Bioinformatiker i genomannotering

Uppsala universitet, Institutionen för medicinsk biokemi och mik / Biologjobb / Uppsala
Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Prenumerera på nya jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för medicinsk biokemi och mik

Visa alla biologjobb i Uppsala, Östhammar, Sigtuna, Österåker, Håbo eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för medicinsk biokemi och mik i Uppsala

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 45 000 studenter, 6 800 anställda och en omsättning på 6,3 miljarder kronor.

Tillsvidareanställning med tillträde snarast.

6 månader provanställning.

Bioinformatics Infrastructure for Life Sciences (BILS; http://bils.se ) främjar svensk livsvetenskaplig forskning genom att tillhandahålla bioinformatisk expertis till forskare. Över 45 experter finns anställda vid de större universiteten i Sverige där de bidrar med spetskompetens inom ett flertal områden som genomik, transkriptomik, proteomik, metabolomik och statistik. BILS samarbetar med SciLifeLab ( http://www.scilifelab.se ), en nationell resurs som tillhandahåller avancerade storskaliga tekniker och kunnande inom biovetenskaperna. Nyligen gjorda investeringar har gjort SciLifeLab till det tredje största sekvenscentrumet i Europa. Den stora mängden tillgängliga resurser gör att Sverige är en av de bästa platserna i världen för livsvetenskapsforskning, och tillsammans med skickliga svenska forskare har detta gjort att Sverige ligger i framkant av områden som komparativ genomik och genomevolution.

BILS söker nu en ny medarbetare till assembly- och annoterings-gruppen för att framförallt arbeta med annotering av eukaryota genom. Gruppen finns vid Uppsala Universitet i Navet, SciLifeLabs Uppsala-nod. I denna kreativa miljö finns över 20 bioinformatiker, flera core-faciliteter och många olika forskargrupper representerade. I nära samarbete med svenska forskargrupper fokuserar gruppen på att leverera genom och annoteringar till en hög internationell standard.

Arbetsbeskrivning: Vi söker en expert med en gedigen bakgrund inom NGS (next generation sequencing)-bioinformatik och ett intresse för annotering. Arbetet innebär att hjälpa svenska annoterings-projekt med allt från handledning till att fullständigt ansvara för och utföra en genom-annotering. Projekten kommer att variera i omfattning från korta jobb på några dagar till längre projekt på flera månader, och man kan förvänta sig data från många olika typer av organismer, men främst eukaryoter. Erfarenhet av skriptning och automatisering av processer i en Linuxmiljö är av stor vikt för positionen eftersom arbetet också kommer att innebära utveckling och förbättring av existerande pipelines och metoder.

Kvalifikationskrav: Doktorsexamen inom bioinformatik, molekylärbiologi, datavetenskap eller liknande utbildning och god erfarenhet av genom-annotering eller besläktat område som transkriptomik. Erfarenhet av stora eukaryota genom-projekt värderas högt. Gedigen kunskap i skriptspråk (t.ex. Perl, Python eller Ruby) är en nödvändighet och erfarenhet av Ensembl-API eller Ensembl-Hive anses extra positivt. Vidare krävs god förmåga att arbeta i en serviceinriktad miljö, både i samarbete och självständigt. Utmärkt talad och skriven engelska krävs. Utmärkt kommunikationsförmåga är nödvändigt, eftersom innehavaren av denna tjänst kommer att samarbeta med forskare med mycket olika bakgrund. Stor vikt kommer läggas vid personlig lämplighet.

För allmänna frågor om BILS, kontakta Prof. Bengt Persson på bengt.persson@bils.se . För mer specifika frågor om arbetsuppgifter, kontakta Dr. Henrik Lantz på henrik.lantz@imbim.uu.se . 

Välkommen med din ansökan senast den 1 juni 2015, UFV-PA 2015/1037. Klicka på länken nedan för att komma till ansökningsformuläret

Bioinformatiker i genomannotering

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Vi tar enbart emot ansökan på det sätt som beskrivs i annonsen.

Varaktighet, arbetstid
100 % tillsvidareanställning

Publiceringsdatum
2015-05-06

Ersättning
Fast lön

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2015-06-01
Ange följande referens när du ansöker: UFV-PA 2015/1037
Klicka på denna länk för att göra din ansökan

Facklig kontakt
Carin Söderhäll, TCO/ST 018-471 1997
Per Sundman, Saco-rådet 018-471 1485
Stefan Djurström, Seko 018-471 3315

Företag
Uppsala universitet, Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi

Adress
Uppsala universitet, Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi
Box 256,
75105 Uppsala

Kontorsadress
Box 256,

Jobbnummer
2282131

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Prenumerera på jobb från Uppsala universitet, Institutionen för medicinsk biokemi och mik

Fyll i din e-postadress för att få e-postnotifiering när det dyker upp fler lediga jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för medicinsk biokemi och mik: