Bioinformatiker

Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och p / Biologjobb / Uppsala
2016-01-25
Observera att sista ansökningsdag har passerat.
➡️ Klicka här för den senare publicerade platsannonsen "Bioinformatiker" (publicerad 2022-01-21) ⬅️

Visa alla biologjobb i Uppsala, Östhammar, Sigtuna, Österåker, Håbo eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och p i Uppsala, Solna eller i hela Sverige

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 45 000 studenter, 6 800 anställda och en omsättning på 6,3 miljarder kronor.

Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet ( http://www .

igp.uu.se) har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl.a cancer, diabetes och molekylär diagnostik. En av grundtankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom medicinsk och klinisk genetik, klinisk immunologi, bioinformatik, patologi, tumörbiologi, vaskulärbiologi samt strålningsvetenskap. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar inom den medicinska fakulteten samt ett antal utbildningar inom teknisk-naturvetenskaplig fakultet. Institutionen omsätter omkring 300 mkr varav drygt hälften är externa forskningsbidrag och har ca 340 anställda, varav ca 116 är doktorander, och totalt över 600 verksamma i sin arbetsstyrka.

Forskningsprojekten är inriktade på storskalig analys av genetikens/epigenetikens betydelse för uppkomst av både akuta och kroniska leukemier, med det övergripande målet att karakterisera undergrupper av leukemier för att kartlägga viktiga genetiska händelser som bidrar till sjukdomsutvecklingen samt har betydelse för prognosen hos den enskilde patienten. Arbetet omfattar framförallt bioinformatisk bearbetning av data genererade från storskalig sekvensering, såsom helgenom-, helexom-, transkriptom-, och epigenom-sekvensering , men även analys av riktade genpaneler. Projektet är av translationell natur där vi har möjlighet att koppla molekylära data med kliniska data.

Arbetsuppgifter: Vi vill anställa en bioinformatiker på heltid för att sätta upp, analysera och driva utvecklingen av beräkningsmässiga metoder för storskalig sekvensering. Detta omfattar bl.a. implementering av analyspipelines baserade både på existerande och nyutvecklad mjukvara, beräkningsverktyg eller verktyg för kontroll av data- och analysflöden. Arbetet sker tillsammans med molekylärbiologier, läkare och bioinformatiker inom forskningsprogrammet hematologi samt även i nationella och internationella samarbeten.

Kvalifikationskrav: Personen vi söker ska ha masterexamen i ett område lämpligt för tjänsten, såsom t.ex bioinformatik, bioteknik, fysik eller liknande.
Dessutom krävs;

• Dokumenterad erfarenhet i analys av data från next-generation sekvensering.
• Dokumenterad erfarenhet i bioinformatik, framförallt för genom- och transkriptomdata, genomannotering, och god kunskap om bioinformatiska databaser och analysverktyg.
• Dokumenterad programmeringskunskap i antingen Java, C/C++, Python eller Perl, samt erfarenhet av vetenskapliga beräkningar i Linux-baserade högpresterande system.
• Dokumenterad kunskap i statistik och programmering med R.
• God förmåga att uttrycka sig såväl muntligt som skriftligt på engelska.
• God samarbets- och kommunikationsförmåga, samt förmåga att dokumentera arbetets gång.
• Publikation och presentation av forskningsresultat.

Meriterande: Kunskap eller intresse för genetik, medicin eller biologi i allmänhet är meriterande. Sökande behöver god arbetsdisciplin och noggrannhet, och en förståelse för datasäkerhetsaspekter rörande patientdata och genetisk information. Stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet.

Lön: Individuell lönesättning tillämpas. Ange löneanspråk i ansökan.

Tillträde: Snarast eller efter överenskommelse.

Anställningsform: Tidsbegränsad anställning två år.

Anställningens omfattning: 100 %

Upplysningar om anställningen lämnas av:
Richard Rosenquist Brandell, (018-471 4831, richard.rosenquist@igp.uu.se )
Linda Holmfeldt (018-471 5037, linda.holmfeldt@igp.uu.se ).

Välkommen med din ansökan senast 29 februari 2016, UFV-PA 2015/3747

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Vi tar enbart emot ansökan på det sätt som beskrivs i annonsen.

Varaktighet, arbetstid
100%. Tillträde: Snarast Visstidsanställning

Publiceringsdatum
2016-01-25

Ersättning
Fast lön

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2016-02-29
Ange följande referens när du ansöker: UFV-PA 2015/3747
Klicka på denna länk för att göra din ansökan

Facklig kontakt
Carin Söderhäll, TCO/ST 018-471 1997
Per Sundman, Saco-rådet 018-471 1485
Stefan Djurström, Seko 018-471 3315

Företag
Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och patologi

Adress
Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och patologi
box 256
75200 Uppsala

Kontorsadress
box 256

Jobbnummer
2632861

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Bioinformatiker

Prenumerera på jobb från Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och p