel: 018-611 43 92 anna.foyer@medsci.uu.se

Facklig kontakt
Anders Grundström, Saco-rådet, tel. 018-471 53 80
Carin Söderhäll, TCO/ST, tel. 018-471 19 96
Stefan Djurström, Seko, tel. 018-471 33 15

Företag
Uppsala universitet

Adress
Uppsala universitet
Box 256
75105 UPPSALA

Övriga kontaktuppgifter
Telefonnummer: 018-4710000
Faxnummer: 018-4712000

Jobbnummer
1438802

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Doktorand i Medicinsk Bioinformatik

Prenumerera på jobb från Uppsala universitet