Forskningsingenjör i bioinformatik

Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet / Biologjobb / Umeå
Observera att sista ansökningsdag har passerat.


Visa alla biologjobb i Umeå, Vännäs, Nordmaling, Vindeln, Robertsfors eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet i Umeå, Nordmaling, Örnsköldsvik, Kiruna, Huddinge eller i hela Sverige

Umeå University is dedicated to providing creative environments for learning and work. We offer a wide variety of courses and programmes, world leading research, and excellent innovation and collaboration opportunities. More than 4 300 employees and 31 500 students have already chosen Umeå University. We welcome your application!

Institutionen för fysiologisk botanik, som är del av Umeå Plant Science Centre (www.

upsc.se), söker en forskningsingenjör i bioinformatik. Den huvudsakliga arbetsuppgiften kommer vara att ge stöd till användare av de bioinformatiska resurserna på UPSC. Anställningen är på heltid i ett år, med möjlighet till förlängning. Tillträde snarast. Sista ansökningsdag är 2016-04-18.

Publiceringsdatum
2016-03-22

Beskrivning
Umeå Plant Science Centre's bioinformatikplattform (UPSCb) önskar anställa en bioinformatiker för att förstärka arbetsgruppen. UPSC's bioinformatikgrupp hade en viktig roll när gran-genomet sekvenserades då som det största genomet alla kategorier som kartlagts. Detta, och andra sekvenseringsprojekt som kräver omfattande bioinformatik, har gjort att vi nu etablerat en Bioinformatik-plattform som har en ledande roll i flera stora projekt. UPSCb har utvecklat och tillhandahåller flera forskningsresurser t.ex. web-baserade applikationer såsom Plant Genome Integrative Explorer (PlantGenIE). Vi söker nu en bioinformatiker för att hjälpa oss att fortsätta utveckla dessa resurser, samt att ge support till forskarna som använder dem.

Dina arbetsuppgifter
Arbetsuppgifterna omfattar analys av High Throughput Sequencing (i huvudsak RNA-seq) data, - d.v.s. användning av vår pipeline för dataförbehandling, kvalitetskontroll, resultatframställning och presentation. I vissa fall blir du mer delaktig i vissa forskningsprojekt, till exempel genom att vid analysen samarbeta med forskare med mindre bioinformatikkompetens (att hjälpa biologer med att t.ex. söka sekvenshomologer, utföra fylogenetiska analyser osv.). I arbetet ingår även  att upprätthålla IT-infrastrukturen, exempelvis genom installation av ny programvara, användarhantering och administrering av ett kösystem på våra servrar.

Kvalifikationer
Du har en masterexamen inom beräkningsbiologi, bioinformatik eller motsvarande. Du måste vara väl bekant med Unix/Linux och minst ett programmeringsspråk såsom Python, R, C eller C++. Det är viktigt att du är en lagspelare som tycker om att interagera med biologer (d.v.s. UPSCb's huvudsakliga användargrupp). Det krävs att du har mycket goda kunskaper i engelska. Erfarenhet av databashantering, systemadministration, NGS teknik och statistik är meriterande.

Så ansöker du
Ansökan skall innehålla (1) CV och kopior på relevanta examen (2) ett personligt brev med redogörelse av ditt forskningsintresse (3) Kontaktinformation till två referenspersoner.

Institutionen för fysiologisk botanik är en del av Umeå Plant Science Centre med cirka 200 medarbetare som består av bland annat av 40 gruppledare och representerar för närvarande 48 olika nationaliteter (för mer information, se http://www.upsc.se eller http://www.plantphys.umu.se/english/ ). Vår huvudsakliga verksamhet är akademisk forskning och utbildning som innefattar områden som ekologi, biokemi, plantfysiologi samt genomik. Om du vill har mer information om anställningen, kontakta nicolas.delhomme@umu.se eller Stefan.jansson@umu.se .

Umeå University wants to offer an environment where open dialogue between people with different backgrounds and perspectives lay the foundation for learning, creativity and development.
In each recruitment we aim to increase diversity and the opportunity to affirmative action.

We kindly decline offers of recruitment and advertising help.

Varaktighet, arbetstid
100 %. Tillträde: Snarast Visstidsanställning

Ersättning
Fast månadslön

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2016-04-18
Ange följande referens när du ansöker: AN 2.2.1-392-16
Klicka på denna länk för att göra din ansökan

Kontakt
Stefan Jansson, prefekt 090-786 5354

Facklig kontakt
SACO 090-786 53 65
SEKO 090-786 52 96
ST 090-786 54 31

Företag
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet

Adress
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet
Umeå universitet
90187 Umeå

Kontorsadress
Umeå universitet

Jobbnummer
2739777

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Prenumerera på jobb från Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet

Fyll i din e-postadress för att få e-postnotifiering när det dyker upp fler lediga jobb hos Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet: