Forskare i proteinstrukturutveckling
Stockholms Universitet / Kemistjobb / Stockholm
Observera att sista ansökningsdag har passerat.
Visa alla kemistjobb i Stockholm,
Solna,
Lidingö,
Sundbyberg,
Danderyd eller i
hela Sverige Visa alla jobb hos Stockholms Universitet i Stockholm,
Solna,
Sundbyberg,
Sollentuna,
Täby eller i
hela Sverige vid Institutionen för biokemi och biofysik. Sista dag att ansöka är 2023-11-26.
SciLifeLab är ett nationellt center för molekylära biovetenskaper med fokus på forskning inom hälsa och miljö. Centret kombinerar ledande teknisk expertis med avancerat kunnande inom translationell medicin och molekylära biovetenskaper. SciLifelab är en nationell resurs som drivs av Karolinska Institutet, KTH, Stockholms universitet och Uppsala universitet. Centret samarbetar med flera andra lärosäten.
Administrativt kommer anställningen att placeras vid Institutionen för biokemi och biofysik, Stockholms universitet.
Projektbeskrivning
Proteinstruktur är avgörande för att förstå deras funktion och utveckla läkemedel som riktar sig mot proteiner. Nyligen gjordes en djupinlärningsmetod som kan förutsäga strukturen hos de flesta proteiner fritt tillgänglig, och en databas med förutspådd struktur släpptes. Proteiner agerar dock inte ensamma - de arbetar tillsammans med andra proteiner. Därför är nästa stora utmaning att använda dessa metoder för att förutsäga protein-protein-interaktioner. Våra initiala studier har visat att det är möjligt att förutsäga korrekta strukturer av en stor del av dimera proteiner med antingen en modifierad version av AlphaFold2 eller AlphaFold-multimer. Men många proteiner kan inte byggas exakt, inte heller kan vi alltid skilja interagerande från icke-interagerande proteinpar, och att bygga större komplex exakt är fortfarande ett olöst problem. I det här projektet rekryterar vi två postdocs för att dra nytta av de senaste framstegen inom maskininlärning för att bygga bättre djupinlärningsmodeller för att förutsäga protein-proteininteraktioner och för att tillämpa dessa metoder på biologiskt relevanta problem.
Elofssongruppen finns på Science for Life-laboratoriet. Elofsson har arbetat med förutsägelser om proteinstruktur i mer än två decennier. Han har arbetat med olika tekniker med hjälp av maskininlärning och andra beräkningstekniker. Hans viktigaste bidrag till detta arbete är de metoder han har utvecklat för att identifiera kvaliteten på proteinmodeller, Pcons och olika versioner av ProQ. Gruppen omfattar 5 Ph.D. studenter, 2 PostDocs och en senior forskare.
Publiceringsdatum2023-11-20Dina arbetsuppgifterProjektet består av tre delar (1) Identifiering av alla mänskliga proteoformer, (2) identifiering av alla protein-protein-interaktioner, och (3) modellering av alla proteinkomplex. En kritisk del av denna anställning är att samordna arbetet inom dessa delprojekt.
Behörighetskrav
En forskare anställs i huvudsak för forskning och ska ha avlagt doktorsexamen eller har en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen.
Bedömningsgrunder
Vid tillsättningen kommer särskild vikt att fästas vid vetenskaplig skicklighet. Sökande med en Ph.D. inom bioinformatik är behöriga. Lämpliga bakgrunder är en Ph.D. inom datavetenskap, bioinformatik eller ett närliggande område. Goda programmerings- och ledningsförmåga, kunskap om proteiner och djupinlärning är fördelar.
Anställningsvillkor
Anställningen avser heltid och är tidsbegränsad till längst 11 månader. Tillträde 2024-01-01 eller enligt överenskommelse.
Stockholms universitet strävar efter att vara en arbetsplats som är fri från diskriminering och ger lika möjligheter för alla.
Kontaktuppgifter för detta jobbUpplysningar om anställningen lämnas av Professor Arne Elofsson, tfn 076-95 10 45,
arne.elofsson@dbb.su.se.
Fackliga företrädare
Ingrid Lander (Saco-S), tfn 0708-16 26 64,
saco@saco.su.se, Alejandra Pizarro Carrasco (Fackförbundet ST/OFR), tfn 08-16 34 89,
alejandra@st.su.se, samt
seko@seko.su.se (SEKO).
Så ansöker duDu söker anställningen via Stockholms universitets rekryteringssystem. Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.
När du ansöker ber vi dig att fylla i följande uppgifter
• dina kontakt- och personuppgifter
• din högsta examen
• dina språkkunskaper
• kontaktinformation för 2-3 referenspersoner
och att bifoga följande dokument
• personligt brev
• CV - examina och övriga utbildningar, arbetslivserfarenhet och publikationsförteckning
• projektplan/forskningsplan (bör ej överstiga 3 sidor) som beskriver:
• varför du är intresserad av det i annonsen beskrivna ämnet/projektet
• varför och hur du vill bedriva projektet
• vad som gör dig lämplig för det aktuella projektet
• kopia av bevis på doktorsexamen
• eventuella rekommendationsbrev (max 3 filer)
• egna publikationer som du önskar åberopa (max 3 filer).
Anvisningar för sökande finns på webbsidan: att söka en anställning.
Välkommen med din ansökan!
Stockholms universitet bidrar till det hållbara demokratiska samhällets utveckling genom kunskap, upplysning och sanningssökande.
Ersättning Individuell lönesättning
Så ansöker du Sista dag att ansöka är 2023-11-29
Klicka på denna länk för att göra din ansökan Omfattning Detta är ett heltidsjobb.
Arbetsgivare Stockholms Universitet (org.nr 202100-3062),
http://www.su.se Arbetsplats Stockholms universitet
Jobbnummer 8273580
Observera att sista ansökningsdag har passerat.