Doktorand i Genomik hos arbuskulär mykorrhiza svampar

Uppsala universitet, Institutionen för ekologi och genetik / Administratörsjobb (offentlig verksamhet) / Uppsala
Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Prenumerera på nya jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för ekologi och genetik

Visa alla administratörsjobb (offentlig verksamhet) i Uppsala, Östhammar, Sigtuna, Österåker, Håbo eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för ekologi och genetik i Uppsala, Norrtälje, Gotland eller i hela Sverige

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 44.000 studenter, 7.100 anställda och en omsättning på 7 miljarder kronor.



Institutionen för ekologi och genetik utlyser en doktorandtjänst i Genomik hos arbuskulär mykorrhiza svampar till programmet för Evolutionsbiologi.

Institutionen för ekologi och genetik är en internationell miljö med drygt 200 medarbetare. Vid institutionen bedrivs forskning och undervisning i skärningspunkten mellan ekologi, evolution och genomik. Se vidare http://www.ieg.uu.se.

Projektbeskrivning: Majoriteten av alla landlevande växter bildar mutualistisk symbios med svampar i fylumet Glomeromycota. Symbiosen går under namnet arbusculär mykorrhiza (AM) och dessa obligata symbionter lever sitt liv som mycel under marken där de koloniserar rötter från flera olika växter, för över näring till växterna i utbyte mot energi och förökar sig med asexuella sporer. Mycelet saknar till stor del väggar mellan cellerna och svampen har en stor mängd kärnor som tycks röra sig fritt inom organismen. En enda spor kan innehålla 200 - 20 000 kärnor beroende på vilken art man studerar. Baserat på DNA-sekvensering från markprover uppskattar vi att det finns ett tusental arter av AM svampar men endast en bråkdel av dessa går att odla i experimentella system. På grund av deras komplicerade biologi finns endast ett fåtal genom publicerade. I vår grupp har vi utvecklat en ny genomsekvenseringsmetod där vi använder en-cells genomik för att kringgå dessa svårigheter och kan idag generera genom data från en enda spor. Detta öppnar upp för helt nya möjligheter att studera funktion och mångfald hos AM-svampar som haft en central roll på jorden sedan växterna började kolonisera land.

I projektet kommer du att generera genomsekvensdata från hittills okända arter av AM-svampar och bidra till en breddad kunskap om fyla Glomeromycota. Vi kommer tillsammans utveckla provtagnings och analysmetoder för att studera vad som karakteriserar arter som inte tidigare har gått att odla. Vi förväntar oss till exempel högre genetisk inom-organism variation hos "vilda" jämfört med "tama" AM svampar. Enstaka arter har odlats i experimentella system över många generationer och för dessa kan vi med jämförande genomik studera vad som händer med genomet när AM-svampar blir domesticerade. I projektet kommer vi att samarbeta med SciLife Lab för att fortsätt utveckla moderna sekvenserings och visualiserings metoder för att karakterisera miljöns mångfald av organismer med komplicerade livs cykler.

Kvalifikationskrav: Masterexamen, eller en utländsk examen som bedöms motsvara masterexamen, inom biologi med inriktning mot ekologi eller genetik. För tjänsten krävs dokumenterat intresse för symbiotiska organismens ekologi och biologi, samt erfarenhet av bioinformatiska analyser. Kandidaten ska ha mycket bra förmåga att uttrycka sig på engelska, i såväl tal som i skrift.

Meriterande: Praktisk erfarenhet av genomsekvensdata är starkt meriterande.

Tillträde: 2019-10-01 eller enligt överenskommelse.

Lön: Enligt kollektivavtal för doktorander.

Anställningen: Tidsbegränsad anställning enligt HF 5 kap § 7. Forskarutbildningen omfattar fyra års heltidsstudier. Anställningen kan komma att kombineras med undervisning eller annan institutionstjänstgöring (maximalt 20 %), vilket förlänger anställningen med motsvarande tid. Lokala riktlinjer finns fastställda för löneinplacering. Bestämmelser för doktorander återfinns i Högskoleförordningen 5 kap §§ 1-7 samt i universitetets regler och riktlinjer http://regler.uu.se/. Mer information om forskarutbildning finns under http://www.teknat.uu.se/utbildning/forskarniva/

Instruktioner för ansökan: Ansökan ska innehålla 1) ett brev (max 2 A4) som beskriver dig själv, dina forskningsintressen, varför du vill doktorera och varför just du är lämplig för tjänsten, 2) ditt CV, 3) en kort beskrivning av din utbildning (max 1 A4), 4) en kopia av din masterexamen och dina kursbetyg samt en kopia av din masteruppsats 5) namn och kontaktuppgifter till minst två referenspersoner (e-postadress och telefonnummer), och 6) eventuella publikationer. Ansökan bör skrivas på engelska.

Uppsala universitet värdesätter de kvaliteter som jämn könsfördelning och mångfald tillför verksamheten. Vi ser därför gärna sökande av alla kön och med olika födelsebakgrund, funktionalitet och livserfarenhet.

Upplysningar om anställningen lämnas av: Universitetslektor, Anna Rosling, anna.rosling@ebc.uu.se, +46 18 471 64 44.

Välkommen med din ansökan senast 2019-09-17. UFV-PA 2019/2922.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Varaktighet, arbetstid
100 %. Tillträde: 2019-10-01 Visstidsanställning

Publiceringsdatum
2019-08-29

Ersättning
Fast lön

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2019-09-17
Ange följande referens när du ansöker: UFV-PA 2019/2922
Klicka på denna länk för att göra din ansökan

Företag
Uppsala universitet, Institutionen för ekologi och genetik

Adress
Uppsala universitet, Institutionen för ekologi och genetik
box 256
75200 Uppsala

Kontorsadress
box 256

Jobbnummer
4851448

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Prenumerera på jobb från Uppsala universitet, Institutionen för ekologi och genetik

Fyll i din e-postadress för att få e-postnotifiering när det dyker upp fler lediga jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för ekologi och genetik: