Bioinformatiker med fokus på forskningsstöd inom bildanalys

Kungliga Tekniska högskolan, / Biologjobb / Stockholm
Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Prenumerera på nya jobb hos Kungliga Tekniska högskolan,

Visa alla biologjobb i Stockholm, Solna, Lidingö, Sundbyberg, Danderyd eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Kungliga Tekniska högskolan, i Stockholm, Solna, Huddinge eller i hela Sverige

KTH är ett av Europas ledande tekniska universitet och en viktig arena för kunskapsutveckling. Som Sveriges största universitet för teknisk forskning och utbildning samlar vi studenter, forskare och fakultet från hela världen. Vår forskning och utbildning omfattar såväl naturvetenskap som alla grenar inom teknik samt arkitektur, industriell ekonomi, samhällsplanering, teknisk historia och filosofi.



Avdelningsinformation

Positionen kommer formellt att vara placerad vid avdelningen för Computational Science and Technology (CST) at KTH, men det praktiska arbetet kommer att utföras vid Science for Life Laboratory.

CST bedriver datavetenskaplig forskning och modellering inom biologiska och fysiska system. Detta kräver effektiva och avancerade algoritmer samt bildanalyssystem. För mer information över pågående arbeten, se https://www.kth.se/en/csc/forskning/cst. SciLifeLab är ett nationellt center för molekylära biovetenskaper med fokus på forskning inom hälsa och miljö. Centret kombinerar ledande teknisk expertis med avancerat kunnande inom translationell medicin och molekylära biovetenskaper. Vårt mål är också att bygga en stark forskargruppering kring SciLifeLab genom utbildning och samverkan. SciLifeLab är en nationell resurs som drivs av Karolinska Institutet, KTH, Stockholms universitet och Uppsala universitet. Vi samarbetar med flera andra svenska universitet. För mer information, besök https://www.scilifelab.se/.

Publiceringsdatum
2018-01-18

Dina arbetsuppgifter
Vi söker en doktor med ett stort intresse för implementering och anpassning av bildanalysalgoritmer för kvantitativ analys av mikroskopdata för att ansluta sig till SciLifeLab BIIF. Du kommer att arbeta på korta och långsiktiga projekt, tillhandahålla forskningsstöd och utbildning om bildanalys. BIIF har knutpunkter i både Uppsala och Stockholm, men uppdraget omfattar även tjänster till forskare vid andra universitet i Sverige. Arbetet omfattar deltagande och organisation av kurser och workshops i digital bildbehandling och analys med livsvetenskapliga applikationer. Handledning av masterprovstudenter ingår i uppdraget. 20% tid kommer att användas till stöd för projekt på LCI-anläggningen i Huddinge.

Kvalifikationer
En doktorsexamen i databasanalys / bildbehandling, eller doktorsexamen i biomedicin / biologi (eller motsvarande), kombinerat med dokumenterad erfarenhet av datorprogrammering och utveckling av digitala bildanalyslösningar krävs.
Dessutom anses följande kvalifikationer vara mycket önskvärda:

- Erfarenhet av algoritmutveckling och utveckling av analyspipeliner som syftar till att kvantifiera och klassificera biologiska parametrar extraherade från mikroskopiedata eller t.ex. celler och mikroorganismer i kulturer och vävnadsprover
- Erfarenhet av medicinsk bildanalys
- Erfarenhet av analysprogramvara som Imaris, ImageJ / Fiji, CellProfiler, NIS och Amira
- Erfarenhet av undervisning och studentövervakning - Kunskap med ett vetenskapligt programmeringsspråk (Python, R, eller Matlab)
- Utmärkt engelsk kommunikationsförmåga, både talat och skrivet, liksom utmärkta interpersonella färdigheter

Andra meriterande erfarenheter och färdigheter

- Postdoktoral erfarenhet inom bildanalys, inom eller utanför akademin, speciellt inriktad på metodutveckling
- Kännedom om djupa inlärningsramar som Keras, TensFlow eller PyTorch

Fackliga representanter

Du hittar kontaktuppgifter till fackliga representanter på KTH:s webbsida.

Så ansöker du
Du ansöker via KTH:s rekryteringssystem. Du som sökande har huvudansvaret för att din ansökan är komplett när den skickas in. Din kompletta ansökan ska vara KTH tillhanda senast sista dagen för ansökningsperioden.

Ansökan ska innehålla följande handlingar:
1. Uppgift om intresse, inklusive en kort beskrivning av erfarenheterna av bioimage analysis
2. Curriculum vitae
3. Referenskontaktinformation
4. Representativa publikationer (eller annat exempel på vetenskapligt skrivande) Observera att allt material skall vara på engelska förutom officiella dokument.

Övrig information
Vi undanber oss direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av platsannonser.

Varaktighet, arbetstid
100%. Tillträde: Enligt överenskommelse Visstidsanställning

Ersättning
Månadslön

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2018-02-28
Ange följande referens när du ansöker: D-2017-0987
Klicka på denna länk för att göra din ansökan

Kontakt
Kevin Smith / Assistant Professor ksmith@kth.se
Maria Engman / HR-administratör maengm@kth.se

Företag
Kungliga Tekniska högskolan,

Adress
Kungliga Tekniska högskolan,
Lindstedtsvägen 3-5/Osquars Backe 2
10044 Stockholm

Kontorsadress
Lindstedtsvägen 3-5/Osquars Backe 2

Jobbnummer
3910450

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Prenumerera på jobb från Kungliga Tekniska högskolan,

Fyll i din e-postadress för att få e-postnotifiering när det dyker upp fler lediga jobb hos Kungliga Tekniska högskolan,: