Bioinformatiker
Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och p / Kemiingenjörsjobb / Uppsala
2021-01-07
Observera att sista ansökningsdag har passerat.
➡️ Klicka här för den senare publicerade platsannonsen "Bioinformatiker" (publicerad 2022-01-21) ⬅️
Visa alla kemiingenjörsjobb i Uppsala,
Östhammar,
Sigtuna,
Österåker,
Håbo eller i
hela Sverige Visa alla jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och p i Uppsala,
Solna eller i
hela Sverige Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 46.000 studenter, 7.300 anställda och en omsättning på 7,3 miljarder kronor.
Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet (www.
igp.uu.se) har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl.a cancer, autoimmuna och genetiska sjukdomar. En av grundtankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom medicinsk och klinisk genetik, klinisk immunologi, patologi, neuroonkologi, vaskulärbiologi, strålningsvetenskap samt molekylära verktyg. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar och masterprogram inom den medicinska fakulteten samt ett antal utbildningar inom teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet. Institutionen omsätter omkring 420 miljoner kronor, varav drygt hälften är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 345, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 700 verksamma i arbetsstyrkan.
Arbetsuppgifter: Som bioinformatiker i gruppen ansvarar du för den informatiska delen av flera projekt. Det innebär att du tillsammans med andra gruppmedlemmar ska planera projektarbetet, utföra dataanalysen med hjälp av olika verktyg. Möjligheter kommer att finnas för att utveckla egna analysmetoder eller testa nya metoder som genereras av andra på olika dataset. Ett av ansvarsområden kommer att vara analyser av data som genereras via Illumina/ Affymetrix/ Agilent-plattformar, i kombination med analyser av genetisk variation i translationella cancer-inriktade forskningsprojekt. Det andra ansvaret kommer att omfatta analyser av storskaliga parallella DNA-sekvenseringsdataset (exom och genom) inom ramen för olika projekt. Det tredje ansvarsområdet kommer att omfatta analyser av genuttryck (från array- och sekvensdata) samt analyser av CpG-metylom. Den framgångsrika kandidaten ska också ha en förmåga att introducera andra anställda/ studenter till bioinformatik och kommunicera väl med övriga medlemmar i gruppen. Därför är goda sociala färdigheter högt värderade. Praktisk expertis inom nästa generation sekvensering (NGS), kvalitetskontroll av olika dataset, analyser av SNP-mutationer och gen-kopie-antal är också viktigt. Tidigare erfarenheter med Remote Shell Scripting (till Uppmax) och användning av Circos-Plots för visualisering av genetisk variation är ytterligare fördelar.
Av kravspecifikationen skall framgå: vilken utbildning, erfarenhet och personliga egenskaper som är nödvändiga för anställningen.
Kvalifikationskrav: Väl dokumenterad bakgrund som biolog och bioinformatiker samt en välprövad praktiskt erfarenhet (t.ex. genom publikationer inom bioinformatik). Dokumenterad erfarenhet av array-baserade plattformar (Illumina SNP och CpGmethylome arrays), särskilt inriktade på studier av strukturell variation i humant genom, värderas högt. Tidigare erfarenhet av Nexus-platformen är idealiskt. Erfarenhet med Linux/ Unix-miljö, programmeringsförmåga (t.ex. i JAVA, R, Perl, C ++, Shell scripting) samt kompetens att självständigt utveckla nya webbaserade plattformar för stor datasamling och analys (SQL-databaser och phpMyAdmin) är essentiell. Vidare är kunskap om webbapplikationsarkitektur (JSP, HTML, CSS, JavaScript, XML) ett plus.
Önskvärt/meriterande i övrigt: Doktorsexamen i bioinformatik.
Lön: Individuell lönesättning.
Tillträde: 2021-02-01 eller enligt överenskommelse.
Anställningsform: Tidsbegränsad anställning på 12 månader med möjlighet till förlängning.
Anställningens omfattning: 100 %.
Upplysningar om anställningen lämnas av: Jan Dumanski, +46704250616,
jan.dumanski@igp.uu.se.
Välkommen med din ansökan senast den 21 januari 2021, UFV-PA 2020/4923.
Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.
Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.
Varaktighet, arbetstid
100%. Tillträde: 2021-02-01 eller enligt överenskommelse Visstidsanställning
Publiceringsdatum2021-01-07ErsättningIndividuell lönesättning
Så ansöker duSista dag att ansöka är 2021-01-21
Klicka på denna länk för att göra din ansökanFöretagUppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och p
Arbetsgivarens referens Arbetsgivarens referens för detta jobb är "UFV-PA 2020/4923".
Omfattning Detta är ett heltidsjobb.
Arbetsgivare Uppsala Universitet (org.nr 202100-2932)
Arbetsplats Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och patologi
Jobbnummer 5512742
Observera att sista ansökningsdag har passerat.