Bioinformatiker i genomannotering

Uppsala universitet / Biologjobb / Uppsala
Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Visa alla biologjobb i Uppsala, Östhammar, Sigtuna, Österåker, Håbo eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Uppsala universitet i Uppsala, Upplands Väsby, Gävle, Gotland eller i hela Sverige

Bioinformatiker i genomannotering vid institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi.

Arbetsuppgifter: Innehavaren av denna tjänst kommer att arbeta med bioinformatik inom BILS (Bioinformatics Infrastructure for Life Sciences), en nationell infrastruktur med syfte att stödja svenska forskare med bioinformatik. BILS startar en annoteringsgrupp på BioMedicinskt Centrum i Uppsala och söker efter en ny medarbetare till denna grupp. Fokus för tjänsten är att hjälpa svenska forskargrupper med annotering av framförallt eukaryota genom och transkriptom.

Det huvudsakliga verktyget som kommer att användas är utvecklat av EnsEMBL. Tjänsten kommer att innebära installation och underhåll av denna komplexa programvara och även kvalitetskontroll och kurering av annoteringar. Stora datamängder från Next Generation Sequencing kommer att behöva hanteras och integreras med övriga resultat. Tjänsten innebär också direkta kontakter med forskargrupper i behov av annotering eller hjälp med att starta upp genomprojekt och viss undervisning kring dessa områden kommer också att ingå.

Kvalifikationskrav: Doktorsexamen inom bioinformatik, molekylärbiologi, datavetenskap eller liknande utbildning och god färdighet i Perl. Kandidaten ska ha erfarenhet av genom- eller transkriptom-data och har idealiskt arbetat med genom-annotering. Erfarenhet av EnsEMBLs verktyg för annotering är ett stort plus. Den sökande bör vara väl förtrogen med vanliga bioinformatiska verktyg och ha erfarenhet av att arbeta i Linux-miljö. Övriga erfarenheter såsom administration av databaser (mySQL) och administration av Linux-servar är positivt. Utmärkt kommunikationsförmåga är nödvändigt, eftersom innehavaren av denna tjänst kommer att samarbeta med forskare med mycket olika bakgrund. Utmärkt talad och skriven engelska krävs. Stor vikt kommer läggas vid personlig lämplighet.

För allmänna frågor om BILS, kontakta Prof. Bengt Persson på bengt.persson@bils.se . För mer specifika frågor om arbetsuppgifter, kontakta Dr. Marc Höppner på marc.hoeppner@imbim.uu.se .

Publiceringsdatum
2013-07-16

Arbetstider och omfattning
Tillsvidare
Heltid
6 månader provanställning.

Tillträde
Snarast

Ersättning
Fast lön

Så ansöker du
Välkommen med din ansökan senast den 12 augusti 2013. UFV-PA 2013/1955. Klicka på länken nedan för att komma till ansökningsformuläret.
Klicka på denna länk för att göra din ansökan
Ange följande referens när du ansöker: UFV-PA 2013/1955
Ansökan kan tyvärr inte göras via e-post.

Facklig kontakt
Anders Grundström, SACO-rådet, tel. 018-4715380
Carin Söderhäll, TCO/ST, tel. 018-4711996
Stefan Djurström, SEKO, tel. 018-4713315

Företag
Uppsala universitet

Adress
Uppsala universitet
Box 256
75105 UPPSALA

Övriga kontaktuppgifter
Telefonnummer: 018-4710000
Faxnummer: 018-4712000

Jobbnummer
1607574

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Bioinformatiker i genomannotering

Prenumerera på jobb från Uppsala universitet