Doktorand i genomik

Uppsala universitet, / Administratörsjobb (offentlig verksamhet) / Uppsala
Observera att sista ansökningsdag har passerat.


Visa alla administratörsjobb (offentlig verksamhet) i Uppsala, Östhammar, Sigtuna, Österåker, Håbo eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Uppsala universitet, i Uppsala, Gotland eller i hela Sverige

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 40.000 studenter, 7.000 anställda och en omsättning på 6,5 miljarder kronor.

Vid institutionen för organismbiologi bedriver vi undervisning och forskning om evolution, utveckling och funktion i hela organismer.

Vi studerar också de djupaste förgreningarna i livets träd  med hjälp av bioinformatik och experimentella molekylära tekniker. Forskning om hur kemikalier av antropogent ursprung interagerar  med cellfunktioner och ger upphov till långvariga hälsoeffekter på människor och djur utförs också. För mer information se www.iob.uu.se .

Projektbeskrivning: Mikrobiella eukaryota parasiter är mycket varierande och utbredda över livets träd, men vår förståelse av dessa viktiga organismer är huvudsakligen baserad på ett relativt litet antal arter (t.ex. inom de patogena grupperna Apicomplexa eller Microsporidia). Andra grupper, som består delvis eller uteslutande av parasiter, har hittills undgått fördjupad undersökning. Ascetosporea (en grupp inom Rhizaria) är en sådan grupp dåligt kända parasiter. Diversiteten och värdspektrat hos Ascetosporean parasiter har nyligen visat sig vara mycket större än väntat, och innefattar patogener av blötdjur, som kostar miljontals dollar för vattenbruksnäringen.

Detta projekt syftar till att sekvensera, assembla och annotera genomen hos Ascetosporea och dess närmaste släktingar. Denna nyligen genererade data kommer sedan att användas för att skapa ett evolutionärt ramverk för Ascetosporea genom att använda en kombination av fylogeniska och genomiska analyser. Baserat på resultatet av denna första del kommer vi i huvudsak att titta på utvecklingen av parasitism i Ascetosporea, dvs identifiera pre-parasit förhållanden, släktskapets utveckling och linjespecifika anpassningar med hjälp av jämförande genomik. Detta projekt kommer att kasta ljus på en stor grupp av parasiter där vi saknar de mest grundläggande kunskaper om deras biologi.

Doktoranden kommer att arbeta under handledning av Dr Fabien Burki ( http://www.iob.uu.se/research/systematic-biology/burki-lab/ ) i forskningsprogrammet Systematisk biologi vid Evolutionsbiologiskt centrum (EBC), Uppsala universitet. EBC utgör en spännande arena för tvärvetenskaplig forskning i evolutionsbiologi i vid bemärkelse, och utgör en arbetsplats för cirka 300 forskare och doktorander. Den vetenskapliga miljön med många seminarier, journal clubs och sociala aktiviteter erbjuder utmärkta möjligheter för kontakter och samarbeten. Lokala plattformar för högpresterande beräkningsanalyser ( https://www.uppmax.uu.se ) och sekvensering ( http://www.scilifelab.se ) säkerställa omedelbar tillgång till state-of-the-art teknologi.

Kvalifikationskrav: En masterexamen i biologi eller motsvarande är ett krav. Du ska ha lång erfarenhet inom bioinformatik, genomanalys, och fylogenetik. Kännedom om den fascinerande världen av mikrobiella eukaryoter kommer att betraktas som en stark merit. Den ideala kandidaten är vetenskapligt motiverad och kan arbeta både självständigt och som en del av ett team. Hög standard av talad och skriven engelska krävs.

Anställning: Forskarutbildningen omfattar fyra års heltidsstudier. Anställningen kan komma att kombineras med undervisning (maximalt 20%) vilket förlänger anställningen med motsvarande tid.

För anställning som doktorand krävs att innehavaren är antagen eller kommer att antas till forskarutbildning, där graden av förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildningen är avgörande. Bestämmelser för doktorander återfinns i Högskoleförordningen 5 kap §§ 1-7 samt i universitetets regler och riktlinjer http://regler.uu.se/ . Lokala riktlinjer finns fastställda för löneinplacering. Mer information om forskarutbildning finns under http://www.teknat.uu.se/utbildning/forskarniva/

Ansökningsförfarande: Ansökan ska innehålla 1) ett brev som beskriver dig själv, dina forskningsintressen och motivering till varför du vill doktorera, 2) en kort beskrivning av din utbildning, 3) en CV, 4) en kopia av din mastersexamen, 5) namn och kontaktuppgifter (adress, e-postadress och telefonnummer) till minst två referenspersoner, 6) relevanta publikationer (inklusive masteruppsats). Ansökan ska skrivas på engelska.

Uppsala universitet värdesätter de kvaliteter som jämn könsfördelning och mångfald tillför verksamheten. Vi ser därför gärna sökande av alla kön och med olika födelsebakgrund, funktionalitet och livserfarenhet.

Lön: Lokala riktlinjer finns fastställda för löneplacering.

Tillträde: 2016-12-01 eller enligt överenskommelse.

Anställningens omfattning: Tidsbegränsad anställning 4 år. Heltid.

Upplysningar om anställningen lämnas av Biträdande universitetslektor Fabien Burki, fabien.burki@ebc.uu.se , +46-(0)18-471-2779.

Välkommen med din ansökan senast 31 oktober 2016. UFV-PA 2016/2548.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Varaktighet, arbetstid
100%. Tillträde: 2016-12-01 eller enligt överenskommelse Visstidsanställning

Publiceringsdatum
2016-10-07

Ersättning
Fast lön

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2016-10-31
Ange följande referens när du ansöker: UFV-PA 2016/2548
Klicka på denna länk för att göra din ansökan

Facklig kontakt
Stefan Djurström, Seko 018-471 3315
Per Sundman, Saco-rådet 018-471 1485
Marie Ols, TCO/ST 018-471 2459

Företag
Uppsala universitet,

Adress
Uppsala universitet,
box 256
75200 Uppsala

Kontorsadress
box 256

Jobbnummer
3093634

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Prenumerera på jobb från Uppsala universitet,

Fyll i din e-postadress för att få e-postnotifiering när det dyker upp fler lediga jobb hos Uppsala universitet,: