Bioinformatiker vid Laboratoriemedicin, Umeå

Region Västerbotten, Laboratoriemedicin VB / Kemiingenjörsjobb / Umeå
Observera att sista ansökningsdag har passerat.


Visa alla kemiingenjörsjobb i Umeå, Vännäs, Nordmaling, Vindeln, Robertsfors eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Region Västerbotten, Laboratoriemedicin VB i Umeå, Örnsköldsvik, Skellefteå, Lycksele, Östersund eller i hela Sverige

Region Västerbotten arbetar för att god hälsa och hållbar utveckling ska stärka varandra. Vi tar ansvar för en jämlik välfärd och för att forskning och innovation ger resultat.

Laboratoriemedicin är en länsorganisation med verksamhet i Lycksele, Skellefteå och Umeå. Via avtal har vi totalansvar för klinisk patologi i Östersund samt där även medicinskt ledningsansvar för immunologi och transfusionsmedicin, klinisk kemi och klinisk mikrobiologi. Laboratoriemedicin Västerbotten omfattar cirka 550 anställda inom klinisk genetik, klinisk immunologi och transfusionsmedicin, klinisk kemi, klinisk mikrobiologi och klinisk patologi. Även biobank, vårdhygien och vävnadsinrättning ingår i Laboratoriemedicin. Verksamheten är ackrediterad.

Storskalig sekvensering tillsammans med andra nya molekylära tekniker gör snabbt insteg i klinisk verksamhet och forskning. De etableras som viktiga verktyg inom flera laboratoriemedicinska specialiteter varför vi vid laboratoriemedicin arbetar övergripande med implementering av dessa tekniker inom en satsning på en gemensam molekylärgenetisk plattform för forskning, utvecklingsarbete samt implementering av klinisk diagnostik. Den molekylärgenetiska plattformen är en del av Genomic Medicine Center norr (GMC Norr) och samverkar med Clinical Genomics Umeå, vid Umeå universitet. Den tekniska utvecklingen går snabbt med både nya tekniker och frågeställningar som ska implementeras i klinisk molekylärgenetisk diagnostik och ställer ökade krav på bioinformatisk metodik och kompetens.

Vi söker dig som vill applicera bioinformatiska färdigheter på kliniskt meningsfulla frågor och vara en aktiv kraft i utvecklingen av den gemensamma molekylärgenetiska plattformen vid laboratoriemedicin. Anställningen är placerad inom Laboratoriemedicin, Norrlands Universitetssjukhus.



Publiceringsdatum
2022-01-27

Arbetsuppgifter
Som bioinformatiker förväntas du arbeta med storskaliga sekvensdata (Next Generation Sequencing, NGS), long read sekvensering och andra molekylärgenetisk tekniker för identifiering av genetisk variation och analys av genexpressions inom forskning, utvecklingsarbete och klinik.

Du kommer att arbeta i ett kliniskt diagnostiskt team bestående av bioinformatiker, biomedicinare, molekylärbiologer, läkare, sjukhusgenetiker och biomedicinska analytiker. Arbetet innebär även ett nära samarbete med forskargrupper, GMC Norr, Clinical Genomics Umeå (Umeå universitet) och institutionen för medicinsk biovetenskap, Umeå universitet. Både i den kliniska- och forskningsmiljön finns god kompetens inom bioinformatik, molekylärbiologi, mikrobiologi, humangenetik och klinisk diagnostik.

Dina huvudsakliga arbetsuppgifter är att skapa och utveckla bioinformatiska flöden, utveckla bioinformatiska verktyg, analysera olika typer av rådata och fungera som en kompetensresurs. Aktuella uppgifter är fortsatt utveckling och implementering av molekylärgenetiska analyser vid cancer och vid utredning av misstänkt medfödd genetisk sjukdom inklusive helexom- och helgenomanalyser.


Kvalifikationer
Gedigna kunskaper i statistik samt dokumenterad erfarenhet av storskalig sekvensanalys är också ett krav. Doktorsexamen i molekylär epidemiologi, medicinsk genetik, bioinformatik, biostatistik eller liknande är meriterande. Goda programmeringskunskaper i Python och vana att använda versionshanteringssystem (som Git) är önskvärt, likaså erfarenhet av att arbeta i Linuxmiljö och systemadministration. Önskvärt är även erfarenhet av arbete med olika typer av sekvensdata (Illumina, Nanopore, PacBio) samt arbete med både humana och mikrobiella sekvensdata samt programmeringskunskaper i R. Önskvärt är även erfarenhet av att utföra analyser på datakluster (t.ex. UPPMAX), erfarenhet av att använda analyshanteringsverktyg såsom Snakemake och Nextflow samt förståelse för och erfarenhet av att hantera säkerhetsaspekter som rör patientdata och genetisk information.

Stor vikt läggs vid personliga egenskaper såsom kommunikativ och pedagogisk förmåga. Vi söker dig som har ett stort driv att arbeta självständigt och samtidigt har god förmåga att bidra i ett team. Vi ser gärna att du bedriver egen forskning. Med anledning av den snabba utvecklingen i fältet vill vi att du som sökande lämnar kontaktuppgifter till en eller gärna flera referenspersoner som kan styrka åberopade meriter.


ÖVRIGT
Naturvetarna, kontakta medlemsrådgivningen via e-post radgivning@naturvetarna.se

Läs mer om våra förmåner för dig som jobbar med oss på webbsidan
https://www.regionvasterbotten.se/nar-du-jobbar-hos-oss/att-vara-medarbetare

Vi strävar efter en jämn könsfördelning och ser mångfald som en styrka och välkomnar därför sökande med olika bakgrund.

Inför rekryteringsarbetet har vi tagit ställning till rekryteringskanaler och marknadsföring. Vi undanbeder oss därför bestämt kontakt med mediesäljare, rekryteringssajter och liknande.

Vi använder e-rekrytering för att effektivisera och kvalitetssäkra rekryteringsarbetet. Alla dina uppgifter sparas på ditt CV-konto och du kan enkelt logga in och uppdatera dina uppgifter när du vill. Fyll därför i dina uppgifter så omsorgsfullt som möjligt för att ge en rättvisande bild av dig själv.

Varaktighet, arbetstid
Heltid. Schema. Tillsvidareanställning, tillträde: Tillträde enligt överenskommelse.

Ersättning
Enligt avtal.

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2022-02-11
Klicka på denna länk för att göra din ansökan

Företag
Region Västerbotten, Laboratoriemedicin VB

Arbetsgivarens referens
Arbetsgivarens referens för detta jobb är "A1088785".

Omfattning
Detta är ett heltidsjobb.

Arbetsgivare
Region Västerbotten (org.nr 232100-0222)

Arbetsplats
Region Västerbotten, Laboratoriemedicin VB

Kontakt
Bioinformatiker
Pär Larsson
par.g.larsson@regionvasterbotten.se
090-785 28 02

Jobbnummer
6286916

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Prenumerera på jobb från Region Västerbotten, Laboratoriemedicin VB

Fyll i din e-postadress för att få e-postnotifiering när det dyker upp fler lediga jobb hos Region Västerbotten, Laboratoriemedicin VB: